水稻劍葉維管束性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-18 19:31
水稻的光合作用受到葉片維管束系統(tǒng)的影響,在此過程中,細(xì)胞分化模式對(duì)于維持葉片光合作用起著重要的作用。葉片維管束和葉肉面積與水稻產(chǎn)量密切相關(guān)。但目前對(duì)水稻葉片維管束相關(guān)性狀的遺傳分析仍知之甚少。本研究利用386份水稻種質(zhì)資源為試材,在總?cè)后w、秈稻亞群和粳稻亞群對(duì)水稻葉片大、小維管束數(shù)和面積,維管束間的距離,以及維管束間葉肉面積進(jìn)行兩年的全基因組關(guān)聯(lián)分析。檢測(cè)影響水稻葉片維管束相關(guān)性狀的主效QTL,將重要QTL區(qū)間內(nèi)的所有基因的SNP進(jìn)行單倍型分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,預(yù)測(cè)可能的候選基因。研究結(jié)果具體如下:1.水稻386份種質(zhì)資源在劍葉維管束數(shù)量和面積,維管束間的距離,以及維管束間葉肉面積上表現(xiàn)廣泛的遺傳變異。這13個(gè)葉片維管束相關(guān)性狀在水稻秈粳亞種間均存在顯著的差異。大、小維管束面積與維管束間葉肉面積呈極顯著的正相關(guān)。2.本研究利用3K RGP水稻重測(cè)序數(shù)據(jù)庫中的4.8M SNP基因型數(shù)據(jù),在總?cè)后w、秈稻亞群和粳稻亞群分別檢測(cè)到71、50和44個(gè)影響水稻葉片維管束性狀的QTL。其中70個(gè)QTL在兩年同時(shí)檢測(cè)到,5個(gè)QTL在總?cè)后w和秈稻亞群同時(shí)檢測(cè)到,26個(gè)QTL在總?cè)后w和粳稻亞群同時(shí)檢測(cè)...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
1.1 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的構(gòu)造和功能
1.2 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的發(fā)育調(diào)控機(jī)制
1.2.1 細(xì)胞機(jī)制
1.2.2 分子機(jī)制
1.2.3 植物激素的影響
1.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.3.1 全基因組關(guān)聯(lián)分析概述
1.3.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析在水稻中的應(yīng)用
1.4 試驗(yàn)的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.3 表型鑒定
2.4 表型數(shù)據(jù)分析
2.5 基因型數(shù)據(jù)分析
2.6 全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.7 候選基因的單倍型分析
3 結(jié)果分析
3.1 葉片維管束性狀的表型觀察
3.1.1 表型變異
3.1.2 相關(guān)性分析
3.2 SNP的基因型與群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.1 基因型分析
3.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.4 候選基因分析
3.5 QTL表達(dá)的一因多效性
4 討論
4.1 候選基因分析
4.2 水稻產(chǎn)量性狀的育種應(yīng)用
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜素內(nèi)酯調(diào)控植物生長發(fā)育及產(chǎn)量品質(zhì)研究進(jìn)展[J]. 肖瑞雪,郭麗麗,賈琦石,郭大龍,侯小改. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(10)
[2]植物B3轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和功能[J]. 劉穎慧,董志平. 分子植物育種. 2017(05)
[3]水稻復(fù)雜性狀研究的新途徑:水稻重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯青青,司麗珍,黃學(xué)輝,韓斌. 生命科學(xué). 2016(10)
[4]水稻ABC1基因家族的鑒定及在非生物脅迫下的表達(dá)分析[J]. 高清松,張丹,徐亮,徐辰武. 中國水稻科學(xué). 2011(01)
[5]一個(gè)水稻大葉角度突變體lla的遺傳分析及基因克隆[J]. 汪得凱,張紅心,胡國成,付亞萍,斯華敏,孫宗修. 科學(xué)通報(bào). 2005(04)
[6]水稻理想株形育種的理論和方法初論[J]. 楊守仁,張龍步,王進(jìn)民. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1984(03)
博士論文
[1]水稻苗期稻瘟病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王彩紅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]水稻卷葉突變體的細(xì)胞形成機(jī)制以及OUL1基因的克隆和功能研究[D]. 鄒良平.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
碩士論文
[1]水稻窄卷葉突變體nrl4的遺傳分析與基因定位[D]. 梁容.浙江大學(xué) 2017
[2]水稻矮化寬葉突變體dw1的鑒定與功能分析[D]. 廖紅香.西南大學(xué) 2016
本文編號(hào):3194360
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 前言
1.1 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的構(gòu)造和功能
1.2 水稻葉片維管束相關(guān)性狀的發(fā)育調(diào)控機(jī)制
1.2.1 細(xì)胞機(jī)制
1.2.2 分子機(jī)制
1.2.3 植物激素的影響
1.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.3.1 全基因組關(guān)聯(lián)分析概述
1.3.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析在水稻中的應(yīng)用
1.4 試驗(yàn)的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.3 表型鑒定
2.4 表型數(shù)據(jù)分析
2.5 基因型數(shù)據(jù)分析
2.6 全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.7 候選基因的單倍型分析
3 結(jié)果分析
3.1 葉片維管束性狀的表型觀察
3.1.1 表型變異
3.1.2 相關(guān)性分析
3.2 SNP的基因型與群體結(jié)構(gòu)分析
3.2.1 基因型分析
3.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
3.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析
3.4 候選基因分析
3.5 QTL表達(dá)的一因多效性
4 討論
4.1 候選基因分析
4.2 水稻產(chǎn)量性狀的育種應(yīng)用
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜素內(nèi)酯調(diào)控植物生長發(fā)育及產(chǎn)量品質(zhì)研究進(jìn)展[J]. 肖瑞雪,郭麗麗,賈琦石,郭大龍,侯小改. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(10)
[2]植物B3轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和功能[J]. 劉穎慧,董志平. 分子植物育種. 2017(05)
[3]水稻復(fù)雜性狀研究的新途徑:水稻重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 侯青青,司麗珍,黃學(xué)輝,韓斌. 生命科學(xué). 2016(10)
[4]水稻ABC1基因家族的鑒定及在非生物脅迫下的表達(dá)分析[J]. 高清松,張丹,徐亮,徐辰武. 中國水稻科學(xué). 2011(01)
[5]一個(gè)水稻大葉角度突變體lla的遺傳分析及基因克隆[J]. 汪得凱,張紅心,胡國成,付亞萍,斯華敏,孫宗修. 科學(xué)通報(bào). 2005(04)
[6]水稻理想株形育種的理論和方法初論[J]. 楊守仁,張龍步,王進(jìn)民. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 1984(03)
博士論文
[1]水稻苗期稻瘟病抗性的全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 王彩紅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]水稻卷葉突變體的細(xì)胞形成機(jī)制以及OUL1基因的克隆和功能研究[D]. 鄒良平.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
碩士論文
[1]水稻窄卷葉突變體nrl4的遺傳分析與基因定位[D]. 梁容.浙江大學(xué) 2017
[2]水稻矮化寬葉突變體dw1的鑒定與功能分析[D]. 廖紅香.西南大學(xué) 2016
本文編號(hào):3194360
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