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弓形蟲(chóng)感染對(duì)小鼠、豬脾肝基因表達(dá)的影響

發(fā)布時(shí)間:2018-01-15 06:33

  本文關(guān)鍵詞:弓形蟲(chóng)感染對(duì)小鼠、豬脾肝基因表達(dá)的影響 出處:《中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院》2016年博士論文 論文類(lèi)型:學(xué)位論文


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【摘要】:弓形蟲(chóng)是一種寄生于真核細(xì)胞內(nèi)的頂復(fù)門(mén)原蟲(chóng)。它能通過(guò)其自身蛋白改變宿主細(xì)胞信號(hào)通路狀態(tài)、調(diào)節(jié)宿主基因的表達(dá)量,進(jìn)而影響宿主的生命活動(dòng)進(jìn)程。本課題通過(guò)RNA-seq和iTRAQ技術(shù)、生物信息學(xué)分析、定量PCR驗(yàn)證等技術(shù),對(duì)弓形蟲(chóng)感染后小鼠和豬的脾肝轉(zhuǎn)錄組、miRNA和蛋白組進(jìn)行了研究。通過(guò)對(duì)小鼠感染弓形蟲(chóng)后脾臟的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)弓形蟲(chóng)感染能引起脾臟的免疫相關(guān)通路或組分上調(diào)。免疫細(xì)胞在脾臟中的含量可能會(huì)上升,因?yàn)橼吇@些免疫細(xì)胞移動(dòng)的趨化因子在脾臟中表達(dá)上調(diào)。此外,脾臟細(xì)胞的細(xì)胞器組分在弓形蟲(chóng)感染過(guò)程中發(fā)生改變,包括線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)組分。通過(guò)檢測(cè)小鼠脾臟感染弓形蟲(chóng)后miRNA的表達(dá)量,我們發(fā)現(xiàn)在小鼠脾臟差異表達(dá)的miRNA中,既有靶向轉(zhuǎn)錄因子的miRNA,也有靶向凋亡通路的miRNA。這提示弓形蟲(chóng)可以通過(guò)改變靶向轉(zhuǎn)錄因子的miRNA表達(dá)量來(lái)間接地調(diào)節(jié)宿主基因的表達(dá)。同時(shí),弓形蟲(chóng)也可以通過(guò)改變靶向細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的miRNA表達(dá)來(lái)調(diào)控宿主細(xì)胞凋亡進(jìn)程;靶向凋亡相關(guān)基因的結(jié)果則取決于促進(jìn)凋亡和抑制凋亡的miRNA之間的平衡。通過(guò)對(duì)小鼠感染弓形蟲(chóng)后的肝臟蛋白組進(jìn)行檢測(cè)和分析,我們發(fā)現(xiàn)小鼠肝臟表達(dá)上調(diào)的蛋白集中在免疫、感染以及蛋白折疊相關(guān)通路,而下調(diào)的蛋白則集中在代謝通路。對(duì)小鼠肝臟轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果表明,iTRAQ檢測(cè)的結(jié)果準(zhǔn)確、可靠。此外,通過(guò)分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)我們還發(fā)現(xiàn),肝臟膽汁合成和分泌通路在弓形蟲(chóng)感染中被顯著下調(diào)。通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子富集,我們發(fā)現(xiàn)下調(diào)的基因有很大一部分是由PPAR轉(zhuǎn)錄因子控制的。PPAR信號(hào)通路與肝臟能量、脂類(lèi)等代謝有密切關(guān)系;因此弓形蟲(chóng)可能通過(guò)劫持肝細(xì)胞的PPAR通路來(lái)引起肝臟代謝功能下調(diào)。由于豬的生理特點(diǎn)比小鼠更加接近于人,故本課題還對(duì)弓形蟲(chóng)感染豬后肝臟和脾臟的轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行了檢測(cè)和分析。通過(guò)對(duì)肝臟、脾臟差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)模式進(jìn)行聚類(lèi),發(fā)現(xiàn)豬肝臟和脾臟的代謝進(jìn)程都在弓形蟲(chóng)感染中下調(diào),尤其是在感染后第6天的肝臟。肝臟中的炎癥反應(yīng)總體上要強(qiáng)于脾臟,尤其是感染后第18天豬肝臟出現(xiàn)了結(jié)締組織增生及炎癥細(xì)胞浸潤(rùn)的病理變化;豬肝臟在感染后第6天沒(méi)有發(fā)現(xiàn)明顯的病理變化,但小鼠肝臟在感染后第6天卻發(fā)現(xiàn)了明顯的病理變化。這可能是由于豬和小鼠之間的免疫系統(tǒng)和生理系統(tǒng)差異以及對(duì)弓形蟲(chóng)不同的易感性造成的。此外,我們還發(fā)現(xiàn)豬肝臟蛋白折疊和蛋白質(zhì)量控制相關(guān)基因的表達(dá)受到弓形蟲(chóng)感染的影響,這與小鼠模型的研究結(jié)果一致。綜上所述,本課題首次對(duì)弓形蟲(chóng)感染后小鼠脾臟的轉(zhuǎn)錄組、miRNA,小鼠肝臟的蛋白組、轉(zhuǎn)錄組以及豬脾臟和肝臟的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了研究和分析,描述了小鼠和豬感染弓形蟲(chóng)后脾臟和肝臟的基因表達(dá)變化。同時(shí),我們的研究結(jié)果也證明了弓形蟲(chóng)感染對(duì)宿主基因表達(dá)的影響與感染進(jìn)程以及宿主屬性有關(guān)。本課題研究結(jié)果將為進(jìn)一步深入研究弓形蟲(chóng)感染對(duì)宿主基因的調(diào)節(jié)、脾臟和肝臟功能的改變奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Toxoplasma gondii is a parasite in eukaryotic cells in apicomplexan protozoa. It can change the host cell signaling pathways through its protein expression regulation of host genes, thereby affecting the host life activity process. In this paper by RNA-seq and iTRAQ technology, bioinformatics analysis, quantitative PCR verification technology. The spleen and liver transcriptome of mouse and porcine Toxoplasma infection, studied miRNA and protein group. Through the analysis of mice infected with Toxoplasma gondii transcriptome of spleen, found that Toxoplasma infection can induce immune related pathways or group of spleen points raised. Content of immune cells in the spleen may rise, because chemotaxis of these immune cells move chemokines in spleen expression. In addition, the spleen cell organelles change in Toxoplasma gondii infection process, including mitochondria and endoplasmic reticulum by detecting components. The expression of measuring spleen of mice infected with Toxoplasma gondii miRNA, we found that the expression of miRNA in spleen of mice in both differences, miRNA targeting transcription factor expression, also targeting the apoptosis miRNA. suggesting that Toxoplasma can be changed by targeting transcription factor miRNA expression to indirectly regulate host genes. At the same time, Toxoplasma can shift targeting apoptosis related gene expression of miRNA in the regulation of host cell apoptosis process; targeting apoptosis related genes depends on the results between promote and inhibit apoptosis of miRNA balance. Through testing and Analysis on the liver protein group of mice infected with Toxoplasma gondii, we found that the mice the protein concentration in the liver increased expression of immunity, infection and protein folding pathway, the downregulated proteins are concentrated in metabolic pathways. That of mouse liver transcriptome analysis, iT RAQ detection result is accurate and reliable. In addition, through the analysis of transcriptome data we also found that the synthesis and secretion pathway was significantly downregulated in Toxoplasma gondii infection in the liver bile. Through transcription factor enrichment, we found that the down regulated genes are a large part of the.PPAR signaling pathway and liver energy controlled by the PPAR transcription factor, a closely related to lipid metabolism; therefore, Toxoplasma possibly via the PPAR pathway in liver cells to hijack cause liver metabolic function down. Because of the physiological characteristics of pigs closer than in mice, so this research on swine Toxoplasma infection after liver and spleen transcriptome changes were detected and analyzed. The liver was the expression pattern of clustering transcripts expression differences, found that the metabolic process of pig liver and spleen are downregulated in Toxoplasma infection, especially in sixth days after infection of the liver in the liver inflammation. In response to general than the spleen, especially after infection appeared pathological changes of connective tissue hyperplasia and infiltration of inflammatory cells on the eighteenth day of pig liver; pig liver sixth days found no obvious pathological changes in the liver of mice after infection, but in sixth days after infection and found obvious pathological changes. This may be due to the difference between the immune system of pigs and mice and physiological systems and different susceptibility to Toxoplasma gondii. In addition, we also found that the pig liver protein folding and protein quality control related gene expression affected by Toxoplasma gondii infection, the mice model research and the consistency of the results. To sum up, this is the first study on the transcriptome of mouse spleen the Toxoplasma gondii infection after miRNA protein in mouse liver, transcriptome and transcriptome of porcine spleen and liver were studied and analyzed, described mice and pigs infected with bow shaped worm The expression changes of spleen and liver genes. At the same time, our results also show that the related infection process and host attributes affect the expression of host gene of Toxoplasma gondii infection. The results of this study will further study on Toxoplasma infection in regulation of host genes, lay the foundation for the spleen and liver function change.

【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S855.9

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