鎘脅迫下河南華溪蟹肝胰腺microRNA表達(dá)譜的研究
發(fā)布時(shí)間:2023-10-28 16:19
近年來(lái),食品安全作為一項(xiàng)重要的民生問(wèn)題,廣受社會(huì)民眾的關(guān)注。隨著經(jīng)濟(jì)快速增長(zhǎng),現(xiàn)代工業(yè)的不斷發(fā)展,水生生物重金屬鎘污染越加嚴(yán)重,對(duì)水產(chǎn)品的食品安全造成巨大影響,對(duì)人類(lèi)產(chǎn)生多種健康危害。河南華溪蟹在我國(guó)分布廣泛,且對(duì)重金屬非常敏感,是監(jiān)測(cè)水生生物鎘污染的理想指示生物。通過(guò)研究鎘對(duì)河南華溪蟹的毒性效應(yīng)及其分子機(jī)制,有助于探究鎘污染對(duì)水生生物的生產(chǎn)繁殖和對(duì)水產(chǎn)品的食品安全的危害作用。肝胰腺是河南華溪蟹鎘積累的主要器官,也是鎘污染毒性危害的主要靶器官。本研究組前期通過(guò)生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)等方法揭示了鎘對(duì)河南華溪蟹肝胰腺的毒性效應(yīng),然而對(duì)其分子機(jī)制了解較少,特別是有關(guān)鎘污染對(duì)河南華溪蟹轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制的研究。此外,為了更好的模擬水生生物生長(zhǎng)環(huán)境,本研究采用亞慢性鎘暴露方法,并選擇低濃度(0.5mg/L)作為鎘處理濃度。將河南華溪蟹隨機(jī)分為兩組:對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組(0.5mg/L),處理30天后取其肝胰腺進(jìn)行如下實(shí)驗(yàn)。(1)河南華溪蟹肝胰腺microRNA(miRNA)序列測(cè)定:對(duì)其進(jìn)行RNA的提取、cDNA文庫(kù)的構(gòu)建、原始序列的獲取、序列數(shù)據(jù)的篩選以及miRNA的分析。結(jié)果表明:在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的兩個(gè)...
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 綜述
1.1 重金屬鎘及其危害
1.1.1 重金屬鎘
1.1.2 鎘對(duì)食品安全性的影響
1.1.3 鎘對(duì)人的影響
1.1.3.1 鎘對(duì)人體器官的影響
1.1.3.2 鎘對(duì)神經(jīng)發(fā)育的影響
1.1.3.3 鎘對(duì)兒童智力和行為方面的影響
1.2 膳食鎘污染
1.2.1 水環(huán)境污染現(xiàn)狀
1.2.2 人類(lèi)膳食結(jié)構(gòu)調(diào)整及水產(chǎn)品鎘污染情況
1.3 鎘對(duì)河南華溪蟹的影響研究進(jìn)展
1.3.1 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺氧化損傷
1.3.2 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺形態(tài)學(xué)變化
1.3.3 河南華溪蟹肝胰腺轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和基因表達(dá)分析
1.4 本學(xué)位論文的研究?jī)?nèi)容與意義
第二章 河南華溪蟹肝胰腺microRNA序列測(cè)定
2.1 材料和方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要試劑及儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.4.1 河南華溪蟹肝胰腺樣本RNA的抽提和純化
2.1.4.2 河南華溪蟹肝胰腺樣本c DNA文庫(kù)的構(gòu)建
2.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組RNA序列分析
2.2.2 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組miRNA的驗(yàn)證
2.2.3 樣本高質(zhì)量序列與已知數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)分析結(jié)果
2.2.4 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組miRNA基本信息的分析
2.2.5 河南華溪蟹miRNA信息與其他蟹種比對(duì)分析結(jié)果
2.3 討論
2.3.1 物種多樣性和組織特異性可能導(dǎo)致miRNA峰值的不同
2.3.2 河南華溪蟹肝胰腺中存在的miRNA具有特異性
2.3.3 許多miRNA在多種生物中存在并發(fā)揮重要作用
2.4 結(jié)論
第三章 河南華溪蟹肝胰腺對(duì)照組與實(shí)驗(yàn)組差異表達(dá)miRNA的鑒定以及qRT-PCR驗(yàn)證
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 主要試劑及儀器
3.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
3.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
3.1.4.1 實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中發(fā)生差異化表達(dá)的miRNA的比較研究
3.1.4.2 qRT-PCR驗(yàn)證
3.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.1 兩組之間發(fā)生差異表達(dá)的miRNA
3.2.2 通過(guò)qRT-PCR驗(yàn)證差異表達(dá)的miRNA
3.3 討論
3.4 結(jié)論
第四章 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺組織中差異表達(dá)的miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 主要試劑與儀器
4.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
4.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4.1 目的基因預(yù)測(cè)與分析
4.1.4.2 差異表達(dá)基因的GO基因功能分析和KEGG途徑富集分析
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.2.1 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺差異表達(dá)miRNA的靶基因預(yù)測(cè)
4.2.2 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)-GO基因功能分析
4.2.3 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)-KEGG代謝通路分析
4.3 討論
4.3.1 GO基因功能分類(lèi)顯示,大多數(shù)靶基因與氧化還原酶的調(diào)控有關(guān)
4.3.2 KEGG代謝途徑結(jié)果表明,許多途徑與蛋白的生物合成、降解以及修飾等的調(diào)控有關(guān)
4.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)況及聯(lián)系方式
本文編號(hào):3857342
【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 綜述
1.1 重金屬鎘及其危害
1.1.1 重金屬鎘
1.1.2 鎘對(duì)食品安全性的影響
1.1.3 鎘對(duì)人的影響
1.1.3.1 鎘對(duì)人體器官的影響
1.1.3.2 鎘對(duì)神經(jīng)發(fā)育的影響
1.1.3.3 鎘對(duì)兒童智力和行為方面的影響
1.2 膳食鎘污染
1.2.1 水環(huán)境污染現(xiàn)狀
1.2.2 人類(lèi)膳食結(jié)構(gòu)調(diào)整及水產(chǎn)品鎘污染情況
1.3 鎘對(duì)河南華溪蟹的影響研究進(jìn)展
1.3.1 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺氧化損傷
1.3.2 鎘暴露后河南華溪蟹肝胰腺形態(tài)學(xué)變化
1.3.3 河南華溪蟹肝胰腺轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和基因表達(dá)分析
1.4 本學(xué)位論文的研究?jī)?nèi)容與意義
第二章 河南華溪蟹肝胰腺microRNA序列測(cè)定
2.1 材料和方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要試劑及儀器
2.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.4.1 河南華溪蟹肝胰腺樣本RNA的抽提和純化
2.1.4.2 河南華溪蟹肝胰腺樣本c DNA文庫(kù)的構(gòu)建
2.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.1 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組RNA序列分析
2.2.2 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組miRNA的驗(yàn)證
2.2.3 樣本高質(zhì)量序列與已知數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)分析結(jié)果
2.2.4 河南華溪蟹肝胰腺實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組miRNA基本信息的分析
2.2.5 河南華溪蟹miRNA信息與其他蟹種比對(duì)分析結(jié)果
2.3 討論
2.3.1 物種多樣性和組織特異性可能導(dǎo)致miRNA峰值的不同
2.3.2 河南華溪蟹肝胰腺中存在的miRNA具有特異性
2.3.3 許多miRNA在多種生物中存在并發(fā)揮重要作用
2.4 結(jié)論
第三章 河南華溪蟹肝胰腺對(duì)照組與實(shí)驗(yàn)組差異表達(dá)miRNA的鑒定以及qRT-PCR驗(yàn)證
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 主要試劑及儀器
3.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
3.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
3.1.4.1 實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中發(fā)生差異化表達(dá)的miRNA的比較研究
3.1.4.2 qRT-PCR驗(yàn)證
3.1.4.3 數(shù)據(jù)處理
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.1 兩組之間發(fā)生差異表達(dá)的miRNA
3.2.2 通過(guò)qRT-PCR驗(yàn)證差異表達(dá)的miRNA
3.3 討論
3.4 結(jié)論
第四章 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺組織中差異表達(dá)的miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 主要試劑與儀器
4.1.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
4.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4.1 目的基因預(yù)測(cè)與分析
4.1.4.2 差異表達(dá)基因的GO基因功能分析和KEGG途徑富集分析
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.2.1 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺差異表達(dá)miRNA的靶基因預(yù)測(cè)
4.2.2 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)-GO基因功能分析
4.2.3 河南華溪蟹鎘暴露組肝胰腺miRNA生物信息學(xué)功能預(yù)測(cè)-KEGG代謝通路分析
4.3 討論
4.3.1 GO基因功能分類(lèi)顯示,大多數(shù)靶基因與氧化還原酶的調(diào)控有關(guān)
4.3.2 KEGG代謝途徑結(jié)果表明,許多途徑與蛋白的生物合成、降解以及修飾等的調(diào)控有關(guān)
4.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
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本文編號(hào):3857342
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