茉莉花MK基因及啟動(dòng)子克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2024-05-10 03:07
甲羥戊酸激酶在植物萜類化合物合成中具有重要作用。本研究以茉莉花轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),利用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)技術(shù),從雙瓣茉莉花中獲得甲羥戊酸激酶(mevalonate kinase, MK)基因,命名為JsMK (GenBank登錄號(hào)為MH311040)。測(cè)序結(jié)果顯示JsMK全長(zhǎng)cDNA為1 608 bp,包含開放閱讀框(ORF) 1 164 bp,編碼387個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明該基因編碼的蛋白可能定位于細(xì)胞質(zhì)中,為非親水性穩(wěn)定蛋白,含有與其他MK蛋白所共有的3個(gè)保守區(qū),以及GHMP家族特有的N端保守區(qū)和C端保守區(qū)。Blast比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,JsMK蛋白與野生油橄欖、長(zhǎng)春花等多種植物的MK蛋白同源性較高。采用染色體步移技術(shù)(Genenome walking technique)擴(kuò)增MK基因5’端上游調(diào)控序列,獲得709 bp啟動(dòng)子序列,PlantCare分析表明該序列含有大量基本順式作用元件TATAbox、CAATbox,還存在生長(zhǎng)素(IAA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、脫落酸(ABA)等激素響應(yīng)激素及多個(gè)光響應(yīng)順式調(diào)控元件。利用實(shí)時(shí)熒光定量PC...
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 JsMK克隆及序列分析
1.2 JsMK蛋白理化性質(zhì)分析
1.3 JsMK的同源比對(duì)分析
1.4 啟動(dòng)子序列分析
1.5 不同激素處理對(duì)JsMK基因表達(dá)水平的影響
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 RNA提取及cDNA的合成
3.3 JsMK基因克隆
3.4 啟動(dòng)子的分離
3.5 生物信息學(xué)分析
3.6 JsMK實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)
作者貢獻(xiàn)
本文編號(hào):3968649
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1 結(jié)果與分析
1.1 JsMK克隆及序列分析
1.2 JsMK蛋白理化性質(zhì)分析
1.3 JsMK的同源比對(duì)分析
1.4 啟動(dòng)子序列分析
1.5 不同激素處理對(duì)JsMK基因表達(dá)水平的影響
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 RNA提取及cDNA的合成
3.3 JsMK基因克隆
3.4 啟動(dòng)子的分離
3.5 生物信息學(xué)分析
3.6 JsMK實(shí)時(shí)熒光定量表達(dá)
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