中國地鼠口腔黏膜癌發(fā)生發(fā)展相關microRNA的篩選鑒定與體外功能分析
發(fā)布時間:2023-11-11 09:24
目的:建立中國地鼠口腔黏膜癌動物模型,根據(jù)WHO的分級標準將動物模型中口腔黏膜癌的發(fā)展分為四個階段:正常階段(normal stage),單純增生階段(simple hyperplasia stage),異常增生階段(abnormal hyperplasia stage),鱗癌階段(squamous cell and invasive carcinoma,cancer);運用高通量測序技術和實時熒光定量PCR技術(qRT-PCR)對中國地鼠口腔黏膜癌發(fā)生發(fā)展過程中的各個階段進行測序并驗證測序結果,構建各階段microRNA(miRNA)表達譜,并預測其靶基因,進一步采用生物信息學的方法對其進行功能分析,篩選出癌變過程中可能發(fā)揮重要作用的關鍵GO條目、信號通路及可能的生物標志物。此外,通過體外細胞實驗進一步明確候選基因miRNA-181a-5p對人類口腔鱗狀細胞癌細胞系Tca-8113和CAL-27生物學行為的影響,并對其靶基因和下游相關互作基因進行驗證。從非編碼RNA層面和基因表達的角度深入探究口腔鱗狀細胞癌形成過程中可能存在的調控機制,揭示候選miRNA在腫瘤細胞凋亡、周期、增殖、遷...
【文章頁數(shù)】:171 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對照表
前言
第一部分 中國地鼠口腔黏膜癌動物模型的建立
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
2.1 肉眼觀察
2.2 HE病理鑒定
2.3 透射電鏡超微觀結構觀察
2.4 AFP、TNF-ɑ、SCC-Ag的血清含量檢測
3 討論
4 結論
第二部分 口腔黏膜癌病變各階段差異表達miRNA表達譜的構建與生物信息學分析
1 材料與方法
1.1 樣品準備
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
2 結果
2.1 組織RNA樣本的質控
2.2 測序數(shù)據(jù)過濾及質控
2.3 差異表達miRNA的鑒定
2.4 差異miRNA靶基因的預測與篩選
2.5 GO富集分析
2.6 KEGG富集分析
3 討論
4 結論
第三部分 候選基因在各階段口腔黏膜癌組織中的q RT-PCR驗證
1 材料與方法
1.1 樣品準備
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
3 討論
4 結論
第四部分 miR-181a-5p對人類口腔鱗癌細胞系生物學行為的影響
1 材料與方法
1.1 實驗細胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
2.1 qRT-PCR驗證轉染效率
2.2 最佳轉染條件的探究
2.3 miR-181a-5p表達的改變調節(jié)OSCC細胞增殖
2.4 miR-181a-5p對 OSCC細胞系平板克隆的影響
2.5 miR-181a-5p對 OSCC細胞系周期的影響
2.6 miR-181a-5p對 OSCC細胞系凋亡的影響
2.7 miR-181a-5p對 OSCC細胞系侵襲的影響
2.8 miR-181a-5p對 OSCC細胞系遷移的影響
3 討論
4 結論
第五部分 miR-181a-5p靶向調控TIMP1 影響人類口腔鱗癌細胞的生物學功能
1 材料與方法
1.1 實驗細胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
2.1 miR-181a-5p靶基因的預測
2.2 靶基因的互作與預后分析
2.3 各處理組細胞中靶基因及其互作基因的表達驗證
3 討論
4 結論
參考文獻
綜述
參考文獻
附錄
致謝
個人簡介
本文編號:3862365
【文章頁數(shù)】:171 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
常用縮寫詞中英文對照表
前言
第一部分 中國地鼠口腔黏膜癌動物模型的建立
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
2.1 肉眼觀察
2.2 HE病理鑒定
2.3 透射電鏡超微觀結構觀察
2.4 AFP、TNF-ɑ、SCC-Ag的血清含量檢測
3 討論
4 結論
第二部分 口腔黏膜癌病變各階段差異表達miRNA表達譜的構建與生物信息學分析
1 材料與方法
1.1 樣品準備
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
2 結果
2.1 組織RNA樣本的質控
2.2 測序數(shù)據(jù)過濾及質控
2.3 差異表達miRNA的鑒定
2.4 差異miRNA靶基因的預測與篩選
2.5 GO富集分析
2.6 KEGG富集分析
3 討論
4 結論
第三部分 候選基因在各階段口腔黏膜癌組織中的q RT-PCR驗證
1 材料與方法
1.1 樣品準備
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
3 討論
4 結論
第四部分 miR-181a-5p對人類口腔鱗癌細胞系生物學行為的影響
1 材料與方法
1.1 實驗細胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
2.1 qRT-PCR驗證轉染效率
2.2 最佳轉染條件的探究
2.3 miR-181a-5p表達的改變調節(jié)OSCC細胞增殖
2.4 miR-181a-5p對 OSCC細胞系平板克隆的影響
2.5 miR-181a-5p對 OSCC細胞系周期的影響
2.6 miR-181a-5p對 OSCC細胞系凋亡的影響
2.7 miR-181a-5p對 OSCC細胞系侵襲的影響
2.8 miR-181a-5p對 OSCC細胞系遷移的影響
3 討論
4 結論
第五部分 miR-181a-5p靶向調控TIMP1 影響人類口腔鱗癌細胞的生物學功能
1 材料與方法
1.1 實驗細胞
1.2 儀器與試劑
1.3 實驗方法
1.4 統(tǒng)計分析
2 結果
2.1 miR-181a-5p靶基因的預測
2.2 靶基因的互作與預后分析
2.3 各處理組細胞中靶基因及其互作基因的表達驗證
3 討論
4 結論
參考文獻
綜述
參考文獻
附錄
致謝
個人簡介
本文編號:3862365
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