本研究通過克隆香樟植物的1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶（DXS）基因,進行生物信息學分析,為香樟DXS基因的功能及其表達調控提供基礎。根據(jù)香樟轉錄組數(shù)據(jù)中注釋為DXS的核苷酸拼接序列,設計特異性引物,進行香樟DXS基因的克隆,應用熒光定量PCR方法分析DXS基因在香樟根、莖和葉中的表達量�？寺～@得香樟DXS基因,其c DNA序列長度為2 333 bp,開放讀碼閱讀框（ORF）為2 187 bp,編碼728個氨基酸,含有轉酮醇酶等3個保守結構域。香樟DXS蛋白定位于葉綠體,是一個不含信號肽、無跨膜結構域的親水性穩(wěn)定蛋白,且蛋白二級結構主要為α-螺旋和無規(guī)則卷曲。通過氨基酸序列同源性分析發(fā)現(xiàn),香樟DXS氨基酸序列與黃蘭和魚腥草的DXS氨基酸序列相似性較高,均為85%。分子進化樹結果表明,香樟DXS蛋白與黃蘭DXS蛋白親緣關系較近。組織特異性表達分析結果顯示,DXS在香樟葉與莖中的表達量高于根。成功克隆獲得香樟DXS基因,研究結果為進一步探討香樟DXS基因在萜類物質生物合成途徑中的作用提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

PCR擴增香樟DXS基因

CcDXS的ORF序列及其編碼蛋白質的氨基酸序列

香樟DXS三級結構建模

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3598357