典型基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動力學(xué)行為及機(jī)制
發(fā)布時間:2020-08-15 20:44
【摘要】:眾所周知,噪聲在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中起著重要作用.它不僅能夠影響基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的整體特性,還可以通過生物的自組織產(chǎn)生獨特的功能.在本文中,我們分別從隨機(jī)共振(SR)和能量景觀的角度來研究兩個典型的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動力學(xué)行為及機(jī)制.首先,我們利用特征相關(guān)時間tCCT探索了基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在Levy噪聲下的SR現(xiàn)象.我們模擬了不同噪聲參數(shù)下mRNAs和阻遏蛋白的濃度變化,表明噪聲可以誘導(dǎo)mRNAs和阻遏蛋白濃度的振蕩.另外還探究了四種不同的Levy噪聲內(nèi)在參數(shù)和噪聲強(qiáng)度呈現(xiàn)的SR效應(yīng).以上的結(jié)果揭示了mRNAs和阻遏蛋白的SR上的噪聲趨勢是相似的,所以可以通過SR機(jī)制同時實現(xiàn)基因調(diào)控中mRNAs和阻遏蛋白的調(diào)節(jié)和優(yōu)化.我們發(fā)現(xiàn)穩(wěn)定性參數(shù)α對比例因子γ具有相似的影響,它們在一定范圍內(nèi)的增加可以促進(jìn)SR的最優(yōu)協(xié)調(diào).此外,位置參數(shù)δ和偏度參數(shù)β對共振效應(yīng)也有很大的好處;它們的增加會抑制SR的最優(yōu)協(xié)作.因此,Levy噪聲的刺激對于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的基因表達(dá)是至關(guān)重要的.其次,我們用能量景觀的方式直觀地展現(xiàn)并分析了雙穩(wěn)系統(tǒng)的穩(wěn)態(tài)轉(zhuǎn)移,并闡述了噪聲和系統(tǒng)參數(shù)對其的影響,還利用平均首次通過時間(MFPT)說明了其與噪聲強(qiáng)度的負(fù)相關(guān).我們的方法豐富了基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的動力學(xué)機(jī)制的研究.總之,以上獲得的結(jié)果為進(jìn)一步生物機(jī)制的研究提供可行的途徑.
【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:O175;Q811.4
【圖文】:
噪聲的樣本軌跡(LSvy穩(wěn)定分布相關(guān)程序詳見目錄).LSvy噪聲下,隨著噪聲強(qiáng)度的增加,逡逑噪聲幅值X椉櫻逯堤匭員淶酶用饗;高斯噪声卜的随机数趋又X榷ǎ豢攣鞣植嫉難懼義媳浠到洗螅跡郴雋耍蹋Γ植嫉母怕拭芏群頤強(qiáng)吹剿孀牛岬腦黽櫻怕拭芏儒義戲植記咴嚼叢降,尾部变小轻t(yī)詠街幔粗薄跺澹藉澹彩,比例因
本文編號:2794619
【學(xué)位授予單位】:鄭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:O175;Q811.4
【圖文】:
噪聲的樣本軌跡(LSvy穩(wěn)定分布相關(guān)程序詳見目錄).LSvy噪聲下,隨著噪聲強(qiáng)度的增加,逡逑噪聲幅值X椉櫻逯堤匭員淶酶用饗;高斯噪声卜的随机数趋又X榷ǎ豢攣鞣植嫉難懼義媳浠到洗螅跡郴雋耍蹋Γ植嫉母怕拭芏群頤強(qiáng)吹剿孀牛岬腦黽櫻怕拭芏儒義戲植記咴嚼叢降,尾部变小轻t(yī)詠街幔粗薄跺澹藉澹彩,比例因
本文編號:2794619
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