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布魯氏菌快速核酸檢測(cè)方法的建立

發(fā)布時(shí)間:2021-11-13 17:06
  布魯氏菌病(Brucellosis,簡(jiǎn)稱(chēng)“布病”)是由胞內(nèi)寄生菌——布魯氏菌(Brucella spp.)引起的一種人獸共患傳染病,該病嚴(yán)重影響我國(guó)的畜牧業(yè)的發(fā)展,造成重大經(jīng)濟(jì)損失。我國(guó)目前對(duì)布魯氏菌病的檢測(cè)主要以細(xì)菌學(xué)、血清學(xué)檢測(cè)方法為主,這些方法存在著費(fèi)時(shí)費(fèi)力、假陽(yáng)性、以及無(wú)法區(qū)分死菌等缺點(diǎn),同時(shí)不能對(duì)病原進(jìn)行快速檢測(cè)和種間鑒定。因此,開(kāi)發(fā)布魯氏菌病快速檢測(cè)方法對(duì)布病的防控與凈化具有重要意義。本課題致力于研究布魯氏菌的快速檢測(cè)方法,以核酸擴(kuò)增技術(shù)為基礎(chǔ),建立一系列檢測(cè)方法,為布魯氏菌病的科學(xué)研究、防控與凈化,提供切實(shí)有效的布魯氏菌檢測(cè)技術(shù)手段。1、通過(guò)將疊氮溴化丙錠(Propidium Monoazide,PMA)與熒光定量PCR(Fluorescence Quantitative PCR,qPCR)結(jié)合建立一種布魯氏菌活菌數(shù)的快速定量檢測(cè)方法。以布魯氏菌單拷貝BCSP31基因?yàn)闄z測(cè)靶標(biāo),構(gòu)建重組標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。優(yōu)化qPCR反應(yīng)條件及PMA最佳應(yīng)用濃度與曝光時(shí)間,對(duì)該方法的靈敏度、特異性、重復(fù)性等進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,CT值與標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒拷貝數(shù)濃度對(duì)數(shù)值之間線(xiàn)性關(guān)系良好;靈敏度為... 

【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:118 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

布魯氏菌快速核酸檢測(cè)方法的建立


Bruce-ladder法對(duì)布魯氏菌進(jìn)行種間鑒定[85]

原理圖,探針,原理,熒光


第一篇文獻(xiàn)綜述第2章基于核酸擴(kuò)增技術(shù)的檢測(cè)方法及其應(yīng)用16基團(tuán),對(duì)整個(gè)擴(kuò)增過(guò)程進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控,將每個(gè)擴(kuò)增反應(yīng)所產(chǎn)生的熒光信號(hào)進(jìn)行檢測(cè)、收集,最終利用已知量的標(biāo)準(zhǔn)品構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)對(duì)未知樣本進(jìn)行定量分析,實(shí)現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍。該技術(shù)目前常用的熒光物質(zhì)主要分為探針類(lèi)和染料類(lèi)兩大類(lèi)。1)TaqMan探針TaqMan探針是一段能與目的片段特異結(jié)合的核酸序列,如圖2所示,該序列的5"標(biāo)記熒光報(bào)告基團(tuán),3"端標(biāo)記淬滅基團(tuán),探針處于完整狀態(tài)時(shí),熒光基團(tuán)所釋放的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)所吸收。當(dāng)擴(kuò)增反應(yīng)開(kāi)始時(shí),引物與探針都與模板鏈特異性結(jié)合,隨著擴(kuò)增反應(yīng)的開(kāi)始,探針鏈逐漸被鏈置換反應(yīng)所替代,探針將會(huì)被DNA聚合酶的5"-3"外切酶活性所水解,此時(shí)熒光基團(tuán)釋放的熒光信號(hào)就會(huì)隨著擴(kuò)增反應(yīng)的進(jìn)行被儀器監(jiān)測(cè)。熒光信號(hào)的強(qiáng)度達(dá)到儀器所設(shè)置的某一閾值時(shí),此時(shí)的循環(huán)次數(shù)(CT值)就被記錄下來(lái),CT值與目的基因拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)值成線(xiàn)性關(guān)系,從而對(duì)目標(biāo)物達(dá)到定量的目的[98]。圖2TaqMan探針技術(shù)作用原理[99]Fig.2TheprincipleofTaqManProbetechnology2)雜交探針(HybProbe)雜交探針是由兩個(gè)寡核苷酸探針?biāo)M成,該探針率先由羅氏公司(Roche)所發(fā)明并應(yīng)用于熒光定量PCR的檢測(cè)。如圖3所示,兩個(gè)寡核苷酸探針?lè)謩e標(biāo)記熒光供體和熒光受體,當(dāng)PCR反應(yīng)退火復(fù)性時(shí),兩個(gè)探針同與一條模板鏈進(jìn)行雜交,熒光供體與熒光受體相接近,熒光供體被外來(lái)光源激發(fā),其釋放的能量

原理圖,探針,公司,原理


第一篇文獻(xiàn)綜述第2章基于核酸擴(kuò)增技術(shù)的檢測(cè)方法及其應(yīng)用17通過(guò)熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)傳遞給熒光受體,而受體所釋放的熒光信號(hào)則被儀器檢測(cè)到,隨著擴(kuò)增反應(yīng)的進(jìn)行,DNA產(chǎn)物越多,其釋放的熒光信號(hào)就越大,從而對(duì)目標(biāo)物達(dá)到定量的目的圖3雜交探針技術(shù)作用原理(引自Roche公司)Fig.3TheprincipleofHybridizationProbetechnology3)分子信標(biāo)探針(MulecularBeaconsProbe)分子信標(biāo)探針為新型探針,該探針需要特定結(jié)構(gòu)的序列,設(shè)計(jì)要求高。特點(diǎn)在于其為莖環(huán)狀的發(fā)卡結(jié)構(gòu),如圖4所示。該探針的莖環(huán)是由15~30個(gè)核苷酸組成,莖臂一般由5~7個(gè)核苷酸組成,其兩端序列互補(bǔ)配對(duì),分別標(biāo)記有熒光基團(tuán)和淬滅集團(tuán)。當(dāng)無(wú)靶標(biāo)時(shí),探針成自由狀態(tài),形成穩(wěn)定的莖環(huán)發(fā)卡結(jié)構(gòu),熒光基團(tuán)被激發(fā)產(chǎn)生的熒光信號(hào)被淬滅集團(tuán)所淬滅,當(dāng)探針與模板鏈成功雜交時(shí),可形成線(xiàn)性結(jié)構(gòu),熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)間隔較遠(yuǎn),淬滅基團(tuán)失去作用,此時(shí)所激發(fā)的熒光信號(hào)可被儀器監(jiān)測(cè)到。圖4分子信標(biāo)探針技術(shù)作用原理(引自Roche公司)Fig.4TheprincipleofMulecularBeaconsProbetechnology4)熒光染料熒光染料的工作原理較簡(jiǎn)單,如圖5所示,當(dāng)熒光染料與雙鏈擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)合時(shí),會(huì)產(chǎn)生較強(qiáng)的熒光信號(hào),進(jìn)而被儀器監(jiān)測(cè)到,熒光信號(hào)的強(qiáng)度與反應(yīng)體系內(nèi)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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[2]牛布魯氏菌病熒光標(biāo)記免疫層析試紙條檢測(cè)技術(shù)研究[D]. 吳彤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]基于PCR的天麻、Hg2+檢測(cè)方法及PCR結(jié)合DiSC2(5)的一步可視化檢測(cè)法的建立[D]. 王巍.成都中醫(yī)藥大學(xué) 2015
[4]牛羊豬犬種布魯氏菌多重PCR方法的建立及試劑盒研制[D]. 陳思.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2014
[5]循環(huán)探針熒光定量PCR方法用于布魯氏菌分種的研究以及布魯氏菌LAMP可視化檢測(cè)方法的建立[D]. 許鄒亮.揚(yáng)州大學(xué) 2011
[6]布魯氏菌熒光定量PCR快速檢測(cè)方法的建立及檢測(cè)試劑盒的組裝[D]. 李光輝.吉林大學(xué) 2006



本文編號(hào):3493385

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