一株致嚴(yán)重呼吸道疾病新的樹(shù)鼩腺病毒分離鑒定及全基因組序列解析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-23 11:04
樹(shù)鼩腺病毒(Tree Shrew Adenovirus,TAV)是一種線性雙鏈DNA病毒,屬于腺病毒科,哺乳動(dòng)物腺病毒屬。腺病毒感染會(huì)引起急性上呼吸道感染、急性結(jié)膜炎、急性出血性膀胱炎、腹瀉等疾病。樹(shù)鼩(Tupaia belangeri)作為與靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物親緣關(guān)系最近的新型模式動(dòng)物,與人類(lèi)及靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物較高的遺傳同源性,在人類(lèi)疾病模型尤其是感染性疾病模型和臨床前藥物開(kāi)發(fā)研究中發(fā)揮著不可或缺的作用,已逐步成為生物醫(yī)學(xué)研究的熱點(diǎn)。前期開(kāi)展的相關(guān)研究表明,野生來(lái)源樹(shù)鼩中腺病毒核酸檢測(cè)率較高,并有疑似病例發(fā)生,因此被列為該動(dòng)物微生物質(zhì)量控制的檢測(cè)指標(biāo)之一,但迄今國(guó)內(nèi)還未見(jiàn)成功分離的報(bào)道。本研究從樹(shù)鼩偶發(fā)呼吸道疾病及腹瀉臨床癥狀推測(cè)可能是由某種病毒感染引起,采用病毒分離方法首次從樹(shù)鼩這一物種分離鑒定到樹(shù)鼩腺病毒。為揭示這株TAV在腺病毒家族中所處的進(jìn)化地位、遺傳信息以及對(duì)樹(shù)鼩健康是否存在潛在威脅,本研究對(duì)所獲得的TAV進(jìn)行了全基因組序列解析。首先,對(duì)來(lái)自患有嚴(yán)重呼吸道疾病的樹(shù)鼩氣管及肺組織樣品進(jìn)行病理學(xué)檢測(cè)及樣品處理,通過(guò)樹(shù)鼩原代腎細(xì)胞(Tree Shrewkidney cells,TKC)培養(yǎng),產(chǎn)...
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3腺病毒復(fù)制周期簡(jiǎn)圖??
中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院碩士研究生畢業(yè)論文??⑦將濾柱置于新的罔心管中,室溫12000rpm離心lmin。??⑧將濾柱安置于新的1.5mL離心管中,在濾柱膜中央加入30|iL?DEPC水,??室溫靜置lmin。室溫12000rpm離心lmin洗脫DNA。??純化得到的DNA產(chǎn)物由寶生物(大連)工程公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果于NCB1??BLAST進(jìn)行序列相似性和同源性分析,以確定PCR檢測(cè)的準(zhǔn)確性。??2.實(shí)驗(yàn)結(jié)果??2.1樹(shù)駒肺組織病理學(xué)病變特征觀察??病毒性肺炎主要表現(xiàn)為肺間質(zhì)的炎癥。肉眼觀,病變常不明顯。病變區(qū)域呈??暗紅色,肺體積增大(圖4)。??
2.2樹(shù)駒原代腎細(xì)胞TKC和CK18的鑒定??酶消化法所得腎細(xì)胞于12h貼壁,24小時(shí)細(xì)胞從片斷和團(tuán)塊周邊貼壁生長(zhǎng),48??小時(shí)細(xì)胞鋪滿瓶底,細(xì)胞呈扁平不規(guī)則多角形,鵝卵石樣排列(圖6)。傳代后12h??細(xì)胞開(kāi)始貼壁,24小時(shí)完全貼壁。??_??圖6樹(shù)駒原代腎細(xì)胞(10〇x)??Fig.6?Tree?shrew?kidny?cells?(10〇x).??用優(yōu)化的培養(yǎng)條件對(duì)分離得到的樹(shù)駒原代腎細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng)第4天,可在顯微??26??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]樹(shù)鼩腺病毒TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 宋慶凱,李曉飛,苗雨潤(rùn),張志成,王璇,袁圓,代解杰,孫曉梅. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2018(03)
[2]牛病毒性腹瀉病毒、牛傳染性支氣管炎病毒和口蹄疫病毒多重TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 宋爽,趙柏林,曲萍,胡冬梅,孫雨,董浩,楊林,宋曉暉,潘樹(shù)德. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(02)
[3]山東省血清4型禽腺病毒的分離鑒定[J]. 于可響,黃兵,凌紅麗,龐運(yùn)倩,王友令,李峰,亓麗紅,宋敏訓(xùn). 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]Ⅰ群禽腺病毒的分離鑒定及其致病性研究[J]. 李曉林,王相芹,羅濟(jì)冠,李明義. 中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2016(08)
[5]禽坦布蘇病毒TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 萬(wàn)春和,陳翠騰,傅秋玲,程龍飛,傅光華,陳紅梅,施少華,黃瑜. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(08)
[6]腺病毒感染研究進(jìn)展[J]. 謝立,楊旭輝,陳恩富. 浙江預(yù)防醫(yī)學(xué). 2015(03)
[7]樹(shù)鼩腺病毒(TAV)PCR方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 王淑菁,付瑞,李曉波,王吉,衛(wèi)禮,鞏薇,賀爭(zhēng)鳴,岳秉飛. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2014(12)
[8]樹(shù)鼩的生物學(xué)特性研究概述[J]. 蘇傲蕾,秦銀鴿,鄭禹,陳群,運(yùn)晨霞,黃正團(tuán),冷靜. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(10)
[9]樹(shù)鼩呼腸孤病毒RT-nPCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 李曉飛,殷安國(guó),張媛,羅軍,孫曉梅,代解杰. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2014(06)
[10]人腺病毒的研究進(jìn)展[J]. 高文娟,金玉,段招軍. 病毒學(xué)報(bào). 2014(02)
博士論文
[1]人呼吸道腺病毒55型的基因組學(xué)與病原學(xué)特征研究[D]. 劉娟.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2014
[2]基于重組腺病毒載體的烈性病原體疫苗研究[D]. 吳詩(shī)坡.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2013
[3]兒童急性呼吸道感染病毒流行特征與基因特征研究[D]. 盧慶彬.山東大學(xué) 2013
[4]溶瘤腺病毒SG655-mGMP對(duì)腫瘤干細(xì)胞的治療作用研究[D]. 呂賽群.第二軍醫(yī)大學(xué) 2013
[5]Ⅰ群禽腺病毒的分離鑒定和生物學(xué)特性研究及重組禽腺病毒的構(gòu)建[D]. 張明明.揚(yáng)州大學(xué) 2008
碩士論文
[1]禽腺病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立與初步應(yīng)用[D]. 邱麗葉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]熒光定量PCR快速檢測(cè)登革1型病毒[D]. 熊建英.南方醫(yī)科大學(xué) 2012
[3]靶向腫瘤細(xì)胞的腺病毒纖毛蛋白改造研究[D]. 陳亞龍.浙江理工大學(xué) 2010
本文編號(hào):3453075
【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3腺病毒復(fù)制周期簡(jiǎn)圖??
中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院碩士研究生畢業(yè)論文??⑦將濾柱置于新的罔心管中,室溫12000rpm離心lmin。??⑧將濾柱安置于新的1.5mL離心管中,在濾柱膜中央加入30|iL?DEPC水,??室溫靜置lmin。室溫12000rpm離心lmin洗脫DNA。??純化得到的DNA產(chǎn)物由寶生物(大連)工程公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果于NCB1??BLAST進(jìn)行序列相似性和同源性分析,以確定PCR檢測(cè)的準(zhǔn)確性。??2.實(shí)驗(yàn)結(jié)果??2.1樹(shù)駒肺組織病理學(xué)病變特征觀察??病毒性肺炎主要表現(xiàn)為肺間質(zhì)的炎癥。肉眼觀,病變常不明顯。病變區(qū)域呈??暗紅色,肺體積增大(圖4)。??
2.2樹(shù)駒原代腎細(xì)胞TKC和CK18的鑒定??酶消化法所得腎細(xì)胞于12h貼壁,24小時(shí)細(xì)胞從片斷和團(tuán)塊周邊貼壁生長(zhǎng),48??小時(shí)細(xì)胞鋪滿瓶底,細(xì)胞呈扁平不規(guī)則多角形,鵝卵石樣排列(圖6)。傳代后12h??細(xì)胞開(kāi)始貼壁,24小時(shí)完全貼壁。??_??圖6樹(shù)駒原代腎細(xì)胞(10〇x)??Fig.6?Tree?shrew?kidny?cells?(10〇x).??用優(yōu)化的培養(yǎng)條件對(duì)分離得到的樹(shù)駒原代腎細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng)第4天,可在顯微??26??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]樹(shù)鼩腺病毒TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 宋慶凱,李曉飛,苗雨潤(rùn),張志成,王璇,袁圓,代解杰,孫曉梅. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2018(03)
[2]牛病毒性腹瀉病毒、牛傳染性支氣管炎病毒和口蹄疫病毒多重TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 宋爽,趙柏林,曲萍,胡冬梅,孫雨,董浩,楊林,宋曉暉,潘樹(shù)德. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(02)
[3]山東省血清4型禽腺病毒的分離鑒定[J]. 于可響,黃兵,凌紅麗,龐運(yùn)倩,王友令,李峰,亓麗紅,宋敏訓(xùn). 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2016(05)
[4]Ⅰ群禽腺病毒的分離鑒定及其致病性研究[J]. 李曉林,王相芹,羅濟(jì)冠,李明義. 中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2016(08)
[5]禽坦布蘇病毒TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 萬(wàn)春和,陳翠騰,傅秋玲,程龍飛,傅光華,陳紅梅,施少華,黃瑜. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(08)
[6]腺病毒感染研究進(jìn)展[J]. 謝立,楊旭輝,陳恩富. 浙江預(yù)防醫(yī)學(xué). 2015(03)
[7]樹(shù)鼩腺病毒(TAV)PCR方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 王淑菁,付瑞,李曉波,王吉,衛(wèi)禮,鞏薇,賀爭(zhēng)鳴,岳秉飛. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2014(12)
[8]樹(shù)鼩的生物學(xué)特性研究概述[J]. 蘇傲蕾,秦銀鴿,鄭禹,陳群,運(yùn)晨霞,黃正團(tuán),冷靜. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(10)
[9]樹(shù)鼩呼腸孤病毒RT-nPCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 李曉飛,殷安國(guó),張媛,羅軍,孫曉梅,代解杰. 中國(guó)比較醫(yī)學(xué)雜志. 2014(06)
[10]人腺病毒的研究進(jìn)展[J]. 高文娟,金玉,段招軍. 病毒學(xué)報(bào). 2014(02)
博士論文
[1]人呼吸道腺病毒55型的基因組學(xué)與病原學(xué)特征研究[D]. 劉娟.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2014
[2]基于重組腺病毒載體的烈性病原體疫苗研究[D]. 吳詩(shī)坡.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2013
[3]兒童急性呼吸道感染病毒流行特征與基因特征研究[D]. 盧慶彬.山東大學(xué) 2013
[4]溶瘤腺病毒SG655-mGMP對(duì)腫瘤干細(xì)胞的治療作用研究[D]. 呂賽群.第二軍醫(yī)大學(xué) 2013
[5]Ⅰ群禽腺病毒的分離鑒定和生物學(xué)特性研究及重組禽腺病毒的構(gòu)建[D]. 張明明.揚(yáng)州大學(xué) 2008
碩士論文
[1]禽腺病毒熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立與初步應(yīng)用[D]. 邱麗葉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]熒光定量PCR快速檢測(cè)登革1型病毒[D]. 熊建英.南方醫(yī)科大學(xué) 2012
[3]靶向腫瘤細(xì)胞的腺病毒纖毛蛋白改造研究[D]. 陳亞龍.浙江理工大學(xué) 2010
本文編號(hào):3453075
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