【摘要】：2013年在中國臺灣地區(qū)發(fā)現(xiàn)了第一例人感染H6N1禽流感,研究該地區(qū)H6N1病毒血凝素基因(HA)的適應性進化特征和種群動力學,將為人感染H6N1病毒的來源、進化及致病機制的理解提供更多信息,為進一步的研究和防治提供一定幫助。本研究從Flu和GISAID兩大數(shù)據(jù)庫中獲得中國臺灣地區(qū)所有已釋放的H6N1病毒的HA序列,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹和進化動力曲線,并推測其進化速率,分析其適應性進化特征。結(jié)果表明中國臺灣地區(qū)H6N1病毒的HA有五種類型,其中人感染H6N1病毒的HA所屬類型為目前當?shù)貎?yōu)勢類型;該病毒種群于1971年底第一次擴張,2008年迅速減少,而后又略有增加。同時在長期的進化過程中,3個位點受到正選擇作用的影響,增加了病毒的適應能力;89個位點受負選擇作用的影響,它們在病毒的復制、流行中可能具有重要的功能;其中剪切位點附近的329位所受負選擇作用強烈(PSLAC0.001、PFEL0.000、BFREL137),此位點可能與病毒毒力有關。中國臺灣地區(qū)H6N1病毒的HA已發(fā)生了明顯的適應性進化,具有發(fā)生疫情的可能性,人們應高度重視,并能及時給與監(jiān)測和防治。
[Abstract]:The first case of human infection with H6N1 avian influenza was found in Taiwan in 2013. The study of the adaptive evolutionary characteristics and population dynamics of the (HA) gene of H6N1 virus hemagglutinin in this area will be the source of human H6N1 virus infection. The understanding of evolution and pathogenesis provides more information for further study and prevention. In this study, HA sequences of all released H6N1 viruses were obtained from Flu and GISAID databases in Taiwan, China. Phylogenetic trees and evolutionary dynamics curves were constructed, and their evolutionary rates were estimated and their adaptive evolution characteristics were analyzed. The results showed that there were five types of HA of H6N1 virus in Taiwan area of China. The HA of human infected with H6N1 virus belonged to the local dominant type, and the population of H6N1 virus expanded for the first time at the end of 1971, then decreased rapidly in 2008, and then increased slightly. At the same time, during the long evolutionary process, 3 sites were affected by positive selection, which increased the adaptability of virus, 89 sites were affected by negative selection, which may play an important role in virus replication and epidemic. The negative selection of 329 sites near the shear site (PSLAC0.001 PFEL0.000 BFREL137) may be related to the virulence of the virus. The HA of H6N1 virus in Taiwan area of China has undergone obvious adaptive evolution and has the possibility of outbreak. People should attach great importance to it and be able to monitor and prevent it in time.
【作者單位】： 皖南醫(yī)學院醫(yī)學生物學教研室;
【基金】：省級優(yōu)秀青年人才基金(WK200921) 校重點科研項目(WK2014Z02)
【分類號】：R373.9

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