分子標(biāo)記技術(shù)在中國瀕危植物遺傳分析中的應(yīng)用 ————以四合木、蒙古沙冬青為例
發(fā)布時間:2023-05-08 05:07
蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)是沙冬青屬(Ammopiptanthus)多年生植物,是中國特有植物,也是阿拉善荒漠區(qū)的建群植物。四合木(Tetraena mongolica Maxim)屬蒺藜科(Zygophyllaceae)植物,是中國特有孑遺植物。本研究采集了不同居群的蒙古沙冬青和四合木野生個體葉片組織,利用DNA測序技術(shù)、SSR分子標(biāo)記技術(shù)、ISSR分子標(biāo)記技術(shù)從分子水平上研究了蒙古沙冬青、四合木居群的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳變異,結(jié)合地理環(huán)境因子進(jìn)行相關(guān)性分析,主要研究結(jié)果如下:(1)利用葉綠體非編碼片段psbC-trnS對蒙古沙冬青9個野生居群的cpDNA進(jìn)行測序,排序后的序列總長度為1493~1545 bp,共計103個變異位點。根據(jù)序列變異位點共確定出12種單倍型,其中H2單倍型分布最廣,推測其可能是祖先單倍型。物種水平上單倍型多樣性(Hd)指數(shù)為0.29748,核苷酸多樣性(π)指數(shù)為0.00166;居群水平上Hd指數(shù)介于0-0.81319之間?偟倪z傳多樣性Ht為0.309(0.0903)高于居群間基因多樣性Hs為0.293(0.0...
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 研究背景
1.1.1 遺傳多樣性概述
1.1.2 蒙古沙冬青的概述
1.1.3 四合木的概述
1.2 分子標(biāo)記技術(shù)概述
1.2.1 生物化學(xué)標(biāo)記法
1.2.2 第一代分子標(biāo)記
1.2.3 第二代分子標(biāo)記
1.2.4 第三代分子標(biāo)記
1.3 國內(nèi)外研究進(jìn)展
1.3.1 瀕危植物遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.3.2 瀕危植物保護(hù)現(xiàn)狀
1.4 研究目的、意義及技術(shù)路線
1.4.1 研究目的及意義
1.4.2 研究內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
2 實驗材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 供試植物
2.1.2 研究區(qū)概況
2.1.3 試劑與儀器設(shè)備
2.2 實驗方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 蒙古沙冬青cpDNA片段測序
2.2.3 蒙古沙冬青ISSR分子標(biāo)記
2.2.4 四合木SSR分子標(biāo)記
2.2.5 數(shù)據(jù)處理和相關(guān)性檢驗
3 結(jié)果與分析
3.1 基于葉綠體DNA單倍型的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
3.1.1 序列特征及單倍型分析
3.1.2 葉綠體DNA單倍型之間的親緣關(guān)系
3.1.3 遺傳多樣性格局
3.1.4 中性檢驗和失配分析
3.2 基于ISSR分子標(biāo)記的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
3.2.1 蒙古沙冬青ISSR擴增多態(tài)性分析
3.2.2 蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
3.2.3 蒙古沙冬青的遺傳結(jié)構(gòu)
3.2.4 蒙古沙冬青的聚類分析
3.2.5 不同分子標(biāo)記技術(shù)結(jié)果對比
3.3 基于SSR分子標(biāo)記的四合木遺傳多樣性分析
3.3.1 四合木遺傳多樣性分析
3.3.2 四合木居群的遺傳分化
3.3.3 四合木的遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.3.4 四合木的遺傳距離和聚類分析
3.3.5 哈迪溫伯格平衡檢驗
3.4 遺傳多樣性與地理因子相關(guān)性檢驗
3.4.1 蒙古沙冬青遺傳參數(shù)與環(huán)境因子相關(guān)性分析
3.4.2 四合木遺傳多樣性與環(huán)境因子相關(guān)性
4 討論
4.1 基于葉綠體DNA單倍型的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
4.2 基于ISSR分子標(biāo)記的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
4.3 基于SSR分子標(biāo)記的四合木遺傳多樣性分析
4.4 不同分子標(biāo)記在遺傳多樣性研究中的應(yīng)用對比
4.5 遺傳多樣性與地理因子相關(guān)性分析
5 結(jié)論
5.1 本研究主要結(jié)論
5.2 本研究創(chuàng)新之處
5.3 本研究不足之處及未來展望
縮略語表
參考文獻(xiàn)
致謝
發(fā)表文章目錄
本文編號:3812050
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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Abstract
1 引言
1.1 研究背景
1.1.1 遺傳多樣性概述
1.1.2 蒙古沙冬青的概述
1.1.3 四合木的概述
1.2 分子標(biāo)記技術(shù)概述
1.2.1 生物化學(xué)標(biāo)記法
1.2.2 第一代分子標(biāo)記
1.2.3 第二代分子標(biāo)記
1.2.4 第三代分子標(biāo)記
1.3 國內(nèi)外研究進(jìn)展
1.3.1 瀕危植物遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.3.2 瀕危植物保護(hù)現(xiàn)狀
1.4 研究目的、意義及技術(shù)路線
1.4.1 研究目的及意義
1.4.2 研究內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
2 實驗材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 供試植物
2.1.2 研究區(qū)概況
2.1.3 試劑與儀器設(shè)備
2.2 實驗方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 蒙古沙冬青cpDNA片段測序
2.2.3 蒙古沙冬青ISSR分子標(biāo)記
2.2.4 四合木SSR分子標(biāo)記
2.2.5 數(shù)據(jù)處理和相關(guān)性檢驗
3 結(jié)果與分析
3.1 基于葉綠體DNA單倍型的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
3.1.1 序列特征及單倍型分析
3.1.2 葉綠體DNA單倍型之間的親緣關(guān)系
3.1.3 遺傳多樣性格局
3.1.4 中性檢驗和失配分析
3.2 基于ISSR分子標(biāo)記的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
3.2.1 蒙古沙冬青ISSR擴增多態(tài)性分析
3.2.2 蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
3.2.3 蒙古沙冬青的遺傳結(jié)構(gòu)
3.2.4 蒙古沙冬青的聚類分析
3.2.5 不同分子標(biāo)記技術(shù)結(jié)果對比
3.3 基于SSR分子標(biāo)記的四合木遺傳多樣性分析
3.3.1 四合木遺傳多樣性分析
3.3.2 四合木居群的遺傳分化
3.3.3 四合木的遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.3.4 四合木的遺傳距離和聚類分析
3.3.5 哈迪溫伯格平衡檢驗
3.4 遺傳多樣性與地理因子相關(guān)性檢驗
3.4.1 蒙古沙冬青遺傳參數(shù)與環(huán)境因子相關(guān)性分析
3.4.2 四合木遺傳多樣性與環(huán)境因子相關(guān)性
4 討論
4.1 基于葉綠體DNA單倍型的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
4.2 基于ISSR分子標(biāo)記的蒙古沙冬青遺傳多樣性分析
4.3 基于SSR分子標(biāo)記的四合木遺傳多樣性分析
4.4 不同分子標(biāo)記在遺傳多樣性研究中的應(yīng)用對比
4.5 遺傳多樣性與地理因子相關(guān)性分析
5 結(jié)論
5.1 本研究主要結(jié)論
5.2 本研究創(chuàng)新之處
5.3 本研究不足之處及未來展望
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本文編號:3812050
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