基于組學(xué)數(shù)據(jù)的藜麥油脂儲存蛋白的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-16 17:42
采用同源對比方法,從藜麥的基因組中挖掘油脂儲存蛋白序列,并利用生物信息學(xué)軟件和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對挖掘的基因蛋白序列的理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、進(jìn)化樹、組織表達(dá)情況等進(jìn)行了分析。在藜麥基因組中確定了15個(gè)基因與油脂儲存密切相關(guān)。15個(gè)油脂儲存基因分布在9條染色體上,其氨基酸數(shù)目為153~675個(gè),等電點(diǎn)為5.7~10.1。藜麥油脂儲存蛋白的二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。利用MEGA軟件進(jìn)行進(jìn)化樹分析,可將藜麥的油脂儲存蛋白分為6個(gè)分枝,且基因表達(dá)情況與分枝情況具有相似性。藜麥油脂儲存蛋白基因具有保守的理化特性,其表達(dá)具有組織特異性,且大多數(shù)成員在種子中的表達(dá)量顯著增加。
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,32(12)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
藜麥油脂儲存蛋白基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹
藜麥種子中油脂儲存蛋白基因的表達(dá)水平
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]混合鹽堿脅迫對藜麥苗期植株及根系生長特征的影響[J]. 修妤,梁曉艷,石瑞常,顧寅鈺,郭光,王向譽(yù). 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(04)
[2]藜麥在化妝品中的應(yīng)用前景[J]. 何海芬,朱統(tǒng)臣,林飛武. 廣東化工. 2018(02)
[3]60份國內(nèi)外藜麥材料子粒的品質(zhì)性狀分析[J]. 石振興,楊修仕,么楊,任貴興. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]大豆油脂儲存蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 王巍杰,吳丹,王金朋. 大豆科學(xué). 2016(02)
[5]中國藜麥產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀[J]. 任貴興,楊修仕,么楊. 作物雜志. 2015(05)
本文編號:3499284
【文章來源】:江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,32(12)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
藜麥油脂儲存蛋白基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹
藜麥種子中油脂儲存蛋白基因的表達(dá)水平
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]混合鹽堿脅迫對藜麥苗期植株及根系生長特征的影響[J]. 修妤,梁曉艷,石瑞常,顧寅鈺,郭光,王向譽(yù). 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020(04)
[2]藜麥在化妝品中的應(yīng)用前景[J]. 何海芬,朱統(tǒng)臣,林飛武. 廣東化工. 2018(02)
[3]60份國內(nèi)外藜麥材料子粒的品質(zhì)性狀分析[J]. 石振興,楊修仕,么楊,任貴興. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]大豆油脂儲存蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 王巍杰,吳丹,王金朋. 大豆科學(xué). 2016(02)
[5]中國藜麥產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀[J]. 任貴興,楊修仕,么楊. 作物雜志. 2015(05)
本文編號:3499284
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