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定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示hfq2在嗜水氣單胞菌多效生理功能中的重要作用

發(fā)布時(shí)間:2021-11-05 04:54
  Hfq蛋白是一種進(jìn)化上高度保守的sRNA分子伴侶蛋白,可在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控RNA翻譯并在細(xì)菌生理功能調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用。大多數(shù)細(xì)菌基因組只有一個(gè)hfq拷貝,然而少數(shù)細(xì)菌在其染色體上含有兩個(gè)甚至多個(gè)hfq拷貝。目前對(duì)Hfq蛋白的分子機(jī)制理論大多是建立在常見(jiàn)的Hfq蛋白(Hfq1)上,而Hfq2蛋白由于在大腸桿菌等模式生物中不存在,其聚體形成模式與功能的研究較為缺乏。據(jù)以往報(bào)道,不同細(xì)菌不同hfq拷貝的生理功能具有多樣性,且與Hfq1相比Hfq2的同源性具有較大差異,這提示Hfq2蛋白的功能與調(diào)控機(jī)制在不同微生物中可能會(huì)有所不同,其作用在很大程度上仍然不清楚,有待進(jìn)一步的研究。本實(shí)驗(yàn)室前期對(duì)嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)ATCC 7966(NC008570.1)的全基因組分析發(fā)現(xiàn)該菌基因組中含有兩個(gè)hfq拷貝,一個(gè)是常見(jiàn)的hfq,其基因名是AHA0924,與大多數(shù)細(xì)菌Hfq有著較高的同源性,其生物學(xué)功能研究較為清楚;另一個(gè)hfq拷貝,本文將其簡(jiǎn)稱(chēng)為hfq2,其基因名是AHA3797,是一個(gè)含有121個(gè)... 

【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示hfq2在嗜水氣單胞菌多效生理功能中的重要作用


模式菌株大腸桿菌Hfq蛋白的結(jié)構(gòu)示意圖

轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),基因表達(dá)抑制,核糖核酸,核糖體結(jié)合位點(diǎn)


圖 1-2 Hfq 在 sRNA 介導(dǎo)中的作用[8]Fig 1-2 The role of Hfq in sRNA mediated新的研究已將 Hfq 在 sRNA 介導(dǎo)中的作用機(jī)制具體到某些特定基因菌的 csgD 基因,如圖 1-3 所示。csgD 是 sRNAs 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的降解依賴(lài)于 hfq。在 Hfq 的協(xié)助下,OmrA、OmrB、McaS、RprA、G 和 RybB 等 sRNA 對(duì)轉(zhuǎn)錄因子 csgD 的表達(dá)具有負(fù)作用。通常情況下點(diǎn)或者裂解位點(diǎn)上的 sRNAs、Hfq 和核糖核酸酶 E(RNase E)位csgD mRNA 上。McaS,RprA,GcvB 和 OmrA / B 蛋白都有與核糖端配對(duì)的堿基對(duì)。當(dāng) OmrA 和 OmrB 引起翻譯抑制時(shí),McaS、R 誘導(dǎo) mRNA 的核糖核酸裂解,當(dāng)結(jié)合在 Hfq 結(jié)合位點(diǎn)上游 5'-末端附抑制 RNase E 裂解、并且減輕由 McaS 誘導(dǎo)的 csgD 基因表達(dá)抑制。bB 通過(guò)在核糖體結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合 CsgD 來(lái)抑制翻譯起始復(fù)合物的形成制起始核糖體進(jìn)入的目的。在某些情況下,與 csgD 結(jié)合的 sRNA

順式,反義,發(fā)生作用,細(xì)菌


圖 1-3 sRNA 介導(dǎo)的 CsyD 與 Hfq 調(diào)控模型[30]Fig 1-3 Model for sRNA-mediated regulation of CsgD and H sRNA-asRNA 的相互配對(duì)過(guò)程中的作用 sRNA 發(fā)生作用外,還會(huì)與順式反義 RNA(natura作。30 多年前第一次在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn) asRNA,asRNA


本文編號(hào):3477116

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