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中國(guó)首次檢出的H12N2亞型禽流感病毒的基因組特征和系統(tǒng)進(jìn)化分析

發(fā)布時(shí)間:2018-07-14 20:31
【摘要】:本實(shí)驗(yàn)室自2011年開(kāi)始在鄱陽(yáng)湖周邊地區(qū)開(kāi)展家禽養(yǎng)殖戶(hù)和活禽市場(chǎng)環(huán)境中的禽流感病毒監(jiān)測(cè),在2011~2016年的監(jiān)測(cè)過(guò)程中,通過(guò)病毒分離和深度測(cè)序,發(fā)現(xiàn)了一株H12N2亞型禽流感病毒,這是在中國(guó)首次檢出該亞型病毒。該標(biāo)本來(lái)自一份鴨糞便標(biāo)本,采集自江西省余干縣的一個(gè)家禽養(yǎng)殖場(chǎng)。病毒的8個(gè)片段分別與來(lái)自鴨或者野禽中的病毒最為接近。對(duì)病毒的全基因組系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,該病毒屬于歐亞譜系。HA蛋白裂解位點(diǎn)序列為PQAQDR/GLF,屬于低致病性禽流感病毒,受體結(jié)合位點(diǎn)分析表明病毒對(duì)α-2,3唾液酸受體親和力較好。病毒NA的莖部沒(méi)有氨基酸的缺失,但是PB1蛋白的L13P和L473V可以增強(qiáng)病毒聚合酶在哺乳動(dòng)物中復(fù)制的能力和病毒對(duì)于哺乳動(dòng)物的毒性。M1蛋白N30D突變和T215A突變提示會(huì)增加流感病毒對(duì)于哺乳動(dòng)物的致病性。本次從家禽養(yǎng)殖場(chǎng)環(huán)境中檢出野鳥(niǎo)相關(guān)的禽流感病毒進(jìn)一步說(shuō)明了在該地區(qū)進(jìn)行禽流感病毒監(jiān)測(cè)的重要性,以及在家禽-野鳥(niǎo)界面加強(qiáng)生物安全措施的必要性,需要持續(xù)進(jìn)行監(jiān)測(cè),為禽流感病毒的暴發(fā)提供預(yù)警,為人感染禽流感病毒提供風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的依據(jù)。
[Abstract]:Our laboratory began to monitor avian influenza virus in poultry farmers and live poultry market environment in the area around Poyang Lake in 2011. During the surveillance process from 2011 to 2016, a strain of H12N2 subtype avian influenza virus was found through virus isolation and deep sequencing. This is the first time the subtype of the virus has been detected in China. The specimen was collected from a poultry farm in Yugan County, Jiangxi Province. The eight segments of the virus were most closely related to those from ducks or wild birds. The whole genome phylogenetic analysis showed that the virus belonged to Eurasian lineage. The cleavage site sequence of HA protein was PQAQDR / GLF, and it belonged to low pathogenic avian influenza virus. The receptor binding site analysis showed that the virus had good affinity to 偽 -2H3 sialic acid receptor. There is no amino acid deficiency in the stem of the virus na. However, L13P and L473V of PB1 protein can enhance the ability of viral polymerase replication in mammals and the virulence of virulence. M1 protein N30D mutation and T215A mutation may increase the pathogenicity of influenza virus to mammals. The detection of wild bird related avian influenza viruses from the poultry farm environment further demonstrates the importance of avian influenza virus surveillance in the region and the need to strengthen biosafety measures at the poultry / wild bird interface. Continuous surveillance is needed to provide early warning for outbreaks of avian influenza viruses and to provide a basis for risk assessment for human infection with avian influenza viruses.
【作者單位】: 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)醫(yī)學(xué)病毒和病毒病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;江西省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(項(xiàng)目號(hào):2016YFD0500208),題目:人感染動(dòng)物流感病毒(項(xiàng)目號(hào):2016YFC1200200),題目:重要新發(fā)突發(fā)病原體發(fā)生與播散機(jī)制研究~~
【分類(lèi)號(hào)】:S852.65

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