我國利什曼原蟲伽師株有毒力和無毒力前鞭毛體定量蛋白質組學比較分析
發(fā)布時間:2021-03-07 10:36
目的應用定量蛋白質組學方法比較我國利什曼原蟲伽師株有毒力和無毒力前鞭毛體蛋白表達的差異。方法將分離于我國新疆伽師縣黑熱病患者嬰兒利什曼原蟲JS5有毒力株前鞭毛體和無毒力株前鞭毛體經(jīng)酶解后進行液相色譜串聯(lián)質譜(Liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)的非標記(Label-free)定量分析,利用MaxQuant軟件查庫,進行Label-free非標定量(LFQ)分析;每個樣品重復3次質譜分析,只有1次有LFQ值的蛋白舍棄。結果本研究共鑒定蛋白3 994個,有毒力和無毒力株間差異蛋白為298個(差異倍數(shù)>1.2或差異倍數(shù)<0.83,P<0.05),其中利什曼原蟲有毒力株前鞭毛體特有表達蛋白15個,無毒力株前鞭毛體特有表達蛋白23個,二者間表達豐度有顯著差異蛋白260個,其中有毒力前鞭毛體表達上調蛋白(高表達)78個,表達下調蛋白(低表達)182個。這些差異表達蛋白中已鑒定功能的蛋白分別涉及糖與脂質代謝、核酸代謝、壓力反應、細胞骨架形成、細胞周期與增殖等生物功能。結論利什曼原蟲伽師株有毒力株和無毒力株...
【文章來源】:中國人獸共患病學報. 2019,35(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
圖1利什曼原蟲伽師有毒株和無毒株差異表達蛋白韋恩圖
cellcompositionandmolecularfunctionenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain2.3差異表達蛋白通路富集分析對有毒株表達上調蛋白和下調蛋白分別進行信號轉導通路富集分析,結果顯示表達上調蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號轉導通路(圖4);表達下調蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號轉導通路(圖5)。圖4有毒株表達上調蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達下調蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應用非標記高通量蛋白質組研究技術對分離于我國新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲有毒株和無毒株進行了蛋白質組學分析,共鑒定蛋白3994個,遠高于其他蛋白質組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結果顯示,298個蛋白在有毒株和無毒株間的表達存在差異(特異表達或表達豐度差異)。這些差異表達蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質代謝、核酸代謝、壓力反應、細胞骨架形成、細胞周期與增殖等活動。001中國人獸共患病學報2019,35(2)
ain2.3差異表達蛋白通路富集分析對有毒株表達上調蛋白和下調蛋白分別進行信號轉導通路富集分析,結果顯示表達上調蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號轉導通路(圖4);表達下調蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號轉導通路(圖5)。圖4有毒株表達上調蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達下調蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應用非標記高通量蛋白質組研究技術對分離于我國新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲有毒株和無毒株進行了蛋白質組學分析,共鑒定蛋白3994個,遠高于其他蛋白質組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結果顯示,298個蛋白在有毒株和無毒株間的表達存在差異(特異表達或表達豐度差異)。這些差異表達蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質代謝、核酸代謝、壓力反應、細胞骨架形成、細胞周期與增殖等活動。001中國人獸共患病學報2019,35(2)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同種株利什曼原蟲的比較蛋白質組學分析[J]. 沈成義,鄧世山,張仁剛,張潔,敬保遷. 中國人獸共患病學報. 2009(05)
本文編號:3068927
【文章來源】:中國人獸共患病學報. 2019,35(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
圖1利什曼原蟲伽師有毒株和無毒株差異表達蛋白韋恩圖
cellcompositionandmolecularfunctionenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain2.3差異表達蛋白通路富集分析對有毒株表達上調蛋白和下調蛋白分別進行信號轉導通路富集分析,結果顯示表達上調蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號轉導通路(圖4);表達下調蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號轉導通路(圖5)。圖4有毒株表達上調蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達下調蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應用非標記高通量蛋白質組研究技術對分離于我國新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲有毒株和無毒株進行了蛋白質組學分析,共鑒定蛋白3994個,遠高于其他蛋白質組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結果顯示,298個蛋白在有毒株和無毒株間的表達存在差異(特異表達或表達豐度差異)。這些差異表達蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質代謝、核酸代謝、壓力反應、細胞骨架形成、細胞周期與增殖等活動。001中國人獸共患病學報2019,35(2)
ain2.3差異表達蛋白通路富集分析對有毒株表達上調蛋白和下調蛋白分別進行信號轉導通路富集分析,結果顯示表達上調蛋白參與了核糖體、吞噬體、醚脂代謝等信號轉導通路(圖4);表達下調蛋白參與了丙酮酸代謝、次生代謝物的生物合成、抗生素的生物合成等信號轉導通路(圖5)。圖4有毒株表達上調蛋白的通路富集圖Fig.4Pathwaysenrichmentdiagramofup-regulatedpro-teinsinvirulentstrain圖5有毒株表達下調蛋白的通路富集圖Fig.5Pathwaysenrichmentdiagramofdown-regulatedproteinsinvirulentstrain3討論本研究應用非標記高通量蛋白質組研究技術對分離于我國新疆伽師縣致荒漠型黑熱病的利什曼原蟲有毒株和無毒株進行了蛋白質組學分析,共鑒定蛋白3994個,遠高于其他蛋白質組方法鑒定的蛋白數(shù)[8]。本研究結果顯示,298個蛋白在有毒株和無毒株間的表達存在差異(特異表達或表達豐度差異)。這些差異表達蛋白中確定功能的蛋白分別參與糖與脂質代謝、核酸代謝、壓力反應、細胞骨架形成、細胞周期與增殖等活動。001中國人獸共患病學報2019,35(2)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同種株利什曼原蟲的比較蛋白質組學分析[J]. 沈成義,鄧世山,張仁剛,張潔,敬保遷. 中國人獸共患病學報. 2009(05)
本文編號:3068927
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