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四個水稻環(huán)狀RNAs基因定向敲除突變體分析

發(fā)布時間:2021-02-14 21:06
  環(huán)狀RNA(circRNA)是一類沒有游離末端的共價封閉的長鏈非編碼RNA,其通過3’下游序列與5’上游序列“末端”連接,形成環(huán)形結(jié)構(gòu),由于其特殊的結(jié)構(gòu)從而不易被核糖核酸外切酶切割,從而保持較高的穩(wěn)定性。環(huán)狀RNA在生物進程中起著重要的調(diào)節(jié)作用,在植物中環(huán)狀RNA的研究還十分匱乏。本研究利用水稻四個環(huán)狀RNAs(Os02circ25329,Os06circ02797,Os03circ00204,Os05circ02465)敲除突變體,通過對突變體農(nóng)藝性狀分析、非生物脅迫、親本/側(cè)翼基因表達及轉(zhuǎn)錄組分析,初步分析了這四個水稻環(huán)狀RNAs基因的生物學功能。主要研究內(nèi)容及結(jié)果如下:1.不含載體且純合突變材料鑒定顯示:Os02circ25329獲得-578bp/-578bp(pZJP053-03-03、pZJP053-27-01)和-584bp/-584bp(pZJP053-29-16)兩種基因型材料;Os06circ02797獲得基因型為-328bp/-328bp(pZJP054-07-01-21)和-332bp/-332bp(pZJP054-32-03)兩種基因型材料;Os03circ00... 

【文章來源】:電子科技大學四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:73 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

四個水稻環(huán)狀RNAs基因定向敲除突變體分析


四個水稻環(huán)狀RNAs基因在基因組中的位置

示意圖,單位,突變體,材料


第三章結(jié)果與分析25就是所需不含載體且純合突變的目標材料。結(jié)果顯示所選T2代株系都為不含載體且純合突變(如圖3-3)。圖3-2四個環(huán)狀RNAssgRNA擴增引物設計示意圖a.Os02circ25329;b.Os06circ02797;c.Os03circ00204;d.Os05circ02465紅色方框:sgRNA位點;藍色箭頭:擴增引物a.dcba圖3-3Os02circ25329純合突變體材料鑒定a.大片段刪除檢測;b.單位點01擴增檢測;c.單位點02擴增檢測;d.陽性鑒定abcd

示意圖,環(huán)狀,引物,示意圖


第三章結(jié)果與分析25就是所需不含載體且純合突變的目標材料。結(jié)果顯示所選T2代株系都為不含載體且純合突變(如圖3-3)。圖3-2四個環(huán)狀RNAssgRNA擴增引物設計示意圖a.Os02circ25329;b.Os06circ02797;c.Os03circ00204;d.Os05circ02465紅色方框:sgRNA位點;藍色箭頭:擴增引物a.dcba圖3-3Os02circ25329純合突變體材料鑒定a.大片段刪除檢測;b.單位點01擴增檢測;c.單位點02擴增檢測;d.陽性鑒定abcd

【參考文獻】:
期刊論文
[1]環(huán)狀RNA的研究進展[J]. 馬翔,任秀智,劉軍龍,魯艷芹,韓金祥.  中國生物制品學雜志. 2016(08)
[2]長鏈非編碼RNA在動物和植物中的最新研究進展[J]. 秦少偉,陸夢婷,周媛媛,呂建兵,王付康,溫永強,趙利峰.  塔里木大學學報. 2016(02)



本文編號:3033860

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