多種豬源性外來病液相芯片檢測(cè)方法的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-04-24 09:47
豬源性外來病能夠通過國(guó)際間貿(mào)易交流、野生動(dòng)物攜帶及昆蟲媒介傳入我國(guó),一旦傳入將會(huì)給我國(guó)養(yǎng)豬業(yè)帶來嚴(yán)重的損失,甚至是公共衛(wèi)生問題。本研究以非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)、尼帕病毒(Nipahvirus,NiV)、水皰性口 炎病毒(Vesicular stomatitis virus,VSV)、塞尼卡谷病毒(Seneca Valley virus,SW)以及口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)5 種豬源性病毒為研究對(duì)象,設(shè)計(jì)特異性擴(kuò)增引物,利用多重PCR擴(kuò)增得到帶有修飾的擴(kuò)增產(chǎn)物,然后與微球雜交、孵育,并驗(yàn)證方法的敏感性和特異性,以期構(gòu)建多種豬源性外來病的液相芯片檢測(cè)體系。主要研究結(jié)果如下:1.多種豬源性外來病單重PCR體系的建立建立的ASFV、NiV、VSV、SW和FMDV的單重PCR檢測(cè)方法,敏感性結(jié)果最低檢測(cè)量分別為 39.0copies/μ L、4.6copies/μ L、29.9copies/μ L、36.8copies/μ L和20.9copies/μ L;特異性結(jié)果為每種病毒的單重PCR...
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 五種豬病及病毒概況
1.1.1 非洲豬瘟
1.1.2 尼帕病毒病
1.1.3 水皰性口炎
1.1.4 塞尼卡谷病毒病
1.1.5 口蹄疫
1.2 液相芯片
1.2.1 液相芯片原理
1.2.2 液相芯片技術(shù)的特點(diǎn)
1.3 液相芯片技術(shù)的應(yīng)用
1.3.1 豬病方面應(yīng)用
1.3.2 禽病方面應(yīng)用
1.3.3 反芻動(dòng)物疫病方面
1.3.4 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物疫病方面
1.3.5 人獸共患病方面
1.4 研究目的與意義
2 多種豬源性外來病病毒單一PCR檢測(cè)方法的初步建立
2.1 實(shí)驗(yàn)材料及設(shè)備
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
2.1.3 病毒和毒株
2.1.4 培養(yǎng)基及相關(guān)的制備
2.1.5 引物的設(shè)計(jì)、合成與篩選
2.1.6 疫苗核酸的提取及反轉(zhuǎn)錄
2.2 方法
2.2.1 構(gòu)建質(zhì)粒
2.2.1.1 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
2.2.1.2 重組質(zhì)粒的提取
2.2.1.3 重組質(zhì)粒濃度的測(cè)定及拷貝數(shù)換算
2.2.2 引物的篩選及單重PCR體系的建立
2.2.3 單重PCR反應(yīng)敏感性實(shí)驗(yàn)
2.2.4 單重PCR反應(yīng)特異性實(shí)驗(yàn)
2.3 結(jié)果
2.3.1 拷貝數(shù)計(jì)算
2.3.2 引物的初步篩選
2.3.3 單重PCR反應(yīng)靈敏性結(jié)果
2.3.4 單重PCR反應(yīng)特異性結(jié)果
2.4 小結(jié)與討論
3 多種豬源性外來病病毒多重PCR檢測(cè)方法的建立
3.1 多重PCR檢測(cè)體系的建立
3.1.1 多重PCR退火溫度的優(yōu)化
3.1.2 多重PCR方法敏感性實(shí)驗(yàn)
3.1.3 多重PCR方法特異性實(shí)驗(yàn)
3.1.4 多重PCR方法重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
3.2 結(jié)果
3.2.1 多重PCR退火溫度的優(yōu)化
3.2.2 多重PCR方法的靈敏性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.3 多重PCR方法的特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.4 多重PCR方法的穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3 小結(jié)與討論
4 多種豬源性外來病液相芯片檢測(cè)方法的建立
4.1 實(shí)驗(yàn)材料及設(shè)備
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
4.1.3 病毒與毒株
4.1.4 TAG的選擇與修飾引物合成
4.2 方法
4.2.1 微球雜交緩沖液的制備及體系建立
4.2.1.1 微球工作液的制備
4.2.1.2 SAPE報(bào)告液的制備
4.2.1.3 微球雜交體系的建立
TM液相芯片檢測(cè)平臺(tái)初始化"> 4.2.2 Luminex 200TM液相芯片檢測(cè)平臺(tái)初始化
4.2.3 PCR產(chǎn)物與微球雜交
4.2.4 液相芯片雜交結(jié)果的判定
4.2.5 液相芯片雜交條件的優(yōu)化
4.2.5.1 液相芯片雜交時(shí)間的優(yōu)化
4.2.5.2 液相芯片雜交溫度的優(yōu)化
4.2.6 液相芯片檢測(cè)方法敏感性實(shí)驗(yàn)
4.2.7 液相芯片檢測(cè)方法特異性實(shí)驗(yàn)
4.2.8 液相芯片檢測(cè)方法穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
4.2.9 臨床樣品檢測(cè)
4.3 結(jié)果
4.3.1 液相芯片雜交時(shí)間優(yōu)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.2 液相芯片雜交溫度優(yōu)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.3 液相芯片敏感性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.4 液相芯片特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.5 液相芯片穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.6 臨床樣品檢測(cè)
4.4 小結(jié)與討論
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中西藥結(jié)合防治牦牛水皰性口炎[J]. 措加卓瑪. 畜牧業(yè)環(huán)境. 2020(01)
[2]牛常見傳染病癥狀及防控措施[J]. 弟保. 畜牧獸醫(yī)科學(xué)(電子版). 2019(23)
[3]兔水皰性口炎的診治[J]. 向承西. 當(dāng)代畜禽養(yǎng)殖業(yè). 2019(09)
[4]非洲豬瘟流行現(xiàn)狀及防控[J]. 李金明. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2019(17)
[5]尼帕病毒全球流行態(tài)勢(shì)解析[J]. 金寧一,許汪,杜壽文,李昌,李體遠(yuǎn),吳詩(shī)品. 新發(fā)傳染病電子雜志. 2019(03)
[6]家畜水皰性口炎的發(fā)生、診斷和防控措施[J]. 董敏. 飼料博覽. 2019(07)
[7]1998-2018年全球尼帕病毒感染流行特征及危險(xiǎn)因素分析[J]. 辛化雷,薛愛麗,梁紀(jì)偉,邱波,董禮艷,潘蓓,賈靜,韓雅琳,胡曉雯,張婧菲,李中杰,姜法春. 疾病監(jiān)測(cè). 2019(01)
[8]6種人獸共患病病原核酸液相芯片檢測(cè)體系的建立[J]. 王艷,沈家紅,蔣蔚,張磊萍,張強(qiáng),林穎崢,熊煒,李樹清. 中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2018(12)
[9]高通量核酸液相芯片檢測(cè)法對(duì)H5、H9亞型禽流感病毒及新城疫病毒的檢測(cè)[J]. 張婷,謝晉雄,詹愛軍,吳雯娟,黃彬庚,吳紹精,陳勇. 中國(guó)家禽. 2018(16)
[10]液相芯片技術(shù)在檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)和生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J]. 許友強(qiáng),陳貴雪,李博,張巖,周婷婷,李雨艷. 大醫(yī)生. 2018(06)
碩士論文
[1]Luminex液相芯片同時(shí)檢測(cè)小鼠3種病毒方法的建立[D]. 劉春梅.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[2]基于IPaH 1基因液相芯片技術(shù)快速檢測(cè)志賀氏菌的研究[D]. 文雪.吉林大學(xué) 2013
[3]AIV,NDV,IBV和ILTV液相檢測(cè)芯片方法的建立[D]. 張曉娜.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3157145
【文章來源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 五種豬病及病毒概況
1.1.1 非洲豬瘟
1.1.2 尼帕病毒病
1.1.3 水皰性口炎
1.1.4 塞尼卡谷病毒病
1.1.5 口蹄疫
1.2 液相芯片
1.2.1 液相芯片原理
1.2.2 液相芯片技術(shù)的特點(diǎn)
1.3 液相芯片技術(shù)的應(yīng)用
1.3.1 豬病方面應(yīng)用
1.3.2 禽病方面應(yīng)用
1.3.3 反芻動(dòng)物疫病方面
1.3.4 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物疫病方面
1.3.5 人獸共患病方面
1.4 研究目的與意義
2 多種豬源性外來病病毒單一PCR檢測(cè)方法的初步建立
2.1 實(shí)驗(yàn)材料及設(shè)備
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
2.1.3 病毒和毒株
2.1.4 培養(yǎng)基及相關(guān)的制備
2.1.5 引物的設(shè)計(jì)、合成與篩選
2.1.6 疫苗核酸的提取及反轉(zhuǎn)錄
2.2 方法
2.2.1 構(gòu)建質(zhì)粒
2.2.1.1 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
2.2.1.2 重組質(zhì)粒的提取
2.2.1.3 重組質(zhì)粒濃度的測(cè)定及拷貝數(shù)換算
2.2.2 引物的篩選及單重PCR體系的建立
2.2.3 單重PCR反應(yīng)敏感性實(shí)驗(yàn)
2.2.4 單重PCR反應(yīng)特異性實(shí)驗(yàn)
2.3 結(jié)果
2.3.1 拷貝數(shù)計(jì)算
2.3.2 引物的初步篩選
2.3.3 單重PCR反應(yīng)靈敏性結(jié)果
2.3.4 單重PCR反應(yīng)特異性結(jié)果
2.4 小結(jié)與討論
3 多種豬源性外來病病毒多重PCR檢測(cè)方法的建立
3.1 多重PCR檢測(cè)體系的建立
3.1.1 多重PCR退火溫度的優(yōu)化
3.1.2 多重PCR方法敏感性實(shí)驗(yàn)
3.1.3 多重PCR方法特異性實(shí)驗(yàn)
3.1.4 多重PCR方法重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
3.2 結(jié)果
3.2.1 多重PCR退火溫度的優(yōu)化
3.2.2 多重PCR方法的靈敏性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.3 多重PCR方法的特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.4 多重PCR方法的穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3 小結(jié)與討論
4 多種豬源性外來病液相芯片檢測(cè)方法的建立
4.1 實(shí)驗(yàn)材料及設(shè)備
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
4.1.3 病毒與毒株
4.1.4 TAG的選擇與修飾引物合成
4.2 方法
4.2.1 微球雜交緩沖液的制備及體系建立
4.2.1.1 微球工作液的制備
4.2.1.2 SAPE報(bào)告液的制備
4.2.1.3 微球雜交體系的建立
TM液相芯片檢測(cè)平臺(tái)初始化"> 4.2.2 Luminex 200TM液相芯片檢測(cè)平臺(tái)初始化
4.2.3 PCR產(chǎn)物與微球雜交
4.2.4 液相芯片雜交結(jié)果的判定
4.2.5 液相芯片雜交條件的優(yōu)化
4.2.5.1 液相芯片雜交時(shí)間的優(yōu)化
4.2.5.2 液相芯片雜交溫度的優(yōu)化
4.2.6 液相芯片檢測(cè)方法敏感性實(shí)驗(yàn)
4.2.7 液相芯片檢測(cè)方法特異性實(shí)驗(yàn)
4.2.8 液相芯片檢測(cè)方法穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
4.2.9 臨床樣品檢測(cè)
4.3 結(jié)果
4.3.1 液相芯片雜交時(shí)間優(yōu)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.2 液相芯片雜交溫度優(yōu)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.3 液相芯片敏感性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.4 液相芯片特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.5 液相芯片穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.6 臨床樣品檢測(cè)
4.4 小結(jié)與討論
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中西藥結(jié)合防治牦牛水皰性口炎[J]. 措加卓瑪. 畜牧業(yè)環(huán)境. 2020(01)
[2]牛常見傳染病癥狀及防控措施[J]. 弟保. 畜牧獸醫(yī)科學(xué)(電子版). 2019(23)
[3]兔水皰性口炎的診治[J]. 向承西. 當(dāng)代畜禽養(yǎng)殖業(yè). 2019(09)
[4]非洲豬瘟流行現(xiàn)狀及防控[J]. 李金明. 獸醫(yī)導(dǎo)刊. 2019(17)
[5]尼帕病毒全球流行態(tài)勢(shì)解析[J]. 金寧一,許汪,杜壽文,李昌,李體遠(yuǎn),吳詩(shī)品. 新發(fā)傳染病電子雜志. 2019(03)
[6]家畜水皰性口炎的發(fā)生、診斷和防控措施[J]. 董敏. 飼料博覽. 2019(07)
[7]1998-2018年全球尼帕病毒感染流行特征及危險(xiǎn)因素分析[J]. 辛化雷,薛愛麗,梁紀(jì)偉,邱波,董禮艷,潘蓓,賈靜,韓雅琳,胡曉雯,張婧菲,李中杰,姜法春. 疾病監(jiān)測(cè). 2019(01)
[8]6種人獸共患病病原核酸液相芯片檢測(cè)體系的建立[J]. 王艷,沈家紅,蔣蔚,張磊萍,張強(qiáng),林穎崢,熊煒,李樹清. 中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2018(12)
[9]高通量核酸液相芯片檢測(cè)法對(duì)H5、H9亞型禽流感病毒及新城疫病毒的檢測(cè)[J]. 張婷,謝晉雄,詹愛軍,吳雯娟,黃彬庚,吳紹精,陳勇. 中國(guó)家禽. 2018(16)
[10]液相芯片技術(shù)在檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)和生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[J]. 許友強(qiáng),陳貴雪,李博,張巖,周婷婷,李雨艷. 大醫(yī)生. 2018(06)
碩士論文
[1]Luminex液相芯片同時(shí)檢測(cè)小鼠3種病毒方法的建立[D]. 劉春梅.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[2]基于IPaH 1基因液相芯片技術(shù)快速檢測(cè)志賀氏菌的研究[D]. 文雪.吉林大學(xué) 2013
[3]AIV,NDV,IBV和ILTV液相檢測(cè)芯片方法的建立[D]. 張曉娜.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3157145
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