本文選題：禽流感病毒　切入點(diǎn)：HN　出處：《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了研究H9N2亞型禽流感病毒的基因組變異情況,試驗(yàn)以一株2015年在河南省分離的H9N2亞型Ck/HN/12/15為研究對象,用RT-PCR方法擴(kuò)增病毒基因組的8個(gè)基因片段并進(jìn)行克隆和測序,將測序結(jié)果與Gen Bank公布的H9N2參考毒株序列進(jìn)行比對分析,繪制各基因片段的進(jìn)化樹。結(jié)果表明:分離株的PB1、PA、NP、NS基因與1998年中國上海雞源毒株Ck/SH/F/98(H9N2)歸于同一進(jìn)化分支,核苷酸序列同源性分別為93.57%、90.48%、87.66%和86.64%。分離株的HA、NA基因與1997年中國香港鴨源毒株Dk/HK/Y280/97(H9N2)屬同一個(gè)進(jìn)化分支,核苷酸序列同源性分別為87.62%和85.32%。該毒株裂解位點(diǎn)處的序列是PSRSSR,符合低致病性禽流感病毒的分子特點(diǎn)。該株HA基因的226位(對應(yīng)H3亞型位置)氨基酸為Leu,更易與哺乳動(dòng)物唾液酸受體結(jié)合。說明應(yīng)該做好對此類H9N2亞型禽流感病毒免疫防控工作,避免在人和禽類之間傳播。
[Abstract]:In order to study the genomic variation of H9N2 subtype avian influenza virus, a H9N2 subtype Ck/HN/12/15 isolated in Henan province in 2015 was used to amplify, clone and sequence eight gene fragments of the virus genome by RT-PCR. The results of sequencing were compared with the sequence of H9N2 reference strain published by Gen Bank, and the phylogenetic tree of each gene fragment was plotted. The results showed that the PB1PPANPNS gene of the isolated strain belonged to the same evolutionary branch as the 1998 Shanghai chicken strain CK / SHR / F / 98 H9N2. The homology of nucleotide sequence was 90.48% and 86.64%, respectively. The HANNA gene of the isolated strain belonged to the same evolutionary branch as DkP / HKR / Y280/ 97H9N2 strain from Hong Kong, China, in 1997. The nucleotide sequence homology was 87.62% and 85.322.The nucleotide sequence at the cleavage site of the strain was PSRSSRS, which was in line with the molecular characteristics of the low pathogenic avian influenza virus. The amino acid of the HA gene of the strain was Leu (corresponding to H3 subtype). The sialic acid receptor binding in milk animals suggests that we should do a good job in the prevention and control of this H9N2 subtype avian influenza virus. Avoid spreading between people and birds.
【作者單位】： 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;
【基金】：2016年“攀登計(jì)劃”廣東大學(xué)生科技創(chuàng)新培育專項(xiàng)基金項(xiàng)目(pdjh2016a0073)
【分類號(hào)】：S852.65

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