【摘要】：選擇信號(hào)是生物在人工或自然選擇過(guò)程中,由于選擇作用在基因組上留下的選擇印跡,通常情況下表現(xiàn)為染色體長(zhǎng)范圍的連鎖不平衡或者遺傳多態(tài)性的降低。為研究不同尾型綿羊群體遺傳分化程度,檢測(cè)全基因組選擇信號(hào),以挖掘與不同尾型綿羊重要性狀相關(guān)的候選基因。本研究基于蒙古羊(短脂尾)和藏羊(瘦尾)群體的Illumina Ovine SNP 50K芯片分型數(shù)據(jù),借助遺傳分化系數(shù)FST法進(jìn)行群體間選擇信號(hào)檢測(cè)分析,應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析尋找選擇信號(hào)區(qū)域內(nèi)的重要基因,并對(duì)其中與脂肪代謝相關(guān)的基因PPARG、PDGFD在呼倫貝爾羊(大尾和小尾品系;肥尾)與藏羊(瘦尾)尾脂進(jìn)行m RNA相對(duì)表達(dá)量研究。結(jié)果如下:(1)465個(gè)SNPs受選擇,通過(guò)基因注釋找到448個(gè)候選基因,GO功能富集分析表明這些基因主要富集在發(fā)育過(guò)程、細(xì)胞形態(tài)建成、大分子分解代謝等條目;并在這些候選基因中篩選出50個(gè)與脂類代謝相關(guān)的基因,GO功能富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因主要富集在脂類生物合成過(guò)程、磷脂代謝、脂質(zhì)結(jié)合等條目,此外發(fā)現(xiàn)4個(gè)基因(PPARG、RXRG、SLC27A2和ACSL6)富集到PPAR信號(hào)通路。PPARG和PDGFD作為候選基因參與了脂肪代謝過(guò)程,可能與尾脂形成有重要關(guān)系。(2)對(duì)脂肪代謝合成相關(guān)重點(diǎn)候選基因PPARG和PDGFD進(jìn)行尾脂組織相對(duì)表達(dá)量研究表明:肥瘦尾之間,呼倫貝爾羊(大尾和小尾品系)PPARG和PDGFD基因表達(dá)量均顯著高于藏羊(P0.01),而大小肥尾之間,呼倫貝爾羊大尾品系PPARG基因表達(dá)量顯著高于小尾品系(P0.05),PDGFD基因表達(dá)量則無(wú)明顯差異。本研究采用FST法有效檢測(cè)到受選擇的基因,其中部分基因與綿羊重要性狀相關(guān),并通過(guò)相對(duì)定量實(shí)驗(yàn)證明PPARG和PDGFD基因與尾部脂肪沉積密切相關(guān),可以作為尾型選育的候選基因,為綿羊育種及改良提供重要有益參考。
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S826;Q78

【引證文獻(xiàn)】

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 孫偉芳;呼倫貝爾羊兩個(gè)品系不同部位脂肪細(xì)胞形態(tài)及脂肪代謝相關(guān)基因表達(dá)差異分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2017年

本文編號(hào)：2733451