轉(zhuǎn)HOXA10基因小鼠和豬的制備及基因功能研究
發(fā)布時間:2017-05-08 18:16
本文關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)HOXA10基因小鼠和豬的制備及基因功能研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:繁殖性狀是影響?zhàn)B豬生產(chǎn)的重要經(jīng)濟性狀之一,其中產(chǎn)仔數(shù)是衡量母豬繁殖性狀的一個重要指標。提高產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)鍵在于降低豬胚胎/胎兒死亡率,提高胎兒存活率。而胚胎死亡絕大多數(shù)發(fā)生在胚胎附植前或附植期間,因此胚胎附植是影響母豬產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)鍵時期。有研究表明轉(zhuǎn)錄因子HOXA10基因(同源異形框A10基因)受雌激素、孕激素調(diào)控,高表達于著床窗口期,對胚胎附植的建立、妊娠的維持等具有重要作用。通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)制備特定時期在特異組織中高表達HOXA10基因的轉(zhuǎn)基因動物,降低胚胎死亡,提高產(chǎn)仔數(shù)是我們努力的目標。本研究通過轉(zhuǎn)基因小鼠模型積累實驗數(shù)據(jù),為制備高繁殖力轉(zhuǎn)基因豬奠定基礎(chǔ);通過轉(zhuǎn)基因克隆技術(shù),以期獲得高繁殖潛力的轉(zhuǎn)基因克隆豬,獲取新的科研材料;深入了解HOXA10基因在胚胎發(fā)育和附植過程中的調(diào)控機理,對于提高母豬產(chǎn)仔數(shù)具有重要的理論和實踐意義。本研究主要研究結(jié)果如下:1.采用顯微注射法制備轉(zhuǎn)HOXA10基因小鼠,通過Southern及外源插入片段的全長擴增對G0代陽性小鼠進行鑒定。對G2代陽性小鼠的各組織中Hoxa10基因的表達進行檢測,發(fā)現(xiàn)在腎臟、膀胱和子宮內(nèi)膜組織中有表達,在心臟、脾臟和卵巢中有痕量表達。G2代母鼠腹腔注射雌激素、孕激素來誘導Hoxa10基因表達,使用Q-PCR及Western blot檢測Hoxa10表達的差異,并用Q-PCR檢測受Hoxa10調(diào)控的下游基因:ETA(內(nèi)皮素受體A)和Phgdh(磷酸甘油酸脫氫酶),發(fā)現(xiàn)這些基因在轉(zhuǎn)基因小鼠和非轉(zhuǎn)基因小鼠中的表達具有差異。統(tǒng)計分析經(jīng)產(chǎn)胎次的G2代小鼠產(chǎn)仔數(shù),發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因小鼠比非轉(zhuǎn)基因小鼠提高產(chǎn)仔數(shù)約1只(P=0.08),可以認為轉(zhuǎn)HOXA10基因小鼠的產(chǎn)仔數(shù)有增加的趨勢。2.對實驗室前期獲得的6頭G0代轉(zhuǎn)HOXA10基因克隆公豬進行傳代,產(chǎn)生了56頭G1代小豬,經(jīng)檢測有25頭為陽性,其中11頭雌性。檢測G0代轉(zhuǎn)基因克隆公豬12個組織中HOXA10的表達情況。結(jié)果顯示:HOXA10基因在腎臟、大腸和膀胱中的表達較高;肌肉和淋巴有微弱表達;心臟、肝臟、脾臟、肺臟、脂肪、小腸和睪丸中未檢測到表達。3.對4頭G0代轉(zhuǎn)基因克隆公豬及部分G1代豬(陽性和陰性)進行血液生理生化指標測定,發(fā)現(xiàn)G0代轉(zhuǎn)基因克隆公豬及G1代公豬(陽性與陰性)血小板數(shù)目均低于非轉(zhuǎn)基因公豬和文獻報道的血小板數(shù)目。生化指標中,G0代轉(zhuǎn)基因克隆公豬的睪酮含量低于非轉(zhuǎn)基因公豬,其它指標沒有發(fā)現(xiàn)異常。4.通過對豬胎兒成纖維細胞進行性別鑒定、脂質(zhì)體介導轉(zhuǎn)染pc3.1-PF3-HOXA10表達載體、G418篩選、單克隆挑選、PCR檢測,建立了4株穩(wěn)定轉(zhuǎn)染HOXA10的陽性細胞系。5.利用胚胎移植技術(shù),核移植其中1株生長狀態(tài)較好的細胞,成功制備了3頭轉(zhuǎn)HOXA10基因克隆母豬。采用Q-PCR和染色體步移技術(shù)對轉(zhuǎn)基因克隆母豬的外源基因拷貝數(shù)及整合位點進行檢測,發(fā)現(xiàn)3頭豬的拷貝數(shù)分別為27.70、19.88、25.26,外源片段可能插入到4號、9號、13號、14號染色體上。6.采用Lnc RNA芯片,分析在Ishikawa細胞(子宮內(nèi)膜癌細胞株)中過表達HOXA10基因后,引起差異表達的m RNA和Lnc RNA。發(fā)現(xiàn)過表達HOXA10基因后,有339個m RNA上調(diào)表達,568個m RNA下調(diào)表達(Fold Change≥2,P0.05及Q0.05)。對過表達HOXA10基因后差異表達的m RNA進行GO分析,發(fā)現(xiàn)上調(diào)表達的m RNA主要參與血管發(fā)育、細胞粘附、細胞遷移等生物過程;下調(diào)表達的m RNA主要參與細胞周期、胞內(nèi)運輸、蛋白核定位等生物過程。進行KEGG通路分析時,發(fā)現(xiàn)差異表達基因主要涉及細胞粘附分子、細胞周期等生物學通路。7.對Lnc RNA進行分析,發(fā)現(xiàn)過表達HOXA10基因后,引起732個Lnc RNA上調(diào)表達,294個Lnc RNA下調(diào)表達(Fold Change≥2,P0.05及Q0.05)。對全部Lnc RNA進行亞組分析,共檢測到1,514條類似增強子的Lnc RNA,其中有43條上調(diào)表達,16條下調(diào)表達。在9,987條基因間長鏈非編碼RNA中,有274條上調(diào)表達,98條下調(diào)表達。通過分析可能與胚胎附植相關(guān)的差異表達的m RNA相鄰的差異表達的Lnc RNA,來預測與胚胎附植相關(guān)的Lnc RNA。
【關(guān)鍵詞】:豬 HOXA10 轉(zhuǎn)基因 小鼠 Ishikawa細胞 LncRNA
【學位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:S828;Q78
【目錄】:
- 摘要8-10
- Abstract10-13
- 縮略詞表13-15
- 1 前言15-34
- 1.1 研究問題的由來15-16
- 1.2 胚胎附植16-17
- 1.2.1 豬胚胎/胎兒死亡的原因16-17
- 1.2.2 胚胎附植過程17
- 1.3 HOXA10 基因在胚胎附植過程中的作用17-23
- 1.3.1 HOXA10 基因概述17-18
- 1.3.2 HOXA10 基因與子宮內(nèi)膜容受性18-19
- 1.3.3 調(diào)節(jié)HOXA10 基因表達的因子19-20
- 1.3.4 HOXA10 調(diào)控的下游基因20-23
- 1.4 HOXA10 基因的其他功能研究23-24
- 1.5 轉(zhuǎn)基因動物研究進展24-29
- 1.5.1 轉(zhuǎn)基因技術(shù)與轉(zhuǎn)基因動物24-25
- 1.5.2 轉(zhuǎn)基因豬的應用前景及存在問題25-28
- 1.5.3 轉(zhuǎn)基因克隆技術(shù)在轉(zhuǎn)基因豬中的應用28-29
- 1.6 LncRNA的研究進展29-32
- 1.6.1 LncRNA概述29-31
- 1.6.2 LncRNA在家畜中的研究進展31-32
- 1.6.3 LncRNA與胚胎附植32
- 1.7 研究目的與意義32-34
- 2 材料與方法34-62
- 2.1 材料34-41
- 2.1.1 實驗動物34
- 2.1.2 細胞樣品34
- 2.1.3 載體及菌株34-36
- 2.1.4 主要儀器設(shè)備36-37
- 2.1.5 主要試劑及試劑盒37-40
- 2.1.6 主要分子生物學軟件及數(shù)據(jù)庫40-41
- 2.2 研究方法41-62
- 2.2.1 本研究技術(shù)路線41-44
- 2.2.2 轉(zhuǎn)基因小鼠的制備與檢測44-53
- 2.2.3 轉(zhuǎn)基因克隆公豬的傳代與檢測53-54
- 2.2.4 轉(zhuǎn)基因克隆母豬的制備54-57
- 2.2.5 與HOXA10 表達相關(guān)的差異mRNA和LncRNA篩選57-62
- 3 結(jié)果62-94
- 3.1 轉(zhuǎn)基因小鼠的制備與檢測62-70
- 3.1.1 制備轉(zhuǎn)基因小鼠外源片段的獲得62-63
- 3.1.2 G0 代轉(zhuǎn)基因小鼠的檢測63-65
- 3.1.3 轉(zhuǎn)基因小鼠的傳代及產(chǎn)仔數(shù)的觀察65-67
- 3.1.4 G2 代轉(zhuǎn)基因小鼠Hoxa10 基因的表達檢測67-70
- 3.2 轉(zhuǎn)基因克隆公豬的傳代與檢測70-77
- 3.2.1 轉(zhuǎn)基因豬的擴繁70
- 3.2.2 轉(zhuǎn)基因克隆公豬HOXA10 基因的組織表達檢測70-71
- 3.2.3 G0 代克隆公豬生理生化指標測定71-73
- 3.2.4 轉(zhuǎn)基因G1 代豬生理生化指標測定73-77
- 3.3 轉(zhuǎn)基因克隆母豬的制備與初步鑒定77-83
- 3.3.1 胎兒成纖維細胞的性別鑒定77
- 3.3.2 pc3.1-PF3-HOXA10 載體的線性化及穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞的構(gòu)建77-80
- 3.3.3 轉(zhuǎn)HOXA10 基因克隆母豬的初步鑒定80-83
- 3.4 與HOXA10 表達相關(guān)的差異mRNA和LncRNA功能預測83-94
- 3.4.1 pcDNA3.1(+)/HOXA10 載體構(gòu)建83
- 3.4.2 Ishikawa細胞的轉(zhuǎn)染及表達檢測83-84
- 3.4.3 用于LncRNA芯片雜交的RNA質(zhì)量檢測84-86
- 3.4.4 差異表達的mRNA和LncRNA的聚類分析86-90
- 3.4.5 差異表達mRNA的Gene Ontology與KEGG通路分析90-91
- 3.4.6 LncRNA的子類與亞組分析91-92
- 3.4.7 可能與胚胎附植相關(guān)的LncRNA92
- 3.4.8 差異表達mRNA和LncRNA的Q-PCR驗證92-94
- 4 討論94-102
- 4.1 選擇豬HOXA10 基因作為目標基因的理由94
- 4.2 轉(zhuǎn)基因動物制備方法的評估94-96
- 4.2.1 顯微注射法與體細胞核移植法的比較94-95
- 4.2.2 供體細胞的選擇與陽性細胞系的建立95-96
- 4.2.3 胚胎移植96
- 4.3 關(guān)于轉(zhuǎn)基因動物的檢測方法96-98
- 4.3.1 轉(zhuǎn)基因動物的鑒定方法96
- 4.3.2 外源基因拷貝數(shù)及整合位點的檢測96-97
- 4.3.3 血液生理生化指標的檢測97-98
- 4.4 關(guān)于本研究中轉(zhuǎn)基因小鼠部分的討論98-99
- 4.4.1 關(guān)于啟動子的選擇98-99
- 4.4.2 誘導小鼠Hoxa10 基因表達及產(chǎn)仔數(shù)比較99
- 4.5 選擇LncRNA芯片進行基因功能研究的討論99-102
- 4.5.1 LncRNA的研究方法99-100
- 4.5.2 LncRNA芯片結(jié)果的討論100-102
- 5 小結(jié)102-104
- 5.1 本研究的主要結(jié)論102-103
- 5.2 本研究的創(chuàng)新點與特色103
- 5.3 本研究的不足與進一步工作的設(shè)想103-104
- 參考文獻104-121
- 攻讀學位期間發(fā)表論文題錄121-122
- 致謝122-124
【參考文獻】
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本文關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)HOXA10基因小鼠和豬的制備及基因功能研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:351643
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