基于宏基因組學的肝硬化患者營養(yǎng)狀況與腸道菌群關(guān)系的研究
發(fā)布時間:2021-07-17 08:17
肝硬化(Liver cirrhosis)是消化系統(tǒng)的一種常見疾病,以慢性肝臟炎癥、肝纖維化和再生結(jié)節(jié)為特征,肝硬化患者常常伴發(fā)各種并發(fā)癥,例如:自發(fā)性細菌性腹膜炎、上消化道出血、肝性腦。╤epatic encephalopathy,HE)、營養(yǎng)不良(Malnutrition)等。其中營養(yǎng)不良不僅是肝硬化的常見并發(fā)癥,也是肝硬化患者預后不良的獨立預測因素,并且隨著肝臟疾病病情的加重,營養(yǎng)不良發(fā)生率和嚴重程度增加。研究表明在肝硬化患者中,腸道菌群結(jié)構(gòu)破壞引起腸屏障完整性改變,進一步導致腸通透性升高、細菌DNA易位、高內(nèi)毒素血癥,最終促進肝硬化及各種并發(fā)癥的進展。以往對肝硬化腸道菌群結(jié)構(gòu)的研究多依賴于培養(yǎng)的方法,近年來隨著第二代測序技術(shù)的發(fā)展,能夠更全面的反應腸道菌群多樣性特點,為闡明腸道菌群在肝硬化發(fā)生發(fā)展中所扮演的角色提供依據(jù)。目前關(guān)于腸道菌群與肥胖、糖尿病的關(guān)系研究較多,而關(guān)于腸道菌群與肝硬化患者營養(yǎng)狀況的研究報道甚少,因此本研究通過宏基因組學(Metagenomics)的方法探索腸道菌群與肝硬化患者不同營養(yǎng)狀況之間的關(guān)系。目的:通過宏基因組學測序,明確肝硬化患者腸道菌群結(jié)構(gòu)改變;探...
【文章來源】:山西醫(yī)科大學山西省
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1健康對照組和肝硬化患者組腸道菌群非冗余基因集(基因韋恩圖)??
?山西醫(yī)科大學博士學位論文???Shannon??control?]jyer?cirrhosis??圖3-1健康對照組與肝硬化組菌種層面的多樣性香農(nóng)指數(shù)比較??如圖3-1所示肝硬化組內(nèi)物種分布不均勻,并且各個樣本之間豐富度差異也較大;??而對照組物種分布相對較均一,Shannon?index大多數(shù)集中在3水平,并且均一性也??較肝硬化組好,這最終導致了兩組之間多樣性香農(nóng)指數(shù)無顯著性差異,這說明在肝硬??化疾病狀態(tài)下,物種的多樣性并未發(fā)生明顯改變。??3.3.2肝硬化患者和健康對照者腸道菌群結(jié)構(gòu)分析??將肝硬化組獲得的高質(zhì)量:reads與腸道微生物參考基因組數(shù)據(jù)庫進行比對后,獲??得腸道菌群各個細菌分級水平的分析表。為了獲得兩組的差異物種,我們進行了非參??數(shù)?wilcoxon?rank?sam?檢驗。??3.3.2.1.肝硬化患者與健康對照者在腸道菌群分級門(Phylum)水平的分布比較??統(tǒng)計分析各個腸道細菌分級門水平在肝硬化組和對照組的相對豐度,如餅狀圖??3-2所示:??22??
?山西醫(yī)科大學博士學位論文???174%?1-30%?0.26%?0.58%??\??6.18%?9.34%?Actlnobncierla??14.8%?Bacteroide/es??Flrmicutes??Proteobacteria??Verrucomlcrobia??Other??57.06%?25-〇5%?49.33%?34.31%??Control?Liver?cirriiosis??圖3-2健康對照組與肝硬化組腸道微生物菌群門水平的組成??如上圖所示,在門水平上病例組和對照組的優(yōu)勢菌群為擬桿菌門流to)和厚壁菌??門在病例組和對照組兩個菌門之和分別為82.31%?(擬桿菌門25.05%+厚壁菌門??57.06%)、83.64%?(擬桿菌門34.31%+厚壁菌門49.33%),兩組之間差異無統(tǒng)計學意義。以往??學者利用宏基因組學方法研究肝硬化患者腸道微生物發(fā)現(xiàn),肝硬化患者和對照者中擬桿菌門??相對豐度分別為55.5%和61.1%,與對照組相比肝硬化組相對豐度略有下降,但無統(tǒng)計學差??異[62]。??擬桿菌門CBflctera/cfe/a)包括擬桿菌綱、鞘脂桿菌桿和黃桿菌綱三個綱,廣泛存在于機體??的腸道和皮膚中。在本研究中,我們發(fā)現(xiàn)擬桿菌門在肝硬化組和對照組分別為34.31%和??25.05%,與對照組相比肝硬化組擬桿菌水平升高,但兩組之間差異無顯著性。BajajJS及其??同事研宄也發(fā)現(xiàn)在肝硬化伴隨肝性腦病的患者中擬桿菌門水平升高[63]。除此之外,Tuomisto?S??等人發(fā)現(xiàn)與對照組相比酒精性肝硬化患者中擬桿菌豐度水平也表現(xiàn)為增高[?1。綜上,我們推??測肝硬化患者中擬桿
【參考文獻】:
期刊論文
[1]終末期肝病臨床營養(yǎng)指南[J]. 段鐘平,楊云生. 實用肝臟病雜志. 2019(05)
[2]Distinct gut microbiota profiles in patients with primary sclerosing cholangitis and ulcerative colitis[J]. Lukas Bajer,Miloslav Kverka,Martin Kostovcik,Peter Macinga,Jiri Dvorak,Zuzana Stehlikova,Jan Brezina,Pavel Wohl,Julius Spicak,Pavel Drastich. World Journal of Gastroenterology. 2017(25)
[3]Gut microbiota and host metabolism in liver cirrhosis[J]. Makoto Usami,Makoto Miyoshi,Hayato Yamashita. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
[4]Ethanol and liver: Recent insights into the mechanisms of ethanol-induced fatty liver[J]. Jinyao Liu. World Journal of Gastroenterology. 2014(40)
博士論文
[1]代償期和失代償期肝硬化病人的腸道菌群研究[D]. 李昂.浙江大學 2017
本文編號:3287805
【文章來源】:山西醫(yī)科大學山西省
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1健康對照組和肝硬化患者組腸道菌群非冗余基因集(基因韋恩圖)??
?山西醫(yī)科大學博士學位論文???Shannon??control?]jyer?cirrhosis??圖3-1健康對照組與肝硬化組菌種層面的多樣性香農(nóng)指數(shù)比較??如圖3-1所示肝硬化組內(nèi)物種分布不均勻,并且各個樣本之間豐富度差異也較大;??而對照組物種分布相對較均一,Shannon?index大多數(shù)集中在3水平,并且均一性也??較肝硬化組好,這最終導致了兩組之間多樣性香農(nóng)指數(shù)無顯著性差異,這說明在肝硬??化疾病狀態(tài)下,物種的多樣性并未發(fā)生明顯改變。??3.3.2肝硬化患者和健康對照者腸道菌群結(jié)構(gòu)分析??將肝硬化組獲得的高質(zhì)量:reads與腸道微生物參考基因組數(shù)據(jù)庫進行比對后,獲??得腸道菌群各個細菌分級水平的分析表。為了獲得兩組的差異物種,我們進行了非參??數(shù)?wilcoxon?rank?sam?檢驗。??3.3.2.1.肝硬化患者與健康對照者在腸道菌群分級門(Phylum)水平的分布比較??統(tǒng)計分析各個腸道細菌分級門水平在肝硬化組和對照組的相對豐度,如餅狀圖??3-2所示:??22??
?山西醫(yī)科大學博士學位論文???174%?1-30%?0.26%?0.58%??\??6.18%?9.34%?Actlnobncierla??14.8%?Bacteroide/es??Flrmicutes??Proteobacteria??Verrucomlcrobia??Other??57.06%?25-〇5%?49.33%?34.31%??Control?Liver?cirriiosis??圖3-2健康對照組與肝硬化組腸道微生物菌群門水平的組成??如上圖所示,在門水平上病例組和對照組的優(yōu)勢菌群為擬桿菌門流to)和厚壁菌??門在病例組和對照組兩個菌門之和分別為82.31%?(擬桿菌門25.05%+厚壁菌門??57.06%)、83.64%?(擬桿菌門34.31%+厚壁菌門49.33%),兩組之間差異無統(tǒng)計學意義。以往??學者利用宏基因組學方法研究肝硬化患者腸道微生物發(fā)現(xiàn),肝硬化患者和對照者中擬桿菌門??相對豐度分別為55.5%和61.1%,與對照組相比肝硬化組相對豐度略有下降,但無統(tǒng)計學差??異[62]。??擬桿菌門CBflctera/cfe/a)包括擬桿菌綱、鞘脂桿菌桿和黃桿菌綱三個綱,廣泛存在于機體??的腸道和皮膚中。在本研究中,我們發(fā)現(xiàn)擬桿菌門在肝硬化組和對照組分別為34.31%和??25.05%,與對照組相比肝硬化組擬桿菌水平升高,但兩組之間差異無顯著性。BajajJS及其??同事研宄也發(fā)現(xiàn)在肝硬化伴隨肝性腦病的患者中擬桿菌門水平升高[63]。除此之外,Tuomisto?S??等人發(fā)現(xiàn)與對照組相比酒精性肝硬化患者中擬桿菌豐度水平也表現(xiàn)為增高[?1。綜上,我們推??測肝硬化患者中擬桿
【參考文獻】:
期刊論文
[1]終末期肝病臨床營養(yǎng)指南[J]. 段鐘平,楊云生. 實用肝臟病雜志. 2019(05)
[2]Distinct gut microbiota profiles in patients with primary sclerosing cholangitis and ulcerative colitis[J]. Lukas Bajer,Miloslav Kverka,Martin Kostovcik,Peter Macinga,Jiri Dvorak,Zuzana Stehlikova,Jan Brezina,Pavel Wohl,Julius Spicak,Pavel Drastich. World Journal of Gastroenterology. 2017(25)
[3]Gut microbiota and host metabolism in liver cirrhosis[J]. Makoto Usami,Makoto Miyoshi,Hayato Yamashita. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
[4]Ethanol and liver: Recent insights into the mechanisms of ethanol-induced fatty liver[J]. Jinyao Liu. World Journal of Gastroenterology. 2014(40)
博士論文
[1]代償期和失代償期肝硬化病人的腸道菌群研究[D]. 李昂.浙江大學 2017
本文編號:3287805
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