GC376抑制α屬動物冠狀病毒復制的分子機制研究
發(fā)布時間:2023-04-22 10:26
冠狀病毒是一類對人類和動物均造成嚴重危害的病原體,對世界各國的經(jīng)濟發(fā)展、農(nóng)業(yè)發(fā)展、公共衛(wèi)生安全等均造成嚴重危害,其中豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)和貓傳染性腹膜炎病毒(Feline infectious peritonitis virus,FIPV)對動物健康構(gòu)成了嚴重威脅,二者均為α屬冠狀病毒。豬流行性腹瀉(Porcine epidemic diarrhea,PED)的致死率極高,尤其免疫功能尚未完善的仔豬,其死亡率為100%。目前,該病的防控主要依靠疫苗,但是在臨床上不能提供100%保護,并且尚無可對該病進行有效防控與治療的特效藥物。貓傳染性腹膜炎(Feline infectious peritonitis,FIP)是目前危害貓科動物健康的重要疾病之一,傳染性高且致死率為100%。臨床治療中3C樣蛋白酶(3C-like protease,3CLpro)抑制劑GC376得到了廣泛使用,目前該抑制劑在治療前期取得了較好療效,但停藥后發(fā)現(xiàn)存在復發(fā)現(xiàn)象,影響治療的效果,降低治愈率。本研究首次證明3CL
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語表(Abbreviation)
1 文獻綜述
1.1 冠狀病毒3CLpro
1.1.1 冠狀病毒概述
1.1.2 冠狀病毒基因組學及復制過程
1.1.3 冠狀病毒3CLpro相關進展
1.1.4 3CLpro抑制劑研究進展
1.2 豬流行性腹瀉研究進展
1.2.1 豬流行性腹瀉概述
1.2.2 豬流行性腹瀉病毒3CLpro研究進展
1.2.3 豬流行性腹瀉的防治措施
1.3 貓傳染性腹膜炎研究進展
1.3.1 貓傳染性腹膜炎概述
1.3.2 貓傳染性腹膜炎的治療
2 目的與意義
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.1.1 毒株、菌株、細胞與載體
3.1.2 主要試劑與藥品
3.1.3 主要儀器與設備
3.1.4 主要試劑的配制
3.1.5 生物學軟件及數(shù)據(jù)庫
3.1.6 實驗所用引物
3.1.7 實驗所用熒光多肽底物
3.2 實驗方法
3.2.1 細胞傳代培養(yǎng)
3.2.2 病毒毒價的測定(TCID50)
3.2.3 PEDV病毒的擴增
3.2.4 抑制劑GC376對病毒抑制效果評定
3.2.5 PEDV3CLpro的表達與純化
3.2.6 FRET測定不同熒光底物的特異性
3.2.7 分子對接模擬PEDV3CLpro與GC376 的結(jié)合
3.2.8 FIPV耐藥毒株的蝕斑純化
3.2.9 RNA的提取與逆轉(zhuǎn)錄反應
3.2.10 FIPV耐藥毒株全基因組PCR擴增與突變位點分析
4 結(jié)果分析
4.1 PEDV3CLpro的表達與純化
4.1.1 質(zhì)粒構(gòu)建
4.1.2 3CLpro的大量表達純化
4.2 抑制劑GC376對PEDV的抑制效果
4.2.1 抑制劑GC376對PEDV3CLpro的IC50
4.2.2 抑制劑GC376 在細胞培養(yǎng)中PEDV流行毒株的抑制效果
4.2.3 Western blot檢測GC376對PEDV的抑制效果
4.2.4 IFA法檢測GC376對PEDV的抑制效果
4.3 模擬PEDV3CLpro與抑制劑GC376 的結(jié)合模式
4.4 PEDV3CLpro的底物特異性
4.5 抑制劑GC376的優(yōu)化
4.6 確定FIPV藥物壓力下的傳代方法
4.7 50代FIPV的毒價與耐藥性變化
4.8 通過蝕斑純化法獲得耐藥性毒株
4.9 抑制劑GC376 對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.9.1 抑制劑GC376 細胞培養(yǎng)中對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.9.2 IFA法檢測GC376 對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.9.3 Western Blot檢測GC376 對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.10 耐藥性毒株突變位點的分析
5 討論
5.1 抑制劑GC376對PEDV的有效抑制作用
5.2 抑制劑GC376對其他冠狀病毒的抑制效果
5.3 關于抑制劑GC376的優(yōu)化方向
5.4 冠狀病毒對抑制劑GC376產(chǎn)生耐藥性的分子機制
5.5 抑制劑GC376作為新型冠狀病毒候選藥物的潛力
5.6 后續(xù)可開展的研究工作
6 結(jié)論
參考文獻
致謝
本文編號:3797459
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語表(Abbreviation)
1 文獻綜述
1.1 冠狀病毒3CLpro
1.1.2 冠狀病毒基因組學及復制過程
1.1.3 冠狀病毒3CLpro相關進展
1.1.4 3CLpro抑制劑研究進展
1.2 豬流行性腹瀉研究進展
1.2.1 豬流行性腹瀉概述
1.2.2 豬流行性腹瀉病毒3CLpro研究進展
1.2.3 豬流行性腹瀉的防治措施
1.3 貓傳染性腹膜炎研究進展
1.3.1 貓傳染性腹膜炎概述
1.3.2 貓傳染性腹膜炎的治療
2 目的與意義
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.1.1 毒株、菌株、細胞與載體
3.1.2 主要試劑與藥品
3.1.3 主要儀器與設備
3.1.4 主要試劑的配制
3.1.5 生物學軟件及數(shù)據(jù)庫
3.1.6 實驗所用引物
3.1.7 實驗所用熒光多肽底物
3.2 實驗方法
3.2.1 細胞傳代培養(yǎng)
3.2.2 病毒毒價的測定(TCID50)
3.2.3 PEDV病毒的擴增
3.2.4 抑制劑GC376對病毒抑制效果評定
3.2.5 PEDV3CLpro的表達與純化
3.2.6 FRET測定不同熒光底物的特異性
3.2.7 分子對接模擬PEDV3CLpro與GC376 的結(jié)合
3.2.8 FIPV耐藥毒株的蝕斑純化
3.2.9 RNA的提取與逆轉(zhuǎn)錄反應
3.2.10 FIPV耐藥毒株全基因組PCR擴增與突變位點分析
4 結(jié)果分析
4.1 PEDV3CLpro的表達與純化
4.1.1 質(zhì)粒構(gòu)建
4.1.2 3CLpro的大量表達純化
4.2 抑制劑GC376對PEDV的抑制效果
4.2.1 抑制劑GC376對PEDV3CLpro的IC50
4.2.2 抑制劑GC376 在細胞培養(yǎng)中PEDV流行毒株的抑制效果
4.2.3 Western blot檢測GC376對PEDV的抑制效果
4.2.4 IFA法檢測GC376對PEDV的抑制效果
4.3 模擬PEDV3CLpro與抑制劑GC376 的結(jié)合模式
4.4 PEDV3CLpro的底物特異性
4.5 抑制劑GC376的優(yōu)化
4.6 確定FIPV藥物壓力下的傳代方法
4.7 50代FIPV的毒價與耐藥性變化
4.8 通過蝕斑純化法獲得耐藥性毒株
4.9 抑制劑GC376 對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.9.1 抑制劑GC376 細胞培養(yǎng)中對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.9.2 IFA法檢測GC376 對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.9.3 Western Blot檢測GC376 對野生型FIPV與耐藥毒株的抑制效果
4.10 耐藥性毒株突變位點的分析
5 討論
5.1 抑制劑GC376對PEDV的有效抑制作用
5.2 抑制劑GC376對其他冠狀病毒的抑制效果
5.3 關于抑制劑GC376的優(yōu)化方向
5.4 冠狀病毒對抑制劑GC376產(chǎn)生耐藥性的分子機制
5.5 抑制劑GC376作為新型冠狀病毒候選藥物的潛力
5.6 后續(xù)可開展的研究工作
6 結(jié)論
參考文獻
致謝
本文編號:3797459
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