貓科動(dòng)物作為占據(jù)較高營(yíng)養(yǎng)級(jí)的捕食者,在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著重要功能,受到環(huán)境變化的影響較大。隨著棲息地適宜性降低、野生獵物減少,一些貓科動(dòng)物處于瀕臨滅絕的境地。豹貓(Prionailurus bengalensis)是一種在我國(guó)廣泛分布的小型貓科動(dòng)物,對(duì)其受到棲息地破碎化的影響、遺傳分化及種群構(gòu)成的研究較少。本研究通過非損傷途徑,借助微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)分子標(biāo)記及高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)北京地區(qū)豹貓種群的遺傳現(xiàn)狀及其與赤狐(Vulpes Vulpes)的生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系進(jìn)行評(píng)估。豹貓種群的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)及腸道菌群多樣性分析的主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)論如下。1.在松山、云蒙山、云峰山、小龍門和百花山自然保護(hù)區(qū)共收集到601份疑似豹貓的糞便樣品。對(duì)樣品進(jìn)行DNA提取后,擴(kuò)增食肉動(dòng)物ATP 6區(qū)段進(jìn)行物種識(shí)別,使用鋅指基因進(jìn)行性別鑒定,利用篩選的6對(duì)微衛(wèi)星引物擴(kuò)增的等位基因進(jìn)行個(gè)體鑒定。共識(shí)別到112只豹貓個(gè)體,其中松山有53只(33雌、20雄),云蒙山17只(10雌、7雄),云峰山17只(14雌、3雄),小龍門13只(10雌、3雄),百花山12只(9雌、3雄)。2.6個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共檢測(cè)到31個(gè)等位基因,5...

【文章頁數(shù)】：89 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
1.引言
    1.1.豹貓的研究現(xiàn)狀
        1.1.1.豹貓
        1.1.2.豹貓的遺傳學(xué)研究
        1.1.3.豹貓的食物構(gòu)成分析
        1.1.4.豹貓的宏觀生態(tài)學(xué)研究
    1.2.保護(hù)遺傳學(xué)的應(yīng)用
        1.2.1.種群遺傳多樣性及分化
        1.2.2.微衛(wèi)星分子標(biāo)記
        1.2.3.線粒體分子標(biāo)記
    1.3.腸道菌群
        1.3.1.腸道菌群的研究方法
        1.3.2.高通量測(cè)序
        1.3.3.腸道菌群分析在動(dòng)物中的應(yīng)用
    1.4.本研究的目的和內(nèi)容
    1.5.本研究的技術(shù)路線
2.豹貓種群的遺傳多樣性研究
    2.1.實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1.實(shí)驗(yàn)樣品
        2.1.2.實(shí)驗(yàn)試劑與藥品
        2.1.3.實(shí)驗(yàn)工具與儀器
    2.2.實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1.糞便樣品總DNA提取
        2.2.2.DNA質(zhì)量檢測(cè)
        2.2.3.糞便DNA物種識(shí)別
        2.2.4.豹貓糞便DNA性別鑒定
        2.2.5.豹貓微衛(wèi)星位點(diǎn)的篩選及擴(kuò)增
        2.2.6.豹貓線粒體控制區(qū)擴(kuò)增
        2.2.7.數(shù)據(jù)分析
    2.3.研究結(jié)果
        2.3.1.DNA檢測(cè)
        2.3.2.糞便物種識(shí)別
        2.3.3.豹貓樣品性別鑒定
        2.3.4.豹貓種群微衛(wèi)星遺傳多樣性分析
        2.3.5.豹貓種群微衛(wèi)星遺傳分化分析
        2.3.6.豹貓種群線粒體控制區(qū)遺傳多樣性
        2.3.7.豹貓種群線粒體控制區(qū)遺傳分化
    2.4.討論
        2.4.1.北京地區(qū)豹貓種群個(gè)體識(shí)別及性別構(gòu)成
        2.4.2.北京地區(qū)豹貓種群微衛(wèi)星遺傳多樣性
        2.4.3.北京地區(qū)豹貓種群線粒體控制區(qū)遺傳多樣性
        2.4.4.北京地區(qū)豹貓種群遺傳分化
3.豹貓腸道菌群構(gòu)成分析
    3.1.實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1.實(shí)驗(yàn)樣品
        3.1.2.實(shí)驗(yàn)試劑與藥品
        3.1.3.實(shí)驗(yàn)儀器
    3.2.實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1.細(xì)菌16S r RNA擴(kuò)增和Miseq測(cè)序
        3.2.2.數(shù)據(jù)分析
    3.3.研究結(jié)果
        3.3.1.16 SrRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析
        3.3.2.豹貓腸道微生物組成分析
        3.3.3.北京地區(qū)豹貓腸道微生物α-多樣性分析
        3.3.4.北京地區(qū)豹貓腸道微生物β-多樣性分析
        3.3.5.北京地區(qū)豹貓腸道微生物類群差異性分析
        3.3.6.豹貓和赤狐生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系
    3.4.討論
        3.4.1.豹貓腸道微生物核心群
        3.4.2.不同地區(qū)豹貓種群腸道微生物多樣性及差異分析
        3.4.3.豹貓和赤狐腸道微生物構(gòu)成及差異
4.結(jié)論
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
致謝



本文編號(hào)：3853021