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中國(guó)西門塔爾牛PPP1CB和ACSL4基因多態(tài)性及與屠宰性狀的相關(guān)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-04-27 00:36

  本文選題:西門塔爾牛 + PPP1CB ; 參考:《吉林大學(xué)》2015年碩士論文


【摘要】:西門塔爾牛廣泛分布于中國(guó)各地,其肉質(zhì)細(xì)嫩,大理石花紋明顯,口感好,以其優(yōu)質(zhì)的乳肉兼用性,良好的生產(chǎn)性狀已經(jīng)發(fā)展成為大型乳肉兼用新品種。通過測(cè)定共獲得了259頭育肥的西門塔爾牛屠宰性狀的相關(guān)數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)為后期利用基因工程方法篩選功能基因以及全基因組關(guān)聯(lián),建立基因聚合育種方法和分子標(biāo)記輔助選擇等提供基礎(chǔ),更為中國(guó)西門塔爾牛的早期選種選育和遺傳改良提供理論依據(jù)。 PPP1CB基因編碼的蛋白質(zhì)是蛋白磷酸酶1催化亞基之一,蛋白磷酸酶1是主要的絲-蘇氨酸蛋白磷酸酶,在細(xì)胞中能夠普遍表達(dá),蛋白激酶和蛋白磷酸酶協(xié)同作用能夠使蛋白質(zhì)磷酸化與去磷酸化,調(diào)節(jié)眾多生理活動(dòng):如細(xì)胞內(nèi)糖代謝、細(xì)胞周期、肌肉收縮等。哺乳動(dòng)物長(zhǎng)鏈脂酰CoA合成酶(ACSL)能夠使脂肪酸活化,是哺乳動(dòng)物體利用脂肪酸的第一步,對(duì)于磷脂合成,脂肪酸分解,和細(xì)胞膜重構(gòu)等過程是極其重要的。PPP1CB基因和ACSL4基因多態(tài)性與牛屠宰性狀相關(guān)性的研究國(guó)內(nèi)外鮮有報(bào)道,作為在本課題組前期基因芯片分析結(jié)果中的差異表達(dá)基因,本研究將PPP1CB基因和ACSL4基因作為西門塔爾牛屠宰性狀的候選基因。 本研究的目的在于尋找PPP1CB和ACSL4基因的多態(tài)性位點(diǎn)與西門塔爾牛屠宰性狀之間的相關(guān)性,以259頭中國(guó)西門塔爾牛草原型為研究對(duì)象,并收集其生產(chǎn)數(shù)據(jù)及屠宰數(shù)據(jù),利用PCR-RFLP技術(shù)檢測(cè)134頭中國(guó)西門塔爾牛PPP1CB基因和259頭西門塔爾牛ACSL4基因上的SNP位點(diǎn),并利用統(tǒng)計(jì)學(xué)分析的方法,對(duì)PPP1CB和ACSL4基因的多態(tài)性位點(diǎn)與中國(guó)西門塔爾牛屠宰性狀之間的相關(guān)性進(jìn)行分析。 結(jié)果顯示,西門塔爾牛PPP1CB基因的內(nèi)含子1第14434個(gè)堿基處存在C→T的單堿基突變,PPP1CB基因內(nèi)含子1不同基因型與西門塔爾牛屠宰性狀的屠宰率存在顯著相關(guān)性,,CT型的屠宰率顯著高于TT型(P0.05),其他性狀在不同基因型間的差異不顯著。ACSL4基因的內(nèi)含子10第2327個(gè)堿基處存在G→C的單堿基突變,ACSL4基因內(nèi)含子10的不同基因型與西門塔爾牛屠宰性狀無顯著相關(guān)性。
[Abstract]:Simmental cattle are widely distributed in all parts of China, its meat quality is tender, marbling pattern is obvious, taste is good, because of its high quality milk and meat use, good production character has developed into a large new variety for both milk and meat. Data on slaughter traits of 259 fattening Simmental cattle were obtained. These data were used to screen functional genes and the whole genome association by genetic engineering method. The establishment of gene aggregation breeding methods and molecular marker-assisted selection provides a theoretical basis for early selection and genetic improvement of Simmental cattle in China. The protein encoded by PPP1CB gene is one of the catalytic subunits of protein phosphatase 1. Protein phosphatase 1 is the main serine threonine protein phosphatase, which can be widely expressed in cells. The synergistic action of protein kinase and protein phosphatase can make protein phosphorylation and dephosphorylation regulate many physiological activities such as intracellular glucose metabolism cell cycle muscle contraction and so on. Mammal long chain lipoyl CoA synthase (CoA) can activate fatty acids, which is the first step in the utilization of fatty acids in mammals. For phospholipid synthesis, fatty acids are decomposed. The correlation between the polymorphism of the .PPP1CB gene and the ACSL4 gene and the slaughter traits of cattle was rarely reported at home and abroad, which was used as the differentially expressed gene in the results of gene chip analysis in the early stage of our research group. In this study, PPP1CB gene and ACSL4 gene were used as candidate genes for slaughter traits of Simmental cattle. The purpose of this study was to find out the association between the polymorphism of PPP1CB and ACSL4 gene and the slaughter traits of Simmental cattle. 259 Chinese Simmental cattle were selected as the study subjects, and their production data and slaughter data were collected. The SNP loci of PPP1CB gene and ACSL4 gene in 134 Chinese Simmental cattle and 259 Simmental cattle were detected by PCR-RFLP technique. The relationship between the polymorphism of PPP1CB and ACSL4 genes and slaughter traits of Simmental cattle in China was analyzed. The results show that In Simmental cattle, there is a significant correlation between different genotypes of intron 1 of PPP1CB gene and slaughter rate of slaughtering traits of Simmental cattle. There is a significant correlation between different genotypes of intron 1 and the slaughter rate of CT-type in Simmental cattle. ACSL4 gene had no significant difference among different genotypes. At 2327 base of intron 10 of ACSL4 gene, there were different genotypes of single base mutation ACSL4 gene and slaughterability of Simmental cattle. There was no significant correlation.
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S823

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本文編號(hào):1808416

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