本文關(guān)鍵詞：云南省鼠類腸道病毒宏基因組研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:對(duì)與人類密切相關(guān)的云南家鼠和野鼠腸道中病毒宏基因組進(jìn)行系統(tǒng)的研究和分析;闡明鼠類腸道病毒的遺傳多樣性以及與動(dòng)物和人類病毒的遺傳進(jìn)化關(guān)系。豐富我們對(duì)自然環(huán)境中未知鼠類病毒的認(rèn)識(shí),為預(yù)防和控制由鼠傳播的新發(fā)病毒性疾病的暴發(fā)和流行提供科學(xué)指導(dǎo)。方法:本項(xiàng)目在前期鼠病毒研究的基礎(chǔ)上,結(jié)合宏基因組學(xué)、隨機(jī)PCR和高通量測(cè)序技術(shù),在不知病毒任何遺傳背景的情況下,從基因組角度高通量對(duì)取自云南省7個(gè)地區(qū)的212份樣本進(jìn)行宏基因組分析。結(jié)果:檢測(cè)到的鼠類病毒可以歸到36個(gè)病毒科中。其中RNA病毒包括小核糖核酸病毒科、二順反子病毒科、無法歸類的病毒目、Secoviridae、呼腸孤病毒科、逆轉(zhuǎn)錄病毒科、蓋病毒科、番茄叢矮病毒科、整體病毒科、環(huán)病毒科、Alphatetraviridae、星狀病毒科、布尼亞病毒科、Carmotetraviridae、長(zhǎng)線形病毒、虹彩病毒科、光滑病毒科、羅達(dá)病毒科、微小核糖核酸病毒科;而DNA病毒包括了長(zhǎng)尾病毒科、肌病毒科、無法歸類的有尾噬菌體目、短尾病毒科、皰疹病毒科、多瘤病毒科、腺病毒科、雙DNA病毒科、環(huán)病毒科、聯(lián)體病毒科、絲形病毒科、馬賽病毒科、微病毒科、擬態(tài)病毒科、分體病毒科、細(xì)小病毒科、藻類去氧核糖核酸病毒科和未非分類的病毒。結(jié)論:云南省鼠類腸道病毒共檢測(cè)到36個(gè)病毒科;發(fā)現(xiàn)了一種新型鼠腺病毒;病毒宏基因組學(xué)是分析鼠類腸道病毒的好方法。
【關(guān)鍵詞】：云南 鼠類 腸道病毒 宏基因組
【學(xué)位授予單位】：大理學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R373.25
【目錄】：

• 英文縮略詞4-5
• 中文摘要5-6
• Abstract6-7
• 前言7-14
• 1 鼠類與人類關(guān)系緊密7
• 2 鼠類是病毒的天然儲(chǔ)藏庫(kù)7-8
• 3 目前我國(guó)對(duì)鼠源性病毒的研究狀況8-9
• 4 宏基因組學(xué)的優(yōu)越性9-11
• 5 鼠類腸道病毒的宏基因組研究進(jìn)展11-13
• 6 病毒宏基因組學(xué)的主要技術(shù)路線13
• 7 課題的意義13-14
• 材料與方法14-35
• 1 材料14-21
• 2 方法21-35
• 結(jié)果35-50
• 1 12份樣品隨機(jī)PCR的結(jié)果35-37
• 2 測(cè)序結(jié)果及讀段（reads）拼接分析37-38
• 3 針對(duì)拼接得到的所有重疊群序列，進(jìn)行了 BLASTx/n 的比對(duì)分析38-39
• 4 對(duì)病毒相關(guān)的重疊群序列，根據(jù)具體的病毒科，進(jìn)一步進(jìn)行了病毒分類39-41
• 5 各病毒科相關(guān)重疊群分析41-50
• 討論50-53
• 結(jié)論53-54
• 參考文獻(xiàn)54-59
• 綜述59-66
• 參考文獻(xiàn)63-66
• 致謝66

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 張?jiān)浦?龔正達(dá),馮錫光,段興德,吳厚永,翁學(xué),呂元;云南白草嶺鼠形小獸群落結(jié)構(gòu)及垂直分布[J];動(dòng)物學(xué)雜志;2002年02期

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本文編號(hào)：258181