發(fā)布時(shí)間：2021-09-03 13:59

　　研究背景:肝細(xì)胞癌是嚴(yán)重影響生活質(zhì)量和生命健康的消化系統(tǒng)常見(jiàn)的疾病之一,據(jù)最新數(shù)據(jù)表明,肝細(xì)胞癌占全球惡性腫瘤發(fā)病率第六位,在惡性腫瘤死因中占第四位。雖然目前對(duì)肝細(xì)胞癌的治療方法較多,且以手術(shù)治療為主,但絕大多數(shù)病人仍難免死于腫瘤的復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移。然而目前對(duì)于其惡性程度高,治療效果差,患者預(yù)后不理想的確切分子機(jī)制尚不完全清楚,因此,探索新的基因功能改變與肝細(xì)胞癌發(fā)展的關(guān)系,對(duì)揭示肝細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制、提高患者預(yù)后及生存重要的意義。核仁紡錘體相關(guān)蛋白（NUSAP1）是一種重要的微管結(jié)合蛋白,它在有絲分裂過(guò)程中參與微管交聯(lián),調(diào)控著絲粒微管的功能,支配著染色體的擺動(dòng)。此外,NUSAP1還調(diào)控紡錘體組裝、染色體分離和細(xì)胞分裂。近年來(lái)研究表明NUSAP1在黑素瘤、乳腺癌、急性骨髓性白血病等許多腫瘤中都存在高表達(dá),但是NUSAP1與肝癌的關(guān)系以及參與細(xì)胞生物學(xué)過(guò)程中的確切機(jī)制并未十分明確。本研究旨在探討NUSAP1在HCC中的表達(dá)情況及其與預(yù)后不良之間的關(guān)系,同時(shí)探究NUSAP1在HCC發(fā)生發(fā)展過(guò)程中生物學(xué)作用及其分子機(jī)制,尋找HCC早期診斷相關(guān)的分子標(biāo)志物和藥物作用靶點(diǎn)。方法:1、收集6個(gè)獨(dú)立... 

【文章來(lái)源】：南昌大學(xué)江西省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

A用Meta分析對(duì)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)集篩選差異表達(dá)基因的流程圖

第3章結(jié)果24圖3.1B37個(gè)差異表達(dá)基因在肝細(xì)胞癌和正常組織中表達(dá)情況的可視化熱圖綜上，基于6個(gè)獨(dú)立數(shù)據(jù)集（5個(gè)GEO數(shù)據(jù)集和1個(gè)TCGA數(shù)據(jù)集）共714例肝細(xì)胞癌組織樣本和359例正常樣本的整合分析，我們共篩選出11個(gè)在所有數(shù)據(jù)集的肝細(xì)胞癌組織中都顯著且穩(wěn)定高表達(dá)的基因：BBOX1,CENPA,DLGAP5,FOXM1,KIF20A,KIF4A,MKI67,NCAPG,NUSAP1,SFN,和TPX2。由于其中大部分基因在癌癥中的發(fā)生發(fā)展作用已經(jīng)在許多研究中得到證實(shí)，只有關(guān)于NUSAP1的研究甚少，雖然我們猜測(cè)NUSAP1可能參與肝細(xì)胞癌的發(fā)生發(fā)展，但其在肝細(xì)胞癌中的功能及作用仍然未知，因此我們對(duì)NUSAP1展開(kāi)進(jìn)一步的研究。3.2NUSAP1在HCC中高表達(dá)且與患者生存和臨床病理分型有關(guān)NUSAP1是一種約55KD大小的核仁蛋白，它是有絲分裂過(guò)程中紡錘體形成的重要組成部分。為了證實(shí)NUSAP1在肝細(xì)胞癌中的表達(dá)情況，我們整合了GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中的6個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行NUSAP1單個(gè)基因的Meta分析，通過(guò)計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)化均

第3章結(jié)果25數(shù)差(SMD)及其95%CI繪制森林圖，如圖3.2A。結(jié)果表明，NUSAP1在肝細(xì)胞癌中的表達(dá)量是顯著高于正常肝組織對(duì)照組的，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（95%CI=1.63-2.26，P=1.87×10-73）。并且6個(gè)數(shù)據(jù)集之間異質(zhì)性較小（P=0.11，I2=44%），結(jié)果可靠性強(qiáng)。圖3.2ANUSAP1在癌組織和正常組織表達(dá)差異Meta分析為了進(jìn)一步研究NUSAP1在肝細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展中的作用，我們整合了轉(zhuǎn)錄組與臨床生存數(shù)據(jù)。我們將TCGA的肝癌相關(guān)表達(dá)數(shù)據(jù)分為兩組，即癌組織和非癌組織，進(jìn)行表達(dá)差異分析。結(jié)果顯示NUSAP1在癌組織和非癌組織中的表達(dá)差異顯著(t值=8.93,P=7.17×1016如圖3.2B)，與上述Meta分析結(jié)果一致。同時(shí)，我們對(duì)肝癌的臨床樣本進(jìn)行生存分析，以基因表達(dá)值的中位值為二分類(lèi)閾值，將樣本分為高表達(dá)組和低表達(dá)組；進(jìn)行LogRank檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)NUSAP1高表達(dá)與NUSAP1低表達(dá)組的生存曲線(xiàn)有明顯差異，且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.00929，圖3.2C），也就是說(shuō)NUSAP1高表達(dá)的患者生存時(shí)間更短圖3.2BNUASP1在癌組織和癌旁組織中的表達(dá)程度圖3.2CNUSAP1表達(dá)與患者生存的關(guān)系


本文編號(hào)：3381242