聚合酶保真性下降導(dǎo)致口蹄疫病毒減毒的研究
發(fā)布時(shí)間：2021-07-21 21:14
口蹄疫（Foot-and-Mouth Disease, FMD）是由口蹄疫病毒（Foot-and-Mouth Disease Virus, FMDV）引起的急性、熱性傳染病,主要侵害豬、牛、羊等偶蹄動(dòng)物。該病一旦爆發(fā)對出口貿(mào)易將造成嚴(yán)重的影響,給發(fā)病國家和地區(qū)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失。世界動(dòng)物衛(wèi)生組織（OIE）將其列為必須通報(bào)的動(dòng)物疫病。FMDV屬于微RNA病毒科（Picornaviridae）口蹄疫病毒屬（Aphthovirus）的成員,病毒基因組是由單股正鏈RNA組成。微RNA病毒基因組編碼的3D非結(jié)構(gòu)蛋白為RNA依賴的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase, RdRp）,是病毒復(fù)制酶系統(tǒng)的核心成分,與病毒基因編碼的一些其他蛋白以及宿主細(xì)胞因子一起構(gòu)成病毒的復(fù)制酶系統(tǒng),在RNA病毒的復(fù)制周期中起重要的作用。由于RdRp缺乏校正功能,使得RNA病毒具有高度異質(zhì)的準(zhǔn)種（quasispecies）特性。已有的研究表明,提高或降低RdRp的保真性可改變RNA病毒種群的遺傳多樣性和宿主適應(yīng)性,進(jìn)而可導(dǎo)致病毒對自然宿主的致病性減弱。因此,依據(jù)RdRp的復(fù)制保真性對病毒...
【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】：45 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
FMDV的復(fù)制周期（引自FieldsVirology.Edition,2007)
包括指手掌區(qū)（palm subdomain)、拇指區(qū)（thumb subdomain)和手指（finger subdomain)區(qū)三個(gè)亞結(jié)構(gòu)域（圖1.3),其中手掌區(qū)尤為保守（Ngetal.，2002;0’reillyetal.,1998)。手掌區(qū)亞結(jié)構(gòu)域位于RdRp的中心，其気基酸序列呈高度保守性，RdRp的活性位點(diǎn)多位于手掌區(qū)（O'reillyet al., 1998)。手掌區(qū)連著 5 個(gè)保守基序（motifA-E)(Ferrer-Orta et al., 2004; Van Dijk et al., 2004),這個(gè)區(qū)域的結(jié)構(gòu)包括一個(gè)3鏈反向平行p片層，側(cè)面與3個(gè)a螺旋相連，在己知的多聚核苦酸聚合酶中保守性最高。其中，Motif A—般包含一個(gè)P鏈-轉(zhuǎn)角-a螺旋和一個(gè)長的a螺旋結(jié)構(gòu)，p鏈末端的天冬氨酸殘基十分保守，可能參與核音酸轉(zhuǎn)移時(shí)與雙價(jià)離子的結(jié)合（Hansen et al., 1997;Steitz, 1998)。MotifA和MotifB被認(rèn)為參與核昔酸的識(shí)別和連接。MotifC包含高度保守的GDD活性位點(diǎn)
突變株的變異頻率為4.8/104nt，Y241F突變株的變異頻率為4.2/104nt，G36IS突變株的變異頻率為5.8/104nt (圖2.1)。從這些數(shù)據(jù)可以看出，與親本毒株相比，突變株D165E、K172R和G361S的保真性降低最為明顯，分別下降了 2.02、1.67和1.49倍。12-1^ 10- 木木T 7 q：8- i 6^5 *J I I I I I^ Z /■ ■/圖2.1低保真性FMDV RdRp突變株的產(chǎn)生Fig. 2.1 Generation of FMDV RdRp mutants with low-fidelity polymerase.己有研究顯示，復(fù)制保真性升高的口蹄疫病毒聚合酶突變株具有抵抗核苷類誘變劑的能力。相反，復(fù)制保真性降低的口蹄疫病毒聚合酶突變株對核苷類藥物更加敏感。為了分析復(fù)制保真性降低是否影響突變株對核苷類誘變劑藥物的敏感性，我們進(jìn)行了藥物抵抗試驗(yàn)，檢測突變株對不20
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]準(zhǔn)種的研究現(xiàn)狀[J]. 王均,許紅梅. 兒科藥學(xué)雜志. 2011(01)
[2]2003～2008年世界口蹄疫流行分布與分析[J]. 張懷宇,范運(yùn)峰,鄒興啟,荊文魁,劉彩霞,王伊琴. 檢驗(yàn)檢疫學(xué)刊. 2009(02)
[3]1990-2001年世界口蹄疫流行情況及其防治對策[J]. 袁文澤,蘇永生,李春陣,莊仁禮. 中國動(dòng)物檢疫. 2002(02)
碩士論文
[1]口蹄疫病毒Asia1/1/YZ/CHA/06的全基因組序列分析[D]. 王海偉.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
本文編號：3295788
【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】：45 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
FMDV的復(fù)制周期（引自FieldsVirology.Edition,2007)
包括指手掌區(qū)（palm subdomain)、拇指區(qū)（thumb subdomain)和手指（finger subdomain)區(qū)三個(gè)亞結(jié)構(gòu)域（圖1.3),其中手掌區(qū)尤為保守（Ngetal.，2002;0’reillyetal.,1998)。手掌區(qū)亞結(jié)構(gòu)域位于RdRp的中心，其気基酸序列呈高度保守性，RdRp的活性位點(diǎn)多位于手掌區(qū)（O'reillyet al., 1998)。手掌區(qū)連著 5 個(gè)保守基序（motifA-E)(Ferrer-Orta et al., 2004; Van Dijk et al., 2004),這個(gè)區(qū)域的結(jié)構(gòu)包括一個(gè)3鏈反向平行p片層，側(cè)面與3個(gè)a螺旋相連，在己知的多聚核苦酸聚合酶中保守性最高。其中，Motif A—般包含一個(gè)P鏈-轉(zhuǎn)角-a螺旋和一個(gè)長的a螺旋結(jié)構(gòu)，p鏈末端的天冬氨酸殘基十分保守，可能參與核音酸轉(zhuǎn)移時(shí)與雙價(jià)離子的結(jié)合（Hansen et al., 1997;Steitz, 1998)。MotifA和MotifB被認(rèn)為參與核昔酸的識(shí)別和連接。MotifC包含高度保守的GDD活性位點(diǎn)
突變株的變異頻率為4.8/104nt，Y241F突變株的變異頻率為4.2/104nt，G36IS突變株的變異頻率為5.8/104nt (圖2.1)。從這些數(shù)據(jù)可以看出，與親本毒株相比，突變株D165E、K172R和G361S的保真性降低最為明顯，分別下降了 2.02、1.67和1.49倍。12-1^ 10- 木木T 7 q：8- i 6^5 *J I I I I I^ Z /■ ■/圖2.1低保真性FMDV RdRp突變株的產(chǎn)生Fig. 2.1 Generation of FMDV RdRp mutants with low-fidelity polymerase.己有研究顯示，復(fù)制保真性升高的口蹄疫病毒聚合酶突變株具有抵抗核苷類誘變劑的能力。相反，復(fù)制保真性降低的口蹄疫病毒聚合酶突變株對核苷類藥物更加敏感。為了分析復(fù)制保真性降低是否影響突變株對核苷類誘變劑藥物的敏感性，我們進(jìn)行了藥物抵抗試驗(yàn)，檢測突變株對不20
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]準(zhǔn)種的研究現(xiàn)狀[J]. 王均,許紅梅. 兒科藥學(xué)雜志. 2011(01)
[2]2003～2008年世界口蹄疫流行分布與分析[J]. 張懷宇,范運(yùn)峰,鄒興啟,荊文魁,劉彩霞,王伊琴. 檢驗(yàn)檢疫學(xué)刊. 2009(02)
[3]1990-2001年世界口蹄疫流行情況及其防治對策[J]. 袁文澤,蘇永生,李春陣,莊仁禮. 中國動(dòng)物檢疫. 2002(02)
碩士論文
[1]口蹄疫病毒Asia1/1/YZ/CHA/06的全基因組序列分析[D]. 王海偉.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
本文編號：3295788
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