干擾素調節(jié)因子（Interferon regulatory factors,IRFs）是一類重要的轉錄因子,可結合干擾素（Interferon,IFN）和干擾素誘導基因（Interferon-stimulated gene,ISG）的啟動子區(qū)調控其表達,在抗病毒、抗腫瘤,細胞增殖和凋亡等過程中發(fā)揮著重要的作用。至今,在魚類中已報道了11個IRF家族成員,即IRF1-11,其中IRF11為硬骨魚類中所特有的。本論文以日本鰻鱺為研究對象,對其IRF11的功能特征進行了初步探討,主要結果如下:克隆獲得了日本鰻鱺IRF11基因（AjIRF11）,其cDNA全長1321 bp,編碼281個氨基酸,蛋白分子量理論值為31.97 kDa。序列分析結果顯示,AjIRF11屬于IRF1亞家族成員,其DBD結構域包含6個保守的色氨酸殘基。基因共線性分析結果顯示,AjIRF11的上游基因和下游基因分別為CHS1和KIF1BP,其下游基因鏈與腔棘魚和斑點雀鱔IRF11下游基因鏈一致,在棘鰭類中,IRF11基因均位于IL4R.1和NIP7基因之間,推測IRF11基因可能在硬骨魚類進化過程中經歷了譜系特異性的基因... 

【文章來源】：集美大學福建省

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1日本鰻鱺IRF11基因的cDNA序列及推導的氨基酸序列

集美大學碩士學位論文日本鰻鱺干擾素調節(jié)因子11（IRF11）的轉錄調控及功能的初步研究19圖2-2日本鰻鱺IRF11與其它脊椎動物IRFs的系統(tǒng)進化分析利用ClustalX2對IRFs進行多重序列比對，利用MEGA7軟件，采用NJ（Neighbor-Joining）法繪制系統(tǒng)進化樹。節(jié)點上的數(shù)字為bootstrap的置信度。Fig.2-2PhylogeneticanalysisofIRF11inJapaneseeelandothervertebrateIRFsThemultiplesequencealignmentofIRFsiscarriedoutbyClustalX2,andthephylogenetictreeisdrawnbyNJ(Neighbor-Joining)methodusingMEGA7software.Bootstrapvaluesareindicatedatnodes.

集美大學碩士學位論文日本鰻鱺干擾素調節(jié)因子11（IRF11）的轉錄調控及功能的初步研究20圖2-3脊椎動物IRFsDBD結構域多重比對序列上方的實心框、箭頭和線分別表示α螺旋，β折疊和環(huán)的相對位置。DBD中的保守的色氨酸殘基（W）用灰色陰影表示�！�*”表示相同殘基，“.和:”表示相似殘基。Fig.2-3MultiplealignmentoftheDBDdomainsofvertebrateIRFsSolidboxes,arrows,andlinesabovethesequenceindicatetherelativepositionsofthealphahelix,thebetafold,andtheloop,respectively.Conservedtryptophanresidues(W)inDBDareindicatedingreyshading.Similarresiduesareindicatedwithdotsandcolons.2.3.3基因共線性分析本研究克隆獲得的日本鰻鱺IRF11基因位于日本鰻鱺基因組數(shù)據庫ANJA000034，對其上下游基因預測發(fā)現(xiàn)，IRF11的上游和下游基因分別為CHS1（Chitinsynthase1）和KIF1BP（Kif1bindingprotein），其下游基因鏈為KIF1BP-VPSA26A-SUPV3L1-HKDC1-HK1-TACR2-TSPAN15-RUFY2，與腔棘魚和斑點雀鱔IRF11下游基因鏈一致，而在斑馬魚基因組中這個基因鏈則在IRF11下游約22Mbp左右（如圖2-4A所示）。在棘鰭類中，IRF11基因都位于IL4R.1（Interleukin4receptor,tandemduplicate1）和NIP7（Nucleolar


本文編號：3225639