溫州水牛是國家級畜禽遺傳資源保護品種。與普通牛奶相比,水牛奶擁有較高的干物質含量,具有很大的潛在價值。因此發(fā)掘溫州水牛的候選功能基因和單核苷酸多態(tài)性分子標記,能夠為乳用溫州水牛的分子標記輔助育種及其乳產(chǎn)品的開發(fā)利用提供理論依據(jù)和技術支持。本試驗以平陽縣挺志溫州水牛乳業(yè)有限公司和湖北荊門市沙洋縣五里鎮(zhèn)奶水牛養(yǎng)殖示范基地內的溫州水牛為研究對象,選取泌乳前期、泌乳中期、泌乳后期各10頭溫州水牛,分析了不同泌乳時期外周血白細胞基因組表達譜變化情況,并對不同泌乳時期的差異表達基因進行了KEGG通路分析。選取JAK-STAT信號通路、TGF-β信號通路和Wnt信號通路作為研究對象,確定不同泌乳時期這些通路內的2倍上調或下調的IL-21R等共4個差異表達基因及其分子功能。并將IL-21R基因列為溫州水牛乳質性狀的候選功能基因,運用PCR-SSCP方法對134頭溫州水牛IL-21R基因的進行了SNPs檢測。同時對已報道的與中國荷斯坦奶牛乳質性狀相關的STAT1基因3’UTR,STAT4基因intron20和PRL基因exon4內存在的SNP在溫州水牛試驗群體內進行了檢測。結果如下：（1）溫州水牛不同泌... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：87 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
英文縮寫說明
第一章 文獻綜述
    1.1 溫州水牛及水牛奶產(chǎn)業(yè)的現(xiàn)狀概述
        1.1.1 溫州水牛品種資源簡介
        1.1.2 水牛奶的營養(yǎng)價值和發(fā)展?jié)摿?br>    1.2 水牛乳質性狀相關基因及其多態(tài)性的研究進展
        1.2.1 參與乳腺發(fā)育和泌乳調控的主效基因及其多態(tài)性研究進展
        1.2.2 參與乳脂合成及其相關代謝通路調控的主效基因及其多態(tài)性研究進展
        1.2.3 參與乳蛋白合成的主效基因及其多態(tài)性研究進展
        1.2.4 水牛乳質性狀相關基因研究現(xiàn)狀小結
    1.3 基因芯片技術研究進展
        1.3.1 基因芯片簡介
        1.3.2 基因芯片在畜牧業(yè)中的應用
        1.3.3 基因芯片技術小結
第二章 溫州水牛全基因組表達譜芯片檢測與數(shù)據(jù)分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗動物與采樣方法
        2.1.2 主要試驗設備及儀器
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 芯片的制備
        2.1.5. 芯片數(shù)據(jù)處理與分析方法
    2.2 芯片分析結果
        2.2.1 試驗樣品總RNA的檢測
        2.2.2 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細胞基因芯片檢測的原始灰度圖
        2.2.3 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細胞基因芯片檢測的質量判斷
        2.2.4 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細胞基因芯片檢測的結果
        2.2.5 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細胞基因芯片檢測的基因表達譜散點圖
        2.2.6 不同泌乳時期溫州水牛外周血白細胞基因芯片差異表達基因分析
    2.3 討論
        2.3.1 JAK-STAT信號通路及其差異表達基因的功能分析
        2.3.2 TGF-β信號通路及其差異表達基因的功能分析
        2.3.3 Wnt信號通路及其差異表達基因的功能分析
第三章 溫州水牛IL-21R基因的PCR-SSCP檢測及其遺傳多態(tài)性分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗動物及采樣方法
        3.1.2 血液DNA提取
        3.1.3 PCR擴增及檢測
        3.1.4 PCR-SSCP檢測
        3.1.5 PCR產(chǎn)物的純化回收及測序
        3.1.6 序列分析
        3.1.7 統(tǒng)計分析
    3.2 結果
        3.2.1 溫州水�；蚪MDNA提取結果
        3.2.2 溫州水牛IL-21R基因各引物擴增片段結果
        3.2.3 溫州水牛IL-21R基因各引物對擴增片段的PCR-SSCP檢測及測序
        3.2.4 IL-21R基因SNPs連鎖不平衡程度分析
        3.2.5 溫州水牛IL-21R基因SNPs的群體遺傳學分析
    3.3. 討論
        3.3.1 溫州水牛試驗群體IL-21R基因SNPs分析
        3.3.2 溫州水牛試驗群體IL-21R基因SNPs的遺傳多樣性分析
        3.3.3 小結
第四章 溫州水牛STAT1、STAT4、PRL基因PCR-SSCP分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 試驗材料
        4.1.2 血液DNA提取
        4.1.3 PCR擴增及檢測
        4.1.4 PCR-SSCP檢測
        4.1.5 PCR產(chǎn)物的純化回收及測序
        4.1.6 序列分析
        4.1.7 統(tǒng)計分析
    4.2 結果與分析
        4.2.1 溫州水牛STAT1基因引物對擴增片段的SSCP檢測及不同基因型的測序
        4.2.2 溫州水牛STAT4基因引物對擴增片段的SSCP檢測及不同基因型的測序
        4.2.3 溫州水牛PRL基因引物對擴增片段的SSCP檢測及不同基因型的測序
        4.2.4 溫州水牛STAT1、STAT4和PRL基因SNPs的群體遺傳學分析
        4.2.5 溫州水牛STAT1、STAT4和PRL基因擴增片段與荷斯坦奶牛序列的多重比對
    4.3 討論
        4.3.1 溫州水牛試驗群體STAT1、STAT4和PRL基因的SNPs分析
        4.3.2 溫州水牛試驗群體STAT1,STAT4,PRL基因SNPs的遺傳多態(tài)性分析
        4.3.3 溫州水牛試驗群體與荷斯坦奶牛群體STAT1、STAT4和PRL基因SNPs的差異
        4.3.4 小結
第五章 全文結論
參考文獻
附錄
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]對勾函數(shù)的圖像為何是雙曲線[J]. 段明貴,谷留明.  中學數(shù)學研究(華南師范大學版). 2020(03)
[2]TGF-β/Smads信號轉導與腫瘤的研究進展[J]. 趙林,鐘鳴.  實用臨床醫(yī)學. 2012(03)
[3]WNT信號通路的研究進展[J]. 趙靜,張春雷,房興堂,陳宏.  中國牛業(yè)科學. 2012(01)
[4]水牛乳理化及其生物學特性研究進展[J]. 姚春杰,李全陽,黃忠闖.  廣西輕工業(yè). 2011(05)
[5]水牛奶組分及其功能特性研究進展[J]. 李全陽,張憲省,劉小玲,姜元欣.  食品科學. 2011(03)
[6]STATs家族基因多態(tài)性在奶牛育種中的研究進展[J]. 褚敏,閻萍,裴杰,梁春年,郭憲,曾玉峰,包鵬甲.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2011(03)
[7]12個水牛群體催乳素基因第4外顯子遺傳特征分析[J]. 袁峰,苗永旺,李大林,湯守錕,許政,霍金龍,祁宏.  動物學研究. 2010(06)
[8]水牛PRL和PRLR部分外顯子基因的多態(tài)性[J]. 王錦,劉玉兵,李明鴻,劉慶友,石德順.  中國獸醫(yī)學報. 2010(11)
[9]水牛κ-酪蛋白外顯子4基因的克隆及序列分析[J]. 覃廣勝,楊炳壯,黃加祥,張秀芳,陳明棠,梁賢威,蔣和生.  畜牧與獸醫(yī). 2010(09)
[10]經(jīng)典Wnt/β-catenin信號通路中的雙向調控[J]. 劉洋,張晨光,周春燕.  北京大學學報(醫(yī)學版). 2010(02)

碩士論文
[1]水牛DGAT1基因的克隆及SNP分析[D]. 周軍.中國農(nóng)業(yè)大學 2005



本文編號：3233579