目的:篩選并初步鑒定與參與相關(guān)信號(hào)通路的DNMT1高表達(dá)相關(guān)的LncRNA,為深入探討疾病機(jī)制提供理論依據(jù)。方法:以前期構(gòu)建的食管上皮DNMT1高表達(dá)細(xì)胞株為實(shí)驗(yàn)組(3例),正常食管上皮細(xì)胞株HEEC為對(duì)照組(3例),利用Agilent Human LncRNA V5芯片檢測(cè)DNMT1高表達(dá)和正常細(xì)胞株的LncRNA和mRNA的差異表達(dá),以Fold Change≥2.0,P<0.05為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行顯著差異的篩選;實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(Real-time PCR)SYBR Green驗(yàn)證差異倍數(shù)較大的10條LncRNA;采用基因本體(GO)功能注釋分析法和KEGG通路分析法,對(duì)差異表達(dá)的mRNA進(jìn)行功能注釋與分析;根據(jù)KEGG結(jié)果挑選出6條信號(hào)通路進(jìn)行LncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析。結(jié)果:1、顯著差異表達(dá)的LncRNA共有6987個(gè),其中表達(dá)上調(diào)的有3654個(gè),表達(dá)下調(diào)的有3333個(gè);顯著差異表達(dá)mRNA共有7421個(gè),表達(dá)上調(diào)的2254個(gè),表達(dá)下調(diào)的5167個(gè)。2、qRT-PCR驗(yàn)證篩選出的10個(gè)LncRNAs,全部與芯片結(jié)果吻合,分別為:lnc-OR1M1-1:1,lnc...

【文章頁(yè)數(shù)】：111 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
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摘要
ABSTRACT
前言
研究?jī)?nèi)容與方法
    1 研究對(duì)象
    2 內(nèi)容與方法
        2.1 主要試劑
        2.2 主要儀器
        2.3 主要器材
        2.4 研究方法
    3 質(zhì)量控制
    4 統(tǒng)計(jì)分析
    5 技術(shù)路線(xiàn)
結(jié)果
討論
小結(jié)
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
導(dǎo)師評(píng)閱表



本文編號(hào)：3789114