目的對(duì)EgRad54基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)不同發(fā)育階段的表達(dá)情況進(jìn)行檢測(cè)分析。方法克隆EgRad54基因并對(duì)編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)、二、三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析;采用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)并進(jìn)行分析;采用qRT-PCR檢測(cè)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)不同發(fā)育階段的EgRad54 mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果 EgRad54基因開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為1 714 bp,NCBI blast比對(duì)顯示其序列與原始序列相似性為100%,DNAMAN比對(duì)相似性為95.40%;EgRad54蛋白含有581個(gè)氨基酸,相對(duì)分子質(zhì)量為65.520 45×10³,理論等電點(diǎn)為8.91;在EgRad54蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中,ɑ-螺旋占44.41%,β-折疊占13.25%,β-轉(zhuǎn)角占6.37%,無(wú)規(guī)則卷曲占35.97%;三級(jí)結(jié)構(gòu)選擇123i.A模型,GMQE為0.78,QMEAN為-3.51,序列相似度為69.33%,覆蓋率為85.20%;進(jìn)化樹(shù)顯示EgRad54基因與多房棘球蚴親緣關(guān)系較近;以未消化原頭蚴組作為對(duì)照組,qRT-PCR檢測(cè)胃蛋白酶消化原頭蚴組和囊泡組Rad54基因相對(duì)表達(dá)量分別為1.... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2019,14(11)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
材料與方法
    1 材料
    2 方法
        2.1 標(biāo)本收集
        2.2 總RNA提取及cDNA逆轉(zhuǎn)錄
        2.3 基因克隆與測(cè)序
        2.4 EgRad54基因編碼蛋白生物信息學(xué)分析
            2.4.1 理化性質(zhì)預(yù)測(cè)
            2.4.2 二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)分析[5]
            2.4.3 EgRad54蛋白多序列比對(duì)與進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建[6-7]
            2.4.4 不同發(fā)育階段Rad54基因表達(dá)檢測(cè)
        2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
結(jié) 果
    1 EgRad54基因克隆
    2 EgRad54蛋白理化性質(zhì)
    3 EgRad54蛋白結(jié)構(gòu)
    4 Rad54蛋白多序列比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析
    5 Rad54基因表達(dá)分析
討 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Veliparib聯(lián)合青蒿琥酯體外抗細(xì)粒棘球蚴作用機(jī)制的研究[J]. 李亞芬,趙軍,呂國(guó)棟,鄭海亞,盧帥,鄭璇,木扎拜爾·木合塔爾,文麗梅,王建華.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(07)
[2]甘氨鵝脫氧膽酸對(duì)體外細(xì)粒棘球蚴原頭節(jié)活力及ROS影響[J]. 湯光耀,姜玉峰,呂海龍,李佳潔,楊仁坦,秦文娟,馬斌,馬容基,王麟堯,陳琳,許雅.  中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2018(07)
[3]核糖體蛋白S6激酶β1的分子結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析[J]. 劉暢,劉安.  生物信息學(xué). 2018(01)
[4]HCV NS2對(duì)細(xì)胞凋亡及DNA損傷應(yīng)答信號(hào)的影響[J]. 趙玫,任來(lái)峰,王艷峰,楊萬(wàn)霞,宋靜,陳思思,任云青,蘇文.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(01)
[5]青蒿琥酯體外抗細(xì)粒棘球蚴活性氧對(duì)DNA作用機(jī)制影響的研究[J]. 鄭海亞,文麗梅,呂國(guó)棟,盧帥,李亞芬,鄭璇,木扎拜爾·木合地爾,趙軍,王建華.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(08)
[6]包蟲(chóng)病病原在我國(guó)的流行現(xiàn)狀及成因分析[J]. 劉平,李金花,李印,康京麗,戴琪,趙娜,孫向東.  中國(guó)動(dòng)物檢疫. 2016(01)
[7]DNA雙鏈斷裂與同源重組修復(fù)的研究進(jìn)展[J]. 董雋,張?zhí)?文碧秀.  中國(guó)醫(yī)學(xué)創(chuàng)新. 2015(03)
[8]細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)核糖體蛋白S9基因克隆鑒定及其在不同發(fā)育階段表達(dá)分析[J]. 肖云峰,劉輝,呂國(guó)棟,趙軍,高惠靜,李娟,王建華.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2014(02)

博士論文
[1]DNA雙鏈斷裂修復(fù)信號(hào)通路選擇的分子機(jī)制研究[D]. 婁江曼.浙江大學(xué) 2018

碩士論文
[1]我國(guó)棘球蚴病疾病負(fù)擔(dān)分析[D]. 張夢(mèng)媛.中國(guó)疾病預(yù)防控制中心 2017



本文編號(hào)：3167027