擴(kuò)展蛋白（Expansins,EXP）是一類基因家族,幾乎參與了植物發(fā)育的全過程,從種子萌發(fā)到果實(shí)成熟都有擴(kuò)展蛋白的參與。該研究利用生物信息學(xué)的方法對小立碗蘚（Physcomitrella patens） Expansin基因家族成員進(jìn)行鑒定,分析了其基因結(jié)構(gòu)、染色體定位以及系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。結(jié)果表明:小立碗蘚基因組中含有Expansin A（EXPA） 32個、Expansin-like A（EXLA） 6個,并未發(fā)現(xiàn)Expansin-like B（EXLB）及Expansin B（EXPB）。擴(kuò)展蛋白氨基酸序列長度在228～290 aa之間,編碼蛋白質(zhì)具有兩個保守的結(jié)構(gòu)域Pollen_allerg₁和DPBB₁。蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果表明:運(yùn)用CELLO在線工具預(yù)測發(fā)現(xiàn)小立碗蘚中約4/5的EXP家族基因定位于細(xì)胞外;而Euk-mPLoc預(yù)測結(jié)果則顯示小立碗蘚EXP基因家族成員全定位于細(xì)胞外�；蚪Y(jié)構(gòu)分析表明,小立碗蘚中約68%Expansin基因有含有1～3個內(nèi)含子。以上結(jié)果可為深入研究小立碗蘚擴(kuò)展蛋白基因的分子進(jìn)化與生... 

【文章來源】：廣西植物. 2020,40(06)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

小立碗蘚Expansin基因保守基序及基因結(jié)構(gòu)分析

EXP基因在植物體的生長發(fā)育及逆境脅迫中具有重要的生理意義，已成為植物體基因功能研究熱點(diǎn)之一，但其在小立碗蘚中的基因功能尚不明確。本研究通過對已有數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)的分析，使用生物學(xué)信息的方法手段，篩選得到38個小立碗蘚擴(kuò)展蛋白基因家族成員，分析其蛋白特征、進(jìn)化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)及染色體定位等。從基因水平上展示小立碗蘚種屬的特征，為后續(xù)研究擴(kuò)展蛋白基因功能提供了理論依據(jù)。圖3 小立碗蘚和擬南芥Expansin基因系統(tǒng)進(jìn)化分析

小立碗蘚和擬南芥Expansin基因系統(tǒng)進(jìn)化分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]小立碗蘚MADS-box基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 易吉明,黃婷,黃勇,陳東紅.  植物生理學(xué)報(bào). 2015(02)
[2]楊樹擴(kuò)展蛋白基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 李昊陽,施楊,丁亞娜,徐吉臣.  北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(02)
[3]Expansin（細(xì)胞壁松弛蛋白）的發(fā)展[J]. 金慧清,陳英豪,金勇豐.  生命科學(xué). 2006(02)



本文編號：3595529