為研究山羊痘病毒（goatpox virus, GTPV）G9、A16蛋白的功能,用PCR方法從山羊痘病毒弱毒疫苗毒株GTPV AV41中擴(kuò)增出編碼G9、A16蛋白的基因進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)方法對(duì)目的基因序列進(jìn)行分析。結(jié)果顯示:G9蛋白有34個(gè)磷酸化位點(diǎn),17個(gè)抗原表位位點(diǎn);二級(jí)結(jié)構(gòu)中以α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲為主,分別占36.61%和42.86%,有9個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,蛋白序列末尾有跨膜區(qū)域,包含15個(gè)半胱氨酸殘基位點(diǎn);三級(jí)結(jié)構(gòu)中具有細(xì)胞凋亡和跨膜功能的結(jié)構(gòu)。A16蛋白有36個(gè)磷酸化位點(diǎn),19個(gè)抗原表位位點(diǎn);二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲為主,分別占25.46%和48.28%,有10個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,蛋白序列末尾有跨膜區(qū)域,包含21個(gè)半胱氨酸殘基位點(diǎn);三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示可以形成膜蛋白。上述研究結(jié)果為進(jìn)一步探究GTPV的G9、A16蛋白功能提供了參考。 

【文章來(lái)源】：畜牧與獸醫(yī). 2020年10期 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【部分圖文】：

GTPV AV41的A16、G9基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

使用MEGA軟件Neighbor Joining方法將所篩選的不同物種的蛋白序列構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),結(jié)果顯示GTPV AV41與GTPV Pellor的親緣關(guān)系最近,與SHPV 17077-99次之,與VACV IHD-J的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),GTPV AV41與VACV IHD-J分別在2個(gè)不同的大分支上(圖3)。圖3 G9(A)、A16(B)蛋白序列進(jìn)化樹(shù)

G9(A)、A16(B)蛋白序列進(jìn)化樹(shù)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于全基因組結(jié)構(gòu)域信息的進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建[J]. 陳治偉,李曉琴.  生物信息學(xué). 2012(01)
[2]人感染山羊痘五例[J]. 洪艷,謝忠文,施恒豫.  中華傳染病雜志. 2005(02)



本文編號(hào)：2957877