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隱孢子蟲和藍氏賈第蟲在青海省牦牛中的流行情況及其種群結(jié)構(gòu)研究

發(fā)布時間:2020-04-24 21:03
【摘要】:隱孢子蟲(Cryptosporidium)和藍氏賈第蟲(Giardia lamblia)是兩種重要的機會性人獸共患的腸道原蟲,宿主范圍廣泛,可在全世界范圍內(nèi)流行,對人類健康造成威脅,也對動物的生產(chǎn)性能產(chǎn)生了不良影響。牦牛是青海省的優(yōu)勢種家畜,掌握該省牦牛Cryptosporidium和G.lamblia的流行情況,明確這兩種原蟲在牦牛的種群結(jié)構(gòu),可為牦牛隱孢子蟲病和賈第蟲病的防控提供參考數(shù)據(jù)。利用套式PCR技術(shù)對青海省牦牛Cryptosporidium和G.lamblia的流行情況進行調(diào)查,并對其種群結(jié)構(gòu)進行分析,獲得以下結(jié)果:1.對從青海省7個地區(qū)采集的1027份牦牛糞便樣品進行Cryptosporidium 18S rRNA和HSP70基因的PCR擴增分析發(fā)現(xiàn),牦牛Cryptosporidium總感染率為2.53%(26/1027),7個地區(qū)間及各季節(jié)間感染率總體差異均不顯著。6月齡及其以內(nèi)的犢牦牛和6月齡以上牦牛的Cryptosporidium感染率分別為6.25%和2.35%,兩者之間差異不顯著。種系發(fā)育分析結(jié)果表明,青海省存在瑞氏隱孢子蟲(C.ryanae)和牛隱孢子蟲(C.bovis)的感染,其中,C.ryanae是青海省感染牦牛的Cryptosporidium優(yōu)勢蟲種。2.對從青海省7個地區(qū)采集的1027份牦牛糞便樣品基于TPI基因進行藍氏賈第蟲(G.lamblia)感染情況的檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)總感染率為2.04%(21/1207),7個地區(qū)間及各季節(jié)間感染率差異均不顯著,但6月齡及其以內(nèi)的犢牦牛和6月齡以上的牦牛G.lamblia感染率之間差異顯著,分別為8.33%和1.73%。序列比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)有G.lamblia集聚體E(18/21)和集聚體A(3/21)存在。發(fā)現(xiàn)了1個G.lamblia集聚體A亞型A1和4個G.lamblia集聚體E亞型(E1~E4),其中E2~E4為首次鑒定的集聚體亞型。基于TPI、BG和GDH 3個基因的多位點序列分型結(jié)果顯示,共有3份G.lamblia分離株在3個位點均擴增成功,構(gòu)成3個不同的MLGs。其中2個集聚體E的MLGs在玉樹州的牦牛發(fā)現(xiàn),1個集聚體A的MLG在西寧市的牦牛中發(fā)現(xiàn)。
【圖文】:

地理分布圖,牦牛,青海省,地理分布


注: 為采樣地點Note: Sampling site圖 2-1 青海省牦牛糞便樣品來源的地理分布Fig. 2-1 Geographical origins of fecal samples from yaks in Qinghai province2.1.1.2 主要儀器設(shè)備電熱鼓風干燥箱(上海一恒科學儀器有限公司)、微型水平電泳槽(北京六一生物科技有限公司)、DYY-12 型穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀(北京市六一儀器廠)、全自動凝膠成像分析系統(tǒng)(北京賽智創(chuàng)業(yè)科技有限公司)、1-14 小型臺式離心機(SIGMA,德國)、FA135s 電子天平(上海?惦娮觾x器廠)、手掌離心機(Scilogex,,美國)、高速離心機(安徽中科中佳科學儀器有限公司)、渦旋混合器(海門市其林貝爾儀器制造有限公司)、電數(shù)顯恒溫水浴鍋(國華電器有限公司公司)、單道移液器(大龍興創(chuàng)實驗儀器有限公司)、PCR 擴增儀(杭州博日科技有限公司)、潔凈工作臺(蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司)、IMS 系列全自動雪花制冰機(雪科電器有限公司)。2.1.1.3 主要試劑及溶液

核苷酸序列,隱孢子蟲,牦牛,PCR擴增


視為差異顯著,當 P≥0.成功測序的陽性樣本核苷酸序列進行l(wèi) Alignment Search Tool(BLAST)在pson et al. 1997)。利用 MEGA 7.0.26bor-joining),自展值為 1000,Kimurayi 和 C. parvum 為參考序列,GenBankAB089290。 以努氏內(nèi)阿米巴(Enta外群。um PCR 擴增結(jié)果樣品中,有 26 份樣品成功擴增出A 基因目的片段(圖 2-2)。在 26 份陽的目的片段(圖 2-3)。
【學位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S858.23

【參考文獻】

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