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肉用牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與分析

發(fā)布時間:2022-01-17 17:16
  堿性螺旋環(huán)螺旋(bHLH)轉(zhuǎn)錄因子屬于真核生物蛋白當(dāng)中的一個大家族,其在細(xì)胞增殖與細(xì)胞分化,神經(jīng)元的分化,肌肉組織與器官的發(fā)生,腸組織發(fā)育以及性別決定等生長發(fā)育過程中有重要作用。牛是哺乳類偶蹄目的草食性反芻動物,作為奶,肉以及皮革等的來源,與人類生活密切相關(guān)。家牛的基因組中有80%的基因與人類基因達(dá)到共享,并且家牛與人類的遺傳相似性高于老鼠與人類的遺傳相似性,理論上可作為研究人類疾病的動物模型。牦牛能夠適應(yīng)高原環(huán)境,表現(xiàn)在其心臟以及肺發(fā)達(dá)、沒有肺動脈高壓、覓食能力強(qiáng)且能量代謝高等解剖學(xué)和生理學(xué)性狀,通過將人類基因組與牛等動物的基因組進(jìn)行比較,便于更加全面與深入地理解人類疾病的基因基礎(chǔ)。bHLH轉(zhuǎn)錄因子序列大約由60個氨基酸殘基組成,是由位于氨基端的堿性結(jié)構(gòu)域(b)和位于羧基端的螺旋環(huán)螺旋結(jié)構(gòu)域(HLH)兩部分組成的高度保守的蛋白質(zhì)因子。堿性區(qū)域的功能是與特定的六核苷酸DNA序列結(jié)合,螺旋環(huán)螺旋結(jié)構(gòu)域是通過與其他HLH蛋白形成同源或異緣二聚體進(jìn)而發(fā)揮其功能。根據(jù)bHLH蛋白與核心的六核苷酸序列的結(jié)合特異性以及蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域的特點(diǎn)對bHLH蛋白進(jìn)行分類,將其劃分為A,B,C,D,E,F... 

【文章來源】:阜陽師范大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】:79 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
    1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類
        1.1 動物bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類
        1.2 植物和真菌bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類
    2 已報道的bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員鑒定結(jié)果
    3 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
        3.1 動物bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
        3.2 植物與真菌bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
    4 研究目的及意義
    5 研究內(nèi)容與技術(shù)路線
        5.1 研究內(nèi)容
        5.2 技術(shù)路線
第2章 家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與分類
    1 材料
        1.1 118 條人bHLH基序
        1.2 生物信息學(xué)工具
    2 方法與步驟
        2.1 BLASTP和TBLASTN搜索
        2.2 刪除冗余和序列核查
        2.3 序列比對
        2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
    3 結(jié)果與討論
        3.1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的鑒定與分類
        3.2 bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的命名
    4 本章小結(jié)
第3章 家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能分析
    1 材料
        1.1 家牛和牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子序列
        1.2 生物信息工具
    2 方法與步驟
        2.1 KOBAS對家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
        2.2 DAVID對家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
        2.3 STRING對家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
    3 結(jié)果與分析
        3.1 KOBAS對家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
        3.2 KOBAS對牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
        3.3 DAVID對家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
        3.4 DAVID對牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
        3.5 STRING對家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
    4 本章小結(jié)
第4章 結(jié)論和展望
    1 結(jié)論
    2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
后記
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 劉文文,李文學(xué).  生物技術(shù)進(jìn)展. 2013(01)
[2]動物bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員及其功能[J]. 王勇,姚勤,陳克平.  遺傳. 2010(04)



本文編號:3595121

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