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豬源附紅細(xì)胞體分離鑒定PCR方法的建立及小附紅細(xì)胞體人工感染試驗

發(fā)布時間:2017-05-24 06:17

  本文關(guān)鍵詞:豬源附紅細(xì)胞體分離鑒定PCR方法的建立及小附紅細(xì)胞體人工感染試驗,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:感染豬的附紅細(xì)胞體分為附紅細(xì)胞體和小附紅細(xì)胞體兩大類。而國內(nèi)還未見有關(guān)小附紅細(xì)胞體分離和動物感染試驗的報道。通過小附紅細(xì)胞體病原的分離鑒定及動物感染試驗,有助于了解小附紅細(xì)胞體的生物學(xué)特性及致病性。本試驗從上海地區(qū)2個屠宰場,采集豬抗凝血736份,提取血液基因組DNA作為模板,設(shè)計合成兩對特異性引物并驗證了具有高度敏感性和良好特異性,用兩對特異性的引物進(jìn)行16s RNA基因部分序列的PCR擴(kuò)增、克隆、序列測定及生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,在736份血樣中,豬源附紅細(xì)胞體陽性率為13.72%(101/756),其中小附紅細(xì)胞體陽性率為7.34%(54/736),豬附紅細(xì)胞體陽性率為4.76%(35/736),混合感染比例為1.63%(12/736),2個屠宰場3次采集的樣品陽性率差異極顯著(χ2==132.841,P0.001)。嘉定區(qū)某屠宰場3月份的陽性率為2.41%,5月份的陽性率為33.21%,5月份極顯著高于3月份(χ2=81.484,P0.001)。在DNA擴(kuò)增陽性血樣中,分別選取4份小附紅細(xì)胞體引物擴(kuò)增產(chǎn)物和4份豬附紅細(xì)胞體引物擴(kuò)增產(chǎn)物,亞克隆到pMD18-T載體后進(jìn)行測序。小附紅細(xì)胞體擴(kuò)增片段序列完全一致,長度均為483 bp, BLASTn軟件在線分析顯示所獲得序列與GenBank公布的小附紅細(xì)胞體Indiana株16S rRNA基因(登錄號:NR 121759)序列同源性達(dá)100%。豬附紅細(xì)胞體擴(kuò)增片段序列也完全一致,長度均為482 bp, BLASTn軟件在線分析顯示所獲得序列與GenBank公布的豬附紅細(xì)胞體Morioka5、6、8株16SrRNA基因(登錄號分別為:AB610847、AB610848、AB610849)和ZJ NB01株16S rRNA基因(登錄號:KC907396.1)序列同源性達(dá)100%,豬附紅細(xì)胞體擴(kuò)增片段與小附紅細(xì)胞體擴(kuò)增片段的同源性僅為93.6%。用小附紅細(xì)胞體陽性血樣通過肌肉注射方法接種廣西巴馬去脾仔豬,采集血樣進(jìn)行特異性PCR檢測及序列分析。結(jié)果表明:試驗組5頭仔豬中有2頭在接種12d、5頭在接種15d均檢出小附紅細(xì)胞體基因,人工感染豬血樣與接種原血樣DNA擴(kuò)增產(chǎn)物基因序列完全一致。這證明已經(jīng)成功建立了小附紅細(xì)胞體人工感染豬的試驗。本研究通過試驗數(shù)據(jù)證明了國內(nèi)確實有豬感染小附紅細(xì)胞體,小附紅細(xì)胞體和豬附紅細(xì)胞體在16sRNA基因片段上存在差異。通過人工肌肉接種,首次建立了小附紅細(xì)胞體豬感染試驗?zāi)P?為小附紅細(xì)胞體的生物學(xué)特性和致病性研究打下了基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:豬源附紅細(xì)胞體 小附紅細(xì)胞體 豬附紅細(xì)胞體 16sRNA基因 特異性PCR
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S858.28
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • Abstract5-7
  • 英文縮略表7-11
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述11-22
  • 1 豬源附紅細(xì)胞體病原學(xué)研究進(jìn)展11-14
  • 1.1 病原分類11-12
  • 1.2 病原形態(tài)及分布12-13
  • 1.3 增殖13-14
  • 2 豬附紅細(xì)胞體流行病學(xué)研究概述14
  • 3 附紅細(xì)胞體病診斷手段的研究進(jìn)展14-20
  • 3.1 形態(tài)學(xué)診斷14
  • 3.2 血清學(xué)診斷14-17
  • 3.3 分子生物學(xué)檢測17-20
  • 4 小附紅細(xì)胞體的研究概述20
  • 5 研究目的意義20-22
  • 第二章 豬源附紅細(xì)胞體PCR檢測方法的建立22-29
  • 1 實驗材料22-23
  • 1.1 陽性質(zhì)粒DNA22
  • 1.2 酶及試劑22
  • 1.3 主要儀器22-23
  • 2 實驗方法23-24
  • 2.1 特異性引物設(shè)計23
  • 2.2 特異性試驗23
  • 2.3 敏感性試驗23-24
  • 3 試驗結(jié)果24-27
  • 3.1 特異性試驗24-25
  • 3.2 敏感性試驗25-27
  • 4 討論27-28
  • 5 小結(jié)28-29
  • 第三章 上海地區(qū)豬源附紅細(xì)胞體流行病學(xué)調(diào)查29-41
  • 1 實驗材料29-31
  • 1.1 豬血液樣品29
  • 1.2 主要藥品及試劑29-31
  • 1.3 主要器材31
  • 2 實驗方法31-34
  • 2.1 提取豬全血基因組DNA31-32
  • 2.2 兩種豬源附紅細(xì)胞體的特異基因擴(kuò)增32-33
  • 2.3 兩種豬源附紅細(xì)胞體引物擴(kuò)增陽性產(chǎn)物的純化(膠回收)33
  • 2.4 兩種豬源附紅細(xì)胞體16S rRNA部分目的基因克隆33-34
  • 2.5 兩種豬源附紅細(xì)胞體16SrRNA目的基因的鑒定(菌液PCR)34
  • 3 結(jié)果34-39
  • 3.1 兩種豬源附紅細(xì)胞體16SrRNA的特異性引物擴(kuò)增結(jié)果34-35
  • 3.2 兩種豬源附紅細(xì)胞體16SrRNA的目的基因的鑒定35-36
  • 3.3 測序結(jié)果及NCBI在線BLASR比對36-38
  • 3.4 上海地區(qū)豬源附紅細(xì)胞體流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果38-39
  • 4 討論39-40
  • 5 小結(jié)40-41
  • 第四章 小附紅細(xì)胞體人工感染豬模型初步建立41-50
  • 1 實驗材料41-43
  • 1.1 豬小附紅細(xì)胞體陽性血液樣品制備41
  • 1.2 實驗動物41
  • 1.3 主要試劑41-42
  • 1.4 主要儀器42-43
  • 2 試驗方法43-44
  • 2.1 預(yù)試驗43
  • 2.2 試驗動物分組及處理43
  • 2.3 檢測指標(biāo)43-44
  • 2.4 血液基因組的提取44
  • 2.5 PCR檢測44
  • 3 試驗結(jié)果44-48
  • 3.1 臨床癥狀44
  • 3.2 姬姆薩染色結(jié)果44-46
  • 3.3 血液PCR檢測46-48
  • 4 討論48-50
  • 全文結(jié)論50-51
  • 本實驗的創(chuàng)新點51-52
  • 參考文獻(xiàn)52-58
  • 致謝58-59
  • 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文59

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本文編號:390005

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