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基于SNP的紫花苜蓿品質(zhì)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-11-10 12:45
   苜蓿(Medicago L.)品質(zhì)是由多基因控制的數(shù)量性狀,全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association study,GWAS)是數(shù)量性狀分析的有效手段。本研究以119個(gè)紫花苜蓿品種(系)為試驗(yàn)材料,以粗蛋白、粗灰分、中性洗滌纖維、酸性洗滌纖維、干物質(zhì)和相對(duì)飼用價(jià)值等6個(gè)品質(zhì)性狀為測(cè)定指標(biāo),基于53028個(gè)SNP分子標(biāo)記,對(duì)紫花苜蓿品質(zhì)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。主要結(jié)果如下:1.品質(zhì)性狀表型分析對(duì)119份紫花苜蓿品種(系)的6個(gè)品質(zhì)性狀進(jìn)行表型變異分析,各品質(zhì)性狀在不同紫花苜蓿品種間具有不同程度的變異,變異系數(shù)最小為干物質(zhì),最大為相對(duì)飼用價(jià)值。相關(guān)分析表明,粗蛋白與相對(duì)飼用價(jià)值間呈極顯著正相關(guān),中性洗滌纖維與酸性洗滌纖維間呈極顯著正相關(guān),粗蛋白與中性洗滌纖維、酸性洗滌纖維間呈極顯著負(fù)相關(guān)。主成分分析結(jié)果表明,潤(rùn)布勒、賽特、AIBLE、蔚縣苜蓿、巨能801、游客、河西苜蓿、K4、維多利亞、阿波羅II、金皇后、Diamond T、WL343、先鋒555和安格等15份紫花苜蓿品種(系)的綜合得分大于1。聚類(lèi)分析表明,119份紫花苜蓿劃分為3個(gè)類(lèi)群,第I類(lèi)群由18份品種(系)組成,第II類(lèi)群由78份品種(系)組成,第III類(lèi)群由23份品種(系)組成。綜合評(píng)價(jià)結(jié)果表明在主成分綜合得分1的15份紫花苜蓿品種(系)中除金皇后、WL343、先鋒555和安格外均屬于第I類(lèi)群,其營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高,適口性較好,為優(yōu)質(zhì)紫花苜蓿品種(系)。2.全基因組關(guān)聯(lián)分析全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明,在P0.0001水平上,共檢測(cè)到484個(gè)與品質(zhì)性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn),可解釋7.47%-55.85%的表型變異。其中,粗蛋白、粗灰分、中性洗滌纖維、酸性洗滌纖維、干物質(zhì)和相對(duì)飼用價(jià)值的相關(guān)位點(diǎn)分別為86個(gè)、76個(gè)、117個(gè)、70個(gè)、32個(gè)和103個(gè)。檢測(cè)到穩(wěn)定SNP關(guān)聯(lián)位點(diǎn)82個(gè),粗蛋白、粗灰分、中性洗滌纖維、酸性洗滌纖維、干物質(zhì)和相對(duì)飼用價(jià)值的穩(wěn)定關(guān)聯(lián)位點(diǎn)分別為12個(gè)、1個(gè)、25個(gè)、15個(gè)、23個(gè)和6個(gè)。檢測(cè)到多效性SNP 39個(gè),可解釋7.47%-48.27%的表型變異,均值為19.28%。其中,標(biāo)記SNP136388_c3_g2_i1與5個(gè)性狀(CP、CA、NDF、ADF和RFV)顯著關(guān)聯(lián)。與4個(gè)性狀顯著關(guān)聯(lián)的多效性SNP有8個(gè),與3個(gè)性狀顯著關(guān)聯(lián)的多效性SNP有30個(gè)。
【學(xué)位單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2020
【中圖分類(lèi)】:S541.9
【部分圖文】:

基于SNP的紫花苜蓿品質(zhì)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析


圖2119份紫花苜蓿品種品質(zhì)性狀的聚類(lèi)分析
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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1 于潔;不同苜蓿材料產(chǎn)量、品質(zhì)、耐鹽性評(píng)價(jià)及遺傳多樣性分析[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年


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1 潘香逾;紫花苜蓿產(chǎn)量相關(guān)性狀的GWAS分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2019年

2 張寒;基于RNA-Seq的苜蓿萌發(fā)期耐鹽性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年



本文編號(hào):2877943

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