國家I級保護野生動物、珍稀瀕危物種——鱷蜥(Shinisaurus crocodilurus Ahl,1930)正面臨嚴峻的生存問題,包括種群數(shù)量快速下降、生境地遭受破壞導致片段化、疾病起源與治療方案未知等多重問題。物種長期生存,依賴于內(nèi)在基因的遺傳多樣性,特別是免疫基因的遺傳多樣性對物種抵御環(huán)境變化、病原體侵襲至關(guān)重要,了解鱷蜥免疫基因多樣性有助于評估其長期生存能力、對野外自然環(huán)境病原體的抗性,對人工繁育管理、野外放歸策略的制定具有重大的指導意義。在免疫基因中,先天性TLR4(Toll-like receptor 4)基因已經(jīng)被證明對爬行類物種的免疫具有重要功能,MHC(Major histocompatibility complex)基因則在大多數(shù)脊椎動物中均有分布且研究廣泛,在爬行動物的免疫系統(tǒng)中與其他哺乳類具有同等重要的功能。有研究資料表明,TLR受體對MHC受體的表達具有調(diào)控作用,這兩個基因可以為研究鱷蜥復雜的免疫系統(tǒng)提供基礎資料。因此,為了解鱷蜥免疫基因遺傳多樣性程度,本文選取MHC基因與TLR4基因,利用PCR擴增與測序及生物信息學分析方法,對國內(nèi)廣西大桂山、廣西大瑤山、廣...

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1 鱷蜥MHCI氨基酸序列與其他物種比對

如圖1-2所示,MHCI的893D1基因編碼的α1結(jié)構(gòu)域與其他物種同源性在48.2%-61.4%之間,α2在44.9%到77.5之間,α3在28.9%到67.5%之間。MHCI的636D7α1結(jié)構(gòu)域與其他物種同源性在24.1%到51.2%之間,α2在34.8%到61.8%之間,α....

圖1-2 鱷蜥MHCI氨基酸與其他物種同源性比對

圖1-1鱷蜥MHCI氨基酸序列與其他物種比對2.3.2最佳引物篩選結(jié)果

圖2 MHCII基因898D1的PCR條帶圖

本實驗中所有MHC基因擴增位點的產(chǎn)物長度大致相同,長度在230bp²58bp之間,因此條帶的位置差異不具明顯性,不將所有擴增位點的條帶圖展示,僅將898D1基因擴增的外顯子3條帶圖在本文展示,如圖2所示,該圖條帶長250bp。2.3.4序列多態(tài)性分析

圖3-1 MHCI基因序列比對

MHCI-898D1基因大部分個體都表現(xiàn)出序列的高度一致性,如圖3-3所示,該基因的外顯子2僅有一個堿基位點的變異。但值得注意的是,一只來自廣西大桂山種群的鱷蜥個體a2具有24個堿基變異位點,具有相當高的多態(tài)性,與其他物種的MHC多態(tài)性相當。經(jīng)過對這只個體的兩次獨立擴增和測序,并....

本文編號：4038306