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海南島油茶種質資源的分子鑒定及遺傳多樣性評價

發(fā)布時間:2021-10-12 05:53
  油茶是中國重點發(fā)展的木本油料作物,海南島是中國油茶資源分布最南緣地區(qū),資源和產業(yè)發(fā)展特色明顯。由于海南島油茶資源研究與開發(fā)利用起步晚,國內外對該資源的系統(tǒng)評價尚未開展,關于海南島油茶資源的分類問題仍無定論,這對海南島特異油茶資源的保護與創(chuàng)新利用、海南特色油茶產業(yè)發(fā)展極為不利。同時,油茶組物種的分類和歸并問題存在較大的分歧。此外,對包括海南島油茶資源在內的國內越南油茶資源進行評價,以進一步明確海南島油茶的資源特色,了解海南島油茶資源的遺傳多樣性水平和遺傳結構,為相關資源的創(chuàng)新利用和保護提供科學依據(jù)。因此,本研究對42個居群共867份油茶種質資源材料進行分子分析,基于ISSR和SRAP標記技術,分析山茶屬油茶組普通油茶、越南油茶、小果油茶、高州油茶、陸川油茶,以及香花油茶的分類地位與親緣關系,并對海南島油茶種質資源資源進行分類鑒定;同時,基于SRAP標記評價海南島油茶資源和中國越南油茶資源的遺傳多樣性,分析居群間的遺傳結構和分化。主要研究結果如下:(1)以海南島油茶基因組DNA為模板,采用單因素試驗和正交試驗相結合方法,建立海南島油茶SRAP-PCR最優(yōu)體系,即在20μL體系中包含:10×... 

【文章來源】:海南大學海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:107 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

海南島油茶種質資源的分子鑒定及遺傳多樣性評價


DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測Fig.2-1AgarosegelelectrophoresisofgemomicDNA

反應體,模板,用量,濃度


海南大學碩士學位論文21圖2-1DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測Fig.2-1AgarosegelelectrophoresisofgemomicDNA2.2.2海南島油茶SRAP-PCR單因素試驗(1)模板DNA用量對SRAP-PCR擴增PCR反應中模板DNA用量是關鍵因素之一。不同用量DNA模板對海南島油茶SRAP-PCR反應體系影響不大,本研究設置DNA用量梯度范圍內均能擴增獲得條帶,且清晰度和背景深度差異較。▓D2-2)。當模板DNA濃度大于60ng時,條帶數(shù)量少且清晰度略低;當模板DNA濃度5~60ng時,條帶清晰,帶型保持一致。正交試驗選用5~60ng模板DNA用量梯度水平。圖2-2DNA模板用量和dNTPs濃度對SRAP-PCR反應體系的影響Fig.2-2EffectofconcentrationoftemplateDNAanddNTPsonSRAP-PCRreactionsystem注:M:100bpDNAMarker;1~10:1ng,5ng,20ng,40ng,60ng,80ng,100ng,120ng,160ng,200ng;11~20:0.025mmol/L,0.05mmol/L,0.1mmol/L,0.15mmol/L,0.2mmol/L,0.25mmol/L,0.375mmol/L,0.5mmol/L,0.75mmol/L,1.0mmol/LNote:M:100bpDNAMarker;1~10:1ng,5ng,20ng,40ng,60ng,80ng,100ng,120ng,160ng,200ng;11~20:0.025mmol/L,0.05mmol/L,0.1mmol/L,0.15mmol/L,0.2mmol/L,0.25mmol/L,0.375mmol/L,0.5mmol/L,0.75mmol/L,1.0mmol/L(2)dNTPs濃度對SRAP-PCR擴增PCR反應中dNTPs濃度影響擴增反應效率,濃度過低效率降低,條帶數(shù)量減少、

濃度,反應體,引物


跎伲?邐?紉菜嬤?檔停?踔廖薹ü鄄斕。因此??皇匝檠≡?.05~0.20mmol/LdNTPs濃度梯度水平。(3)TaqDNA聚合酶用量對SRAP-PCR擴增TaqDNA聚合酶用量對PCR反應的最終結果影響重大,過低濃度的TaqDNA聚合酶會導致產物數(shù)量減少,甚至無法擴增,而高濃度的聚合酶又會導致非特異性擴增。當TaqDNA聚合酶濃度為1U以下時,條帶數(shù)量少且不清晰;TaqDNA聚合酶濃度為1U以上時,TaqDNA聚合酶濃度和產物擴增數(shù)量呈正相關;當TaqDNA聚合酶濃度為5U時,泳道10條帶模糊(圖2-3)。故正交試驗選擇1.5~4.0U的TaqDNA聚合酶濃度梯度水平。圖2-3Taq酶濃度和和引物濃度對SRAP-PCR反應體系的影響Fig.2-3EffectofTaqDNApolymeraseandprimerconcentrationonSRAP-PCRreactionsystem注:M:100bpDNAMarker;1~10:0.05U,0.25U,0.5U,0.75U,1U,1.5U,2.0U,3.0U,4.0U,5.0U;11~20:0.025μmol/L,0.05μmol/L,0.1μmol/L,0.2μmol/L,0.4μmol/L,0.5μmol/L,0.6μmol/L,0.7μmol/L,0.9μmol/L,1.2μmol/LNote:M:100bpDNAMarker;1~10:0.05U,0.25U,0.5U,0.75U,1U,1.5U,2.0U,3.0U,4.0U,5.0U;11~20:0.025μmol/L,0.05μmol/L,0.1μmol/L,0.2μmol/L,0.4μmol/L,0.5μmol/L,0.6μmol/L,0.7μmol/L,0.9μmol/L,1.2μmol/L(4)引物濃度對SRAP-PCR擴增引物濃度處于0.20~0.60μmol/L時,泳道14至泳道17的條帶清晰、穩(wěn)定,帶型一致;引物濃度低于0.20μmol/L時,泳道11至泳道13條帶數(shù)量較少且不清晰;當引物濃度高于0.60μmol/L時,泳道18至泳道20擴增出的條帶數(shù)量開始減少,清晰度也隨之減弱(圖2-3)。因此,本研究正交試驗選擇0.20~0.60μmol/L的引物濃度梯

【參考文獻】:
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[4]小果油茶遺傳多樣性分析及雜交漸滲研究[D]. 黃勇.中國林業(yè)科學研究院 2011

碩士論文
[1]利用形態(tài)學和SSR標記分析中國紫心甘薯育成品種遺傳多樣性[D]. 高閏飛.中國農業(yè)科學院 2019
[2]普通油茶優(yōu)良無性系的遺傳差異分析及授粉樹配置[D]. 李祥勝.福建農林大學 2019
[3]普通油茶優(yōu)良基因型的遺傳多樣性及雜交可配性研究[D]. 任衛(wèi).福建農林大學 2018
[4]黎蒴與廣寧紅花油茶種質資源遺傳多樣性研究[D]. 謝薈.華南農業(yè)大學 2016
[5]5種山茶屬野生油茶ISSR親緣關系研究及指紋圖譜的構建[D]. 李國帥.中南林業(yè)科技大學 2014
[6]油茶種質資源多樣性的ISSR分析[D]. 周蘭英.湖南師范大學 2014
[7]茶油多酚分析及其抗氧化穩(wěn)定性研究[D]. 廖義秀.中南林業(yè)科技大學 2013
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[9]SRAP標記技術優(yōu)化與湖北油茶遺傳多樣性研究[D]. 左雪枝.華中農業(yè)大學 2012
[10]油茶種質資源遺傳多樣性分析及品種鑒定[D]. 吳鶯鶯.南京林業(yè)大學 2011



本文編號:3432011

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