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核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的比較研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-19 18:06

  本文關(guān)鍵詞:核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的比較研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的一種人畜共患傳染病,結(jié)核分枝桿菌是人和動(dòng)物結(jié)核病的主要病原。人結(jié)核病和動(dòng)物結(jié)核病是可以相互傳染的,人類(lèi)的結(jié)核病可以通過(guò)呼吸或飛沫傳給人或其他動(dòng)物,動(dòng)物結(jié)核病除了通過(guò)呼吸或飛沫外,還可以通過(guò)一些動(dòng)物產(chǎn)品如肉、奶、蛋等畜產(chǎn)品進(jìn)行傳播。目前,最為常見(jiàn)的動(dòng)物結(jié)核就是牛結(jié)核病,它不僅給畜牧業(yè)帶來(lái)嚴(yán)重的影響,并且給人類(lèi)的健康安全也造成了很大的威脅。近年來(lái),人結(jié)核病的發(fā)病率明顯上升,特別是兒童腸結(jié)核的發(fā)病率明顯增加,有報(bào)道顯示,從這些兒童患者中分離的30%的菌株為牛分枝桿菌。結(jié)核病的實(shí)驗(yàn)室診斷是發(fā)現(xiàn)傳染源的主要途徑和手段,同時(shí)也是確定結(jié)核病診斷、切斷傳播途徑并制定治療方案的重要依據(jù)。由于傳統(tǒng)的檢測(cè)方法不夠完善,如檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng)、靈敏性與特異性不高、對(duì)設(shè)備要求高等。因此,建立快速、準(zhǔn)確、靈敏、價(jià)格低廉的結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室診斷方法對(duì)結(jié)核病控制有著極為重要的意義。目的:建立一種快速、準(zhǔn)確、價(jià)格低廉易于臨床推廣的,并可以運(yùn)用于畜產(chǎn)品中結(jié)核分枝桿菌檢測(cè)的方法。方法:通過(guò)優(yōu)化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)與RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)(Simultaneous amplification and testing,SAT)的反應(yīng)條件與體系,建立起兩種可以用于牛乳中結(jié)核分枝桿菌檢測(cè)的核酸擴(kuò)增方法。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)對(duì)牛奶中結(jié)核分枝桿菌的DNA和RNA的提取方法以及對(duì)每種方法的反應(yīng)體系、反應(yīng)溫度、反應(yīng)時(shí)間進(jìn)行優(yōu)化,并對(duì)牛乳中結(jié)核分枝桿菌檢測(cè)的靈敏度、特異性、重復(fù)性進(jìn)行檢測(cè),確定這兩種方法對(duì)牛乳中結(jié)核分枝桿菌的最低檢測(cè)濃度(靈敏度)。同時(shí)還將環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)與RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)同結(jié)核羅氏培養(yǎng)技術(shù)、抗酸染色鏡檢、PCR技術(shù)進(jìn)行比較,評(píng)價(jià)與分析各種檢測(cè)方法對(duì)牛乳中結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè)結(jié)果,以確定最佳檢測(cè)方法,為臨床應(yīng)用提供參考依據(jù)。結(jié)果:環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)和RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)的靈敏度、特異性、重復(fù)性都比較高,對(duì)牛乳中結(jié)核分枝桿菌的最低檢測(cè)濃度分別為3×101CFU/m L和3×100 CFU/m L。RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)的靈敏度要明顯高于環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù),并且是它的10倍。牛乳中結(jié)核分枝桿菌的DNA與RNA的提取方法分別為改良后的CTAB/NACL法與改良后的手工提取RNA法。結(jié)核培養(yǎng)技術(shù)、抗酸鏡檢、PCR技術(shù)對(duì)牛乳中結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè)的最低濃度分別為3×105 CFU/m L、3×108 CFU/m L、3×104 CFU/m L。結(jié)論:建立的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)與RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)可用于牛乳中結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè),這兩種方法操作簡(jiǎn)單,對(duì)實(shí)驗(yàn)儀器要求不高,易于在產(chǎn)品檢驗(yàn)與檢疫中應(yīng)用。與結(jié)核培養(yǎng)技術(shù)、抗酸涂片鏡檢技術(shù)、PCR技術(shù)相比,對(duì)牛乳中的結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè)濃度更低,靈敏度更高,RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)的靈敏度要比環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)高10倍。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核分枝桿菌 16SRNA 牛奶 核酸恒溫?cái)U(kuò)增
【學(xué)位授予單位】:石河子大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:S852.61
【目錄】:
  • 摘要6-8
  • Abstract8-13
  • 英文縮略詞表13-14
  • 前言14-15
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述15-27
  • 1 結(jié)核病的流行情況15-17
  • 1.1 人結(jié)核病的流行情況與現(xiàn)狀15-16
  • 1.2 牛結(jié)核病的流行現(xiàn)狀與趨勢(shì)16-17
  • 2 結(jié)核病的發(fā)病率大幅上升的原因17-19
  • 2.1 HIV與TB的雙重感染17-18
  • 2.2 耐多藥結(jié)核分枝桿菌的散播18
  • 2.3 BCG免疫效果降低18-19
  • 2.4 人.的大規(guī)模流動(dòng)19
  • 2.5 診斷方法落后、耗費(fèi)大19
  • 3 結(jié)核病的實(shí)驗(yàn)室診斷技術(shù)19-27
  • 3.1 細(xì)菌學(xué)診斷新技術(shù)19-21
  • 3.1.1 以涂片為基礎(chǔ)的診斷技術(shù)19-20
  • 3.1.2 以培養(yǎng)為基礎(chǔ)的診斷新技術(shù)20-21
  • 3.2 免疫學(xué)診斷21-23
  • 3.2.1 結(jié)核菌素皮膚實(shí)驗(yàn)(TST)21
  • 3.2.2 淋巴細(xì)胞分泌抗體的(ALS)檢測(cè)21-22
  • 3.2.3 γ 干擾素檢測(cè)(IGRA)22
  • 3.2.4 隱性結(jié)核感染的Quanti FERON血液學(xué)檢測(cè)22-23
  • 3.2.5 ELISpot即酶聯(lián)免疫斑點(diǎn)法23
  • 3.3 分子生物學(xué)診斷23-27
  • 3.3.1 聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)23
  • 3.3.2 直接測(cè)序技術(shù)23
  • 3.3.3 基因芯片技術(shù)23-24
  • 3.3.4 Xpert MTB/RIF檢測(cè)技術(shù)24
  • 3.3.5 環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)24
  • 3.3.6 RNA擴(kuò)增技術(shù)24-27
  • 第二章 實(shí)驗(yàn)部分27-60
  • 實(shí)驗(yàn)一 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法對(duì)結(jié)核分枝桿菌檢測(cè)條件的優(yōu)化27-36
  • 摘要27
  • 1 材料與方法27-30
  • 1.1 材料27-28
  • 1.1.1 菌株28
  • 1.1.2 主要試劑28
  • 1.2 方法28-30
  • 1.2.1 細(xì)菌培養(yǎng)以及DNA模板的制備28
  • 1.2.2 PCR檢測(cè)28
  • 1.2.3 LAMP實(shí)驗(yàn)的引物28-29
  • 1.2.4 LAMP反應(yīng)體系與反應(yīng)條件29
  • 1.2.5 LAMP檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的靈敏度和特異性29
  • 1.2.6 人工人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌基因組DNA的提取方法比較29-30
  • 1.2.7 LAMP檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌人工陽(yáng)性乳的最低檢測(cè)濃度30
  • 2 結(jié)果30-34
  • 2.1 LAMP檢測(cè)方法的建立30
  • 2.2 LAMP反應(yīng)體系與反應(yīng)程序的優(yōu)化30-31
  • 2.3 LAMP擴(kuò)增技術(shù)靈敏度的檢測(cè)31
  • 2.4 LAMP特異性實(shí)驗(yàn)31-32
  • 2.5 人工人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌DNA的提取32-33
  • 2.6 人工人工陽(yáng)性乳中LAMP的最低檢測(cè)濃度33-34
  • 3 討論34-35
  • 4 小結(jié)35-36
  • 實(shí)驗(yàn)二 RNA恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)牛奶中結(jié)核分枝桿菌的研究36-50
  • 摘要36
  • 1 材料和方法36-42
  • 1.1 材料36-39
  • 1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株36-37
  • 1.1.2 主要儀器設(shè)備37
  • 1.1.3 實(shí)驗(yàn)用培養(yǎng)基和實(shí)驗(yàn)重要試劑的配制37-39
  • 1.2 方法39-42
  • 1.2.1 無(wú)菌牛奶的制備39
  • 1.2.2 結(jié)核分枝桿菌菌懸液的制備39
  • 1.2.3 模板的制備39-40
  • 1.2.4 SAT檢測(cè)40
  • 1.2.5 SAT反應(yīng)體系的優(yōu)化40
  • 1.2.6 SAT特異性、敏感性、重復(fù)性的檢測(cè)40-41
  • 1.2.7 人工陽(yáng)性乳的制備41
  • 1.2.8 人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌總RNA提取41-42
  • 1.2.9 SAT檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌人工陽(yáng)性乳特異性實(shí)驗(yàn)42
  • 1.2.10 SAT檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌人工陽(yáng)性乳敏感性實(shí)驗(yàn)42
  • 1.2.11 SAT檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌人工陽(yáng)性乳重復(fù)性實(shí)驗(yàn)42
  • 2. 結(jié)果42-47
  • 2.1 SAT檢測(cè)的優(yōu)化結(jié)果42
  • 2.2 SAT特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果42-43
  • 2.3 敏感性實(shí)驗(yàn)的檢測(cè)結(jié)果43-44
  • 2.4 重復(fù)性實(shí)驗(yàn)結(jié)果44
  • 2.5 對(duì)人工陽(yáng)性乳的檢測(cè)結(jié)果44-47
  • 2.5.1 人工陽(yáng)性乳模板的制備44-46
  • 2.5.2 人工陽(yáng)性乳模板SAT擴(kuò)增結(jié)果46
  • 2.5.3 人工陽(yáng)性乳的SAT特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果46-47
  • 2.5.4 人工陽(yáng)性乳的SAT敏感性實(shí)驗(yàn)結(jié)果47
  • 2.5.5 人工陽(yáng)性乳的SAT重復(fù)性實(shí)驗(yàn)結(jié)果47
  • 3 討論47-48
  • 4 小結(jié)48-50
  • 實(shí)驗(yàn)三 幾種不同檢測(cè)牛奶中結(jié)核分枝桿菌方法的比較50-60
  • 摘要50
  • 1 材料與方法50-53
  • 1.1 材料50-51
  • 1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株50
  • 1.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器與設(shè)備50-51
  • 1.1.3 主要試劑的配制51
  • 1.2 方法51-53
  • 1.2.1 菌懸液的制備51-52
  • 1.2.2 人工陽(yáng)性乳的制備52
  • 1.2.3 羅氏培養(yǎng)法檢測(cè)52
  • 1.2.4 抗酸染色鏡檢52
  • 1.2.5 PCR法檢測(cè)52-53
  • 1.2.6 LAMP法檢測(cè)53
  • 1.2.7 SAT法53
  • 1.2.8 比較五種檢測(cè)方法檢測(cè)結(jié)果53
  • 2 結(jié)果53-58
  • 2.1 羅氏培養(yǎng)法檢測(cè)人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌的結(jié)果53-54
  • 2.2 抗酸染色鏡檢人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌的結(jié)果54-55
  • 2.3 PCR檢測(cè)人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌的結(jié)果55
  • 2.4 LAMP法擴(kuò)增檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌人工陽(yáng)性乳的結(jié)果55-56
  • 2.5 SAT法檢測(cè)人工陽(yáng)性乳中結(jié)核分枝桿菌的結(jié)果56-57
  • 2.6 評(píng)價(jià)分析幾種檢測(cè)方法的結(jié)果57-58
  • 3 討論58-59
  • 4 小結(jié)59-60
  • 創(chuàng)新點(diǎn)60-61
  • 參考文獻(xiàn)61-67
  • 致謝67-68
  • 作者簡(jiǎn)介68-69
  • 導(dǎo)師評(píng)閱表69

【參考文獻(xiàn)】

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  本文關(guān)鍵詞:核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的比較研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):316827

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