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火地塘林區(qū)昆蟲(chóng)和桿狀病毒多樣性調(diào)查

發(fā)布時(shí)間:2017-05-16 11:27

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【摘要】:本文以火地塘地區(qū)不同海拔的昆蟲(chóng)種類和土壤桿狀病毒種類為研究對(duì)象,采用SDS-酚氯仿法提取土壤總DNA,第一次應(yīng)用PCR-DGGE技術(shù)對(duì)火地塘地區(qū)三個(gè)海拔土壤樣本的桿狀病毒多樣性進(jìn)行研究,分析了不同樣品間桿狀病毒群落多樣性的異同,了解3個(gè)海拔桿狀病毒多樣性,并分析昆蟲(chóng)種類與桿狀病毒種類相關(guān)性,取得的主要結(jié)果如下:1、對(duì)火地塘地區(qū)高(2344m)、中(1533m)、低(1043m)三個(gè)海拔昆蟲(chóng)種類進(jìn)行調(diào)查,中海拔地區(qū)(37.6種)低海拔地區(qū)(36.2種)高海拔地區(qū)(28.7種)。2、高海拔地區(qū)土壤樣品總共檢測(cè)桿狀病毒種類23種,平均為17.5種,香農(nóng)-威納多指數(shù)平均數(shù)為2.4444,均勻度均數(shù)為0.8586;通過(guò)比較群落相似度,最高的為QH5與QH7為93.6%,QH2與QH6相似度最低為27.9%,兩兩樣品相比結(jié)果相似度超過(guò)60%占總數(shù)的41.8%。3、中海拔地區(qū)土壤樣品總共檢測(cè)桿狀病毒種類30種,平均為19.889種,香農(nóng)-威納多指數(shù)平均數(shù)為2.376,均勻度均數(shù)為0.797;通過(guò)比較群落相似度,QM3與QM4的相似度最高為82%,QM7與QM9相似度最低為49.8%,兩兩樣品相比結(jié)果相似度超過(guò)60%占總數(shù)的95.6%,相似度極高。4、低海拔地區(qū)土壤樣品總共檢測(cè)桿狀病毒種類29種,平均為20.8種,香農(nóng)-威納多指數(shù)平均數(shù)為2.6329,均勻度均數(shù)為0.8704;比較群落相似度,QL2樣點(diǎn)與其他相比均偏低,兩兩樣品相比結(jié)果相似度超過(guò)60%占總數(shù)的80%,相似度較高。
【關(guān)鍵詞】:昆蟲(chóng)種類 PCR-DGGE 桿狀病毒
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:Q968;S476.13
【目錄】:
  • 摘要5-6
  • 英文摘要6-9
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述9-17
  • 1.1 秦嶺火地塘昆蟲(chóng)物種多樣性簡(jiǎn)介9
  • 1.2 土壤微生物種類9-10
  • 1.2.1 細(xì)菌9
  • 1.2.2 真菌9-10
  • 1.2.3 放線菌10
  • 1.2.4 桿狀病毒10
  • 1.3 土壤微生物多樣性研究方法10-13
  • 1.3.1 傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)法10-11
  • 1.3.2 生物標(biāo)記法11
  • 1.3.3 群落水平生理學(xué)指紋(CLPP)或單一碳源利用模式法(SSCU)11-12
  • 1.3.4 原位雜交技術(shù)(ISH)12
  • 1.3.5 基因芯片技術(shù)12
  • 1.3.6 DNA長(zhǎng)度多態(tài)性圖譜分析12-13
  • 1.3.7 DNA單鏈構(gòu)象多態(tài)性圖譜分析(SSCP)13
  • 1.4 變性梯度凝膠電泳(DGGE)13-15
  • 1.4.1 變性梯度凝膠電泳概述13-14
  • 1.4.2 PCR-DGGE技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)14-15
  • 1.4.3 PCR-DGGE技術(shù)的缺點(diǎn)15
  • 1.5 研究?jī)?nèi)容與技術(shù)路線15-17
  • 1.5.1 研究?jī)?nèi)容及意義15-16
  • 1.5.2 技術(shù)路線16-17
  • 第二章 材料與方法17-24
  • 2.1 實(shí)驗(yàn)材料17
  • 2.1.1 昆蟲(chóng)種類調(diào)查17
  • 2.1.2 土壤的采集及保存17
  • 2.1.2.1 采樣點(diǎn)選取17
  • 2.1.2.2 采樣17
  • 2.2 試劑和儀器17-20
  • 2.2.1 實(shí)驗(yàn)儀器17-18
  • 2.2.2 主要試劑和溶液18-20
  • 2.2.2.1 主要試劑18-19
  • 2.2.2.2 主要溶液19-20
  • 2.3 實(shí)驗(yàn)方法20-24
  • 2.3.1 土壤總DNA的提。ㄒ匀A 2005)20
  • 2.3.2 引物設(shè)計(jì)20
  • 2.3.3 PCR擴(kuò)增20-21
  • 2.3.4 目的基因片段的純化21
  • 2.3.5 變性凝膠梯度電泳(DGGE)及染色21-22
  • 2.3.6 DGGE條帶切膠回收22
  • 2.3.7 多樣性的研究方法22-24
  • 第三章 結(jié)果與分析24-36
  • 3.1 昆蟲(chóng)種類調(diào)查結(jié)果24
  • 3.2 土壤DNA提取結(jié)果24-25
  • 3.3 特異性引物的PCR擴(kuò)增25
  • 3.4 DGGE電泳25-35
  • 3.4.1 高海拔地區(qū)25-28
  • 3.4.1.1 DGGE電泳結(jié)果與圖譜分析25-27
  • 3.4.1.2 DGGE圖譜的多樣性分析27-28
  • 3.4.1.3 豐度(S)、香農(nóng)-威納多指數(shù)(H)、均勻度(Eh)28
  • 3.4.2 中海拔地區(qū)28-31
  • 3.4.2.1 DGGE電泳結(jié)果與圖譜分析28-30
  • 3.4.2.2 DGGE圖譜的多樣性分析30-31
  • 3.4.2.3 豐度(S)、香農(nóng)-威納多指數(shù)(H)、均勻度(Eh)31
  • 3.4.3 低海拔地區(qū)31-34
  • 3.4.3.1 DGGE電泳結(jié)果與圖譜分析31-33
  • 3.4.3.2 DGGE圖譜的多樣性分析33-34
  • 3.4.3.3 豐度(S)、香農(nóng)-威納多指數(shù)(H)、均勻度(Eh)34
  • 3.4.4 DGGE條帶的PCR檢測(cè)34-35
  • 3.5 昆蟲(chóng)種類數(shù)與桿狀病毒種類數(shù)的相關(guān)性分析35-36
  • 第四章 結(jié)論36-37
  • 第五章 討論37-38
  • 參考文獻(xiàn)38-42
  • 致謝42-43
  • 作者簡(jiǎn)介43

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 宋培勇;馬莉莉;王慶容;李黛;魏志琴;;宏基因組技術(shù)及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J];貴州農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年10期

2 陳桐生;李建軍;岑英華;孫國(guó)萍;;DG-DGGE分析除臭生物濾池微生物多樣性[J];應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào);2006年01期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 接偉光;黃檗(Phellodendron amurense)叢枝菌根真菌鑒定及菌群結(jié)構(gòu)分析[D];黑龍江大學(xué);2008年


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本文編號(hào):370741

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