目的:分析單核細胞(Mo)向巨噬細胞(Mφ)分化的過程中,細胞骨架的調控相關基因及信號通路的表達變化。方法:CEO數據庫獲得Mo和Mφ的芯片數據,經RStudio軟件分析獲得差異表達基因(DEGenes),利用STRING在線工具對DEGenes構建蛋白質相互作用網絡(PPI),Cytoscap軟件篩選出DEGenes的核心模塊;對篩選出的DEGenes的核心模塊進行GO和KEGG分析。結果:Mφ相對于Mo的差異表達基因共476個,主要涉及的信號通路包括NOD樣受體信號通路和吞噬體信號通路,這些通路中CCL18、CXCL8和C3等相關基因與細胞骨架的調控密切相關。結論:Mo向Mφ分化過程中細胞骨架調控相關基因的表達發(fā)生了顯著改變。

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【文章目錄】：
1 資料和方法
    1.1 資料
    1.2 方法
        1.2.1 分析芯片數據差異基因
        1.2.2 構建蛋白質相互作用網絡
        1.2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes的核心模塊
2 結果
    2.1 經RStudio軟件獲得DEGenes
    2.2 構建PPI
    2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes
3 討論



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