珙桐CesA基因的克隆及在種子發(fā)育中的表達分析
本文關鍵詞:珙桐CesA基因的克隆及在種子發(fā)育中的表達分析
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【摘要】:珙桐又名鴿子樹,是我國特有的一級保護珍稀瀕危植物,第三紀古熱帶植物孑遺種,具有很高的學術研究價值和觀賞價值。其種子繁殖能力弱,自然更新困難,休眠期長,對生長環(huán)境要求苛刻。種子敗育嚴重是制約珙桐有性繁殖的重要原因之一,這種現(xiàn)象在許多木本植物中是普遍存在的。目前對于這種自發(fā)的種子敗育機制缺乏分子水平上的解釋。本實驗前期通過轉錄組測序,已建立珙桐果實和種子的unigene庫,以上述unigene庫作為參考序列,通過數(shù)字表達譜分析,在珙桐正常種子和敗育種子中篩選出2361個差異表達基因。其中我們發(fā)現(xiàn)纖維素合酶基因(CesM)在敗育種子中較正常種子呈現(xiàn)一致的顯著上調表達。本實驗通過分析纖維素合酶基因在珙桐種子發(fā)育過程中的表達模式,結合纖維素含量的測定,初步研究了珙桐中纖維素合酶的活性變化規(guī)律及在種子發(fā)育過程中所行駛的功能。并進一步選擇了一個基因,通過對該基因的表達分析,克隆,蛋白表達和功能驗證進一步明確該基因的功能。本研究旨在挖掘珙桐基因資源,解析種子敗育的分子機制,為理解種子自發(fā)敗育的生物學意義提供理論基礎。主要研究內容如下:1.珙桐纖維素合酶基因的轉錄組數(shù)據(jù)分析在珙桐種子轉錄組數(shù)據(jù)庫中篩選出14個纖維素合酶基因(CesA),共有22個轉錄本,在敗育種子中呈現(xiàn)一致的顯著上調表達。其中有7個基因在正常種子和敗育種子中表達差異顯著。2.纖維素合酶基因的表達分析qPCR檢測表明CesM基因在敗育種子中呈現(xiàn)一致的顯著上調表達,挑選4個在敗育種子中顯著上調的CesM基因進行表達分析,結果表明它們表達模式相似,在敗育種子中表達量均顯著高于正常種子,且在正常種子發(fā)育后期上調表達。將表達差異最顯著的c43681.graph_c0基因在珙桐不同組織中進行表達分析,結果顯示c43681.graph_c0基因在花和果實等生殖器官中表達量較高,在葉和芽等營養(yǎng)器官中表達量較低,在敗育的種子中表達量最高。證明c43681.graph_c0基因在生殖器官中偏好表達。3.c43681.graph_c 基因的克隆及編碼產(chǎn)物特征分析設計引物將序列c43681.graph_c0基因進行克隆獲得882bp片段,經(jīng)序列分析,其編碼產(chǎn)物包含292個氨基酸,具有6個跨膜結構域,等電點為9.07,為堿性蛋白,與擬南芥纖維素合酶4號催化亞基同源性最高,含有在植物中特有的保守區(qū)域。4.目標基因表達蛋白質將成功構建的pET28/CesA重組質粒導入宿主大腸桿菌BL21中進行原核表達,使用SDS-PAGE電泳進行分析。通過對誘導條件的摸索,誘導時間為4 h、IPTG誘導濃度為1 mmol/L時,纖維素合酶基因的表達量最大。5.基因功能驗證將成功構建的pBI121/CesA重組質粒導入宿主農(nóng)桿菌中,利用花序浸染法將目標基因轉化擬南芥,利用含有卡那霉素的培養(yǎng)基對收獲的種子進行初步篩選,觀察轉入目標基因的擬南芥植株的發(fā)育及第二代種子敗育情況。實驗證明,未成功轉入目標基因的植株也能出芽,但是在未長出真葉之前就會白化進而死亡。
【學位授予單位】:中南林業(yè)科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q943.2;S792.99
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,本文編號:1276353
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