本文關(guān)鍵詞：中國沿海真帽貝分類及美女蛤隱存種研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：1.中國沿海真帽貝形態(tài)學研究真帽貝,即Patellogastropoda目的帽貝,隸屬于軟體動物門(Mollusca)、腹足綱(Gastropoda),廣泛分布于世界各地的海洋沿岸的巖石潮間帶,深海中亦有分布。本研究對采自中國沿海的真帽貝樣品進行了基于貝殼的形態(tài)學鑒定,描述了每個種的貝殼特征,主要包括貝殼的基本參數(shù)、形狀、顏色、殼表的紋理等,并記錄了每一種真帽貝的拉丁學名、采集地。最終,所有樣品被鑒定到2個科(笠貝科、花帽貝科),4個屬(Lottia、Patelloida、Nipponacmea、Cellana),其中鑒定到種水平的共有11個種,只鑒定到屬水平的有2個種。2.基于COI基因的中國沿海真帽貝DNA條形碼研究目前,根據(jù)形態(tài)特征鑒定真帽貝種存在著不確定性和復雜性。采用更加有效和準確的物種鑒定方法來鑒定真帽貝這種普遍的,小型的,殼多變的海洋軟體動物就顯得非常的必要。DNA條形碼技術(shù)是一門高效的,非常有用的物種鑒定工具。這種技術(shù)將能夠為真帽貝的識別和鑒定效率帶來顯著的提高。本研究中,我們利用線粒體細胞色素c氧化酶亞單位I(COI)基因序列上的一個片段作為DNA條形碼來評估DNA條形碼技術(shù)用于鑒定和區(qū)分真帽貝物種的可行性。135條COI序列來源于中國沿海的花帽貝科和笠貝科的13個種。這些序列經(jīng)過拼接比對之后的分析結(jié)果表明真帽貝的線粒體COl基因序列中存在堿基插入現(xiàn)象。13個種種內(nèi)的以及4個屬屬內(nèi)不同種間的基于Kimura雙參數(shù)模型計算的遺傳距離的平均值分別為0.03%-0.21%(最大值1.01%),18.96%-31.30%(最大值37.80%),它們之間存在一條明顯的條形碼間隙。所有的種都能夠在每種系統(tǒng)樹中以較高的支持度被明顯的區(qū)分出來�；谔卣鞯臈l形碼分析法能夠?qū)⑺械恼婷必惙N成功鑒定出,在屬水平的鑒別上也發(fā)揮了很好的作用。本研究的結(jié)果證明了基于COI基因的DNA條形碼技術(shù)能夠快速而準確的鑒定真帽貝的物種。3.基于COI基因的南中國海美女蛤隱存多樣性研究該研究以南中國海的海南陵水、海南臨高、海南三亞、廣東陽江、廣西北海5個海域共89個美女蛤樣品作為研究對象,通過對線粒體DNA(Mitochondrial DNA)的COI基因序列的分析對美女蛤進行了隱存種的探究。經(jīng)過PCR擴增與測序,以及對所得序列進行比對校正后,獲得COI基因片段序列長590bp,檢測到87個變異位點,其中有46個簡約信息位點,核苷酸多樣性為0.02729。89條序列共定義25個單倍型,單倍型多樣性為0.843。單倍型Hap7可能是由雜交引起的,排除此單倍型,遺傳距離和系統(tǒng)進化樹都顯示美女蛤分為3個進化支,其中進化支3僅有一個單倍型Hap25,進化支間遺傳距離為3.67%-8.55%,遠大于進化支內(nèi)最大遺傳距離0.85%。并且,運用特征法分析的結(jié)果顯示進化支1、2、3的特征堿基數(shù)分別為17,16,24個,也與距離法和單系法的分析結(jié)果一致。本研究表明,基于COI的DNA條形碼技術(shù)能夠運用于美女蛤隱存種的探究,三種分析方法都提示中國沿海分布的美女蛤可能至少具有2個隱存種,即中國沿海的美女蛤至少為3個不同種組成的復合種。
【關(guān)鍵詞】：物種鑒定 隱存種 形態(tài)學 DNA條形碼 COI 真帽貝 美女蛤
【學位授予單位】：中國海洋大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S917.4
【目錄】：

• 摘要5-7
• Abstract7-13
• 第一章 文獻綜述13-26
• 1. 真帽貝(Patellogastropod)的概況13-17
• 1.1 真帽貝的形態(tài)特征14
• 1.2 真帽貝的生態(tài)習性14-15
• 1.3 真帽貝的分類學研究進展15-17
• 2. 美女蛤(Circe scripta)的概況17-20
• 2.1 外部形態(tài)特征17
• 2.2 地理分布17
• 2.3 生態(tài)習性17-18
• 2.4 傳統(tǒng)形態(tài)分類所存在的爭議18-20
• 3. DNA條形碼20-26
• 3.1 DNA條形碼技術(shù)的研究步驟20-22
• 3.2 DNA條形碼位點(locus)的選擇22-23
• 3.3 DNA條形碼技術(shù)的成果23-24
• 3.4 DNA條形碼技術(shù)的現(xiàn)狀和展望24-26
• 第二章 真帽貝形態(tài)學分類研究26-41
• 0 引言26-27
• 1 材料與方法27
• 1.1 實驗樣品的采集27
• 1.2 主要形態(tài)特征的觀察27
• 2 結(jié)果27-41
• 第三章 基于COI基因的中國沿海真帽貝DNA條形碼分析41-63
• 0 引言41-42
• 1 材料與方法42-47
• 1.1 實驗樣品的采集42
• 1.2 分子數(shù)據(jù)的采集42-46
• 1.2.1 DNA提取42
• 1.2.2 PCR擴增與測序42-46
• 1.3 DNA條形碼分析46-47
• 2 結(jié)果47-60
• 2.1 形態(tài)學鑒定結(jié)果47-48
• 2.2 條形碼測序結(jié)果48
• 2.3 序列特征分析結(jié)果48
• 2.4 遺傳距離分析結(jié)果48-49
• 2.5 系統(tǒng)進化樹分析結(jié)果49-50
• 2.6 特征法分析結(jié)果50-60
• 3 討論60-62
• 3.1 COI引物在本研究中的表現(xiàn)60
• 3.2 基于COI的DNA條形碼技術(shù)的效率60-61
• 3.3 Patellogastropoda帽貝COI基因中的插入現(xiàn)象61-62
• 4 結(jié)論62-63
• 第四章 基于DNA條形碼的南中國海美女蛤(Circe scripta)隱存多樣性研究63-80
• 0 引言63-64
• 1 材料與方法64-72
• 1.1 實驗樣品64-69
• 1.2 DNA提取及PCR擴增69
• 1.3 序列下載69-70
• 1.4 數(shù)據(jù)分析70-72
• 2 結(jié)果72-78
• 2.1 美女蛤類COI基因序列特征72
• 2.2 遺傳距離分析及支系間分化時間72-77
• 2.3 系統(tǒng)發(fā)生分析及單倍型網(wǎng)絡圖77
• 2.4 特征法分析77-78
• 3 討論78-80
• 參考文獻80-90
• 致謝90-91
• 個人簡歷91-92
• 碩士期間學術(shù)成果92

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 張麗娜;榮昌鶴;何遠;關(guān)瓊;何彬;朱興文;劉佳妮;陳紅菊;;常用系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建算法和軟件鳥瞰[J];動物學研究;2013年06期

2 陳軍;李琪;孔令鋒;鄭小東;于瑞海;;基于COI序列的DNA條形碼在中國沿海綴錦蛤亞科貝類中的應用分析[J];動物學研究;2010年04期

3 孫寶超;楊建敏;孫國華;劉相全;劉麗娟;王衛(wèi)軍;鄭小東;;中國沿海長蛸(Octopus variabilis)自然群體線粒體COI基因遺傳多樣性研究[J];海洋與湖沼;2010年02期

4 王志錚,吳常文,劉祖毅;浙江北部沿海嫁Cellana toreuma(Reeve)生態(tài)習性的初步研究[J];浙江海洋學院學報(自然科學版);2001年01期

  本文關(guān)鍵詞：中國沿海真帽貝分類及美女蛤隱存種研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：281201