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梅山豬與杜洛克豬卵泡中circ0010513的鑒定及分析

發(fā)布時間:2021-03-18 12:40
  試驗(yàn)旨在探索circRNA在卵泡中可能發(fā)揮的潛在作用,為了解circRNA調(diào)控卵泡發(fā)育的機(jī)制奠定基礎(chǔ)。采用RNA-Seq和生物信息學(xué)方法鑒定梅山豬與杜洛克豬卵泡中circRNA的表達(dá)量,運(yùn)用miRanda、RNAhybrid和targetscan軟件,對差異性表達(dá)的circRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測;對靶基因進(jìn)行GO和KEGG富集分析,并運(yùn)用qRT-PCR分析梅山豬和杜洛克豬circ0010513在各時期卵泡及各組織的表達(dá)量。結(jié)果表明:circ0010513在梅山豬M2卵泡(M2卵泡直徑5.1~7.0 mm)中的表達(dá)量極顯著高于杜洛克豬(P<0.01),而梅山豬M1(M1卵泡直徑3.1~5.0 mm)卵泡中的表達(dá)量極顯著高于杜洛克豬(P<0.01),該結(jié)果與高通量測序結(jié)果一致。circ0010513在心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟、下丘腦、垂體、卵巢、輸卵管、子宮和子宮角中均有不同程度的表達(dá),其潛在靶基因DUSP5、GADD45G、LAMB3等通過參與繁殖相關(guān)的信號通路影響豬的卵泡發(fā)育,提示其可能通過對靶基因的調(diào)控作用間接參與卵泡發(fā)育過程。 

【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(12)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

梅山豬與杜洛克豬卵泡中circ0010513的鑒定及分析


circ0010513 PCR產(chǎn)物圖

序列,產(chǎn)物,首尾,鏈接


circ0010513首尾鏈接序列測序峰圖

梅山豬與杜洛克豬卵泡中circ0010513的鑒定及分析


circ0010513在杜洛克豬不同組織中相對表達(dá)量

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)狀RNA的研究進(jìn)展[J]. 馬翔,任秀智,劉軍龍,魯艷芹,韓金祥.  中國生物制品學(xué)雜志. 2016(08)

博士論文
[1]二花臉豬卵泡形成和早期發(fā)育的特性及其相關(guān)通路的研究[D]. 丁威.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010

碩士論文
[1]Gadd45g調(diào)控胚胎干細(xì)胞自我更新的作用研究[D]. 李薇.安徽大學(xué) 2016



本文編號:3088341

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