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耐碳青霉烯類(lèi)肺炎克雷伯菌基因型分析及傳播路徑調(diào)查研究

發(fā)布時(shí)間:2025-01-18 10:18
  目的:耐碳青霉烯類(lèi)肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)引起的院內(nèi)感染因其高傳播率、高病死率、高耐藥率引起廣泛關(guān)注。近年來(lái)院內(nèi)CRKP感染的患者逐漸增多,細(xì)菌耐藥形勢(shì)較為嚴(yán)峻。為了防止醫(yī)院內(nèi)CRKP的擴(kuò)散,了解院內(nèi)感染CRKP的基因型及其進(jìn)化關(guān)系和感染CRKP患者間的傳播路徑關(guān)系,為醫(yī)院感染防控提供數(shù)據(jù)支持。方法:收集蚌埠市第三人民醫(yī)院2018年11月至2019年3月CRKP非重復(fù)菌株21株,采用梅里埃VITEK微生物鑒定儀進(jìn)行菌種鑒定、最低抑菌濃度MIC法和藥敏紙片擴(kuò)散KB法分析菌株對(duì)抗菌藥物的敏感性,mCIM實(shí)驗(yàn)聯(lián)合eCIM實(shí)驗(yàn)檢測(cè)碳青霉烯酶表型。提取菌株DNA,利用Illumina Hiseq 2500平臺(tái)進(jìn)行全基因組測(cè)序、SPAdes軟件進(jìn)行序列拼接、Staramr軟件分析菌株耐藥基因、MLST軟件分析多位點(diǎn)序列分型(Multilocus sequence typing,MST)、Ridom SeqSphere+軟件進(jìn)行核心基因組多位點(diǎn)序列分型(core genome multilocus sequence ...

【文章頁(yè)數(shù)】:40 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖319株CRKP的院內(nèi)傳播路徑圖

圖319株CRKP的院內(nèi)傳播路徑圖

17圈代表一個(gè)菌株基于cgMLST分型2358個(gè)靶基因序列的等位基因譜。連接線(xiàn)上的數(shù)字表示不同等位基因的數(shù)量。圓圈的顏色代表不同的CT型,代表CT3176型,代表CT1814型,代表CT1689型,代表CT3195型,代表CT1313型。圖2基于21個(gè)肺炎克雷伯菌菌株的cgMLS....



本文編號(hào):4028482

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