發(fā)布時間：2017-05-16 15:07

  本文關(guān)鍵詞：屠宰性狀的選育對大恒優(yōu)質(zhì)雞CAPN1、CAPN3及基因SNP位點的影響，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：鈣蛋白酶系統(tǒng)主要是由鈣蛋白酶和鈣蛋白酶抑制蛋白構(gòu)成,是細胞內(nèi)廣泛存在的一種酶系統(tǒng)。鈣蛋白酶主要行使其水解功能,水解肌肉中的蛋白質(zhì),從而影響肌肉的肉質(zhì)性狀。當鈣蛋白酶抑制蛋白與鈣蛋白酶發(fā)生結(jié)合后,鈣蛋白酶抑制蛋白行使其抑制作用,抑制鈣蛋白酶的活性,從而使蛋白質(zhì)的降解速率下降。本文選用四川畜牧科學研究院家禽所和四川大恒家禽育種有限公司培育的第9個世代的6個優(yōu)質(zhì)肉雞新品系,對其CAPN1、CAPN3及CAST基因進行SNPs掃描并分析這些SNPs位點與雞屠宰性狀的關(guān)聯(lián)性,并對比已有研究報道的第3世代上的相關(guān)數(shù)據(jù),分析這些突變位點在世代選育中的遺傳變化。實驗結(jié)果顯示：在第9世代的cAPN1上檢測到4個單核苷酸突變位點；這4個突變分別為外顯子6的G3535A(SNP1)突變,外顯子16的C7198A(SNP2)和G7324A(SNP3)突變以及內(nèi)含子3的G9950A(SNP4)突變。在CAST基因中檢測到1個單核苷酸突變位點,具體位置為：內(nèi)含子11上的G37868A(SNP7)突變。通過與屠體性狀相關(guān)性分析,在CAPN1基因上,SNP1可顯著影響胸肌重和皮下脂肪厚度(P0.05)；SNP2可顯著影響半凈膛率(P0.05),對腹脂重和腹脂率的影響極顯著(P0.01)；SNP3對活重和半凈膛率有著顯著影響(P0.05),對屠體重有極顯著影響(P0.01)；SNP4對活重、屠體重以及胸腿肌重具有顯著影響。在CAPN3基因上,SNP5可極顯著影響胸肌率(P0.01),并且在各品系中,TT基因型的個體極顯著高于群體中其它基因型個體(P0.01)。SNP6可顯著影響活體重和屠體重,CC基因型和等位基因C為優(yōu)勢基因型和優(yōu)勢等位基因；而SNP6對胸肌重和腿肌重達到極顯著影響,CC基因型極顯著高于CT和TT基因型(P0.01)。在CAST基因上SNP7可顯著影響活體重和屠體重(P0.05),且群體中AA和AG基因型的個體要顯著高于GG基因型的個體。通過分析CAPNl、CAPN3和CAST基因變異位點的基因頻率和基因型頻率,我們發(fā)現(xiàn)其頻率在第3世代和第9世代中均有一定的變化,其中對屠宰性狀有利的基因頻率上升,不利的下降。在對屠宰性狀的選育過程中,CAPN1、CAPN3及CAST基因頻率發(fā)生了變化。這幾個基因的SNP位點能真實遺傳到后代,可以將其作為雞遺傳育種的分子標記,用于家禽的分子育種。
【關(guān)鍵詞】：雞 鈣蛋白酶系統(tǒng)基因 多態(tài) 屠宰性狀
【學位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S831
【目錄】：

• 中文摘要5-6
• Abstract6-11
• 1 文獻綜述11-22
• 1.1 優(yōu)質(zhì)雞的研究現(xiàn)狀11-15
• 1.1.1 優(yōu)質(zhì)雞的定義11
• 1.1.2 優(yōu)質(zhì)雞的研究11-13
• 1.1.3 優(yōu)質(zhì)雞的培育13-15
• 1.2 影響肉質(zhì)的因素15-16
• 1.2.1 遺傳因素15
• 1.2.2 飼養(yǎng)管理因素15
• 1.2.3 動物體屠宰后肌肉的變化15-16
• 1.3 影響肉質(zhì)的候選基因16
• 1.4 鈣蛋白酶系統(tǒng)的研究進展16-21
• 1.4.1 CAPN1基因的研究進展16-18
• 1.4.2 CAPN3基因的研究進展18-19
• 1.4.3 CAST基因的研究進展19-21
• 1.5 SNP的檢測方法21
• 1.6 實驗?zāi)康呐c意義21-22
• 2 材料與方法22-29
• 2.1 實驗材料22
• 2.2 實驗所需試劑、藥品及其來源22-24
• 2.3 主要儀器設(shè)備24
• 2.4 主要生物學軟件24-25
• 2.5 實驗方法25-29
• 2.5.1 采血25
• 2.5.2 大恒優(yōu)質(zhì)雞屠體性狀的測定與數(shù)據(jù)收集25
• 2.5.3 全基因組DNA提取與檢測25-26
• 2.5.4 引物的設(shè)計與合成26-28
• 2.5.5 SNP引物的篩選28
• 2.5.6 統(tǒng)計分析28-29
• 3 實驗結(jié)果29-45
• 3.1 基因組DNA提取結(jié)果29-30
• 3.2 哈迪-溫伯格平衡30
• 3.3 不同世代屠體性狀的對比分析30-31
• 3.4 雞CAPN1基因的多態(tài)性及遺傳效應(yīng)31-37
• 3.4.1 CAPN1基因擴增片段的檢測31-32
• 3.4.2 CAPN1基因多態(tài)位點的檢測32-33
• 3.4.3 CAPN1基因各位點在不同世代間的基因頻率和基因型頻率33-35
• 3.4.4 CAPN1基因突變位點對雞屠宰性狀的相關(guān)性分析35-36
• 3.4.5 CAPN1基因型對屠宰性狀的遺傳效應(yīng)36-37
• 3.5 雞CAPN3基因的多態(tài)性及遺傳效應(yīng)37-42
• 3.5.1 CAPN3基因擴增片段的檢測37-38
• 3.5.2 CAPN3基因多態(tài)位點的檢測38-39
• 3.5.3 CAPN3基因各位點在不同世代間的基因頻率和基因型頻率39-40
• 3.5.4 CAPN3基因突變位點對雞屠宰性狀的相關(guān)性分析40-41
• 3.5.5 CAPN3基因型對屠宰性狀的遺傳效應(yīng)41-42
• 3.6 雞CAST基因的多態(tài)性及遺傳效應(yīng)42-45
• 3.6.1 CAST基因擴增片段的檢測42
• 3.6.2 CAST基因多態(tài)位點的檢測42-43
• 3.6.3 CAST基因各位點在不同世代間的基因頻率和基因型頻率43
• 3.6.4 CAST基因突變位點對雞屠宰性狀的相關(guān)性分析43-44
• 3.6.5 CAST基因單突變位點對屠宰性狀的遺傳效應(yīng)44-45
• 4 討論45-48
• 4.1 關(guān)于屠宰性狀對CAPN1基因SNP位點的影響45-46
• 4.1.1 CAPN1基因SNP位點在兩個世代中基因頻率的變化45
• 4.1.2 CAPN1基因變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析45-46
• 4.2 關(guān)于屠宰性狀對CAPN3基因SNP位點的影響46-47
• 4.2.1 CAPN3基因SNP位點在兩個世代中基因頻率的變化46
• 4.2.2 CAPN3基因變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析46-47
• 4.3 關(guān)于屠宰性狀對CAST基因SNP位點的影響47-48
• 4.3.1 CAST基因SNP位點在兩個世代中基因頻率的變化47
• 4.3.2 CAST基因變異與性狀的關(guān)聯(lián)分析47-48
• 5 結(jié)論48-49
• 參考文獻49-54
• 致謝54

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5 楊秀芹;劉慧;郭麗娟;關(guān)慶芝;許堯;劉娣;;豬CAPN1基因部分外顯子及3′UTR區(qū)的SNPs檢測[J];遺傳;2008年06期

6 郭彥;周國利;呂鑫;吳玉厚;;雞CAPN1基因3′-UTR多態(tài)性及其與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2010年12期

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本文編號：371159