MORC基因家族的鑒定及其在綠色植物中的進化研究
發(fā)布時間:2021-07-21 21:14
MORC(Microrchidia)基因是一類高度保守的核蛋白編碼基因,它作為一種新型的表觀調(diào)控因子,參與了植物轉(zhuǎn)錄水平的基因沉默和免疫防御調(diào)控過程。通常,MORC蛋白的N端含有一個保守的GHKL-type(Gyrase,Hsp90,Histidine kinase,MutL)ATPase模塊,它能夠影響基因的表達調(diào)控過程。目前,MORC蛋白在動物和植物中均已鑒定出,其中在人類和擬南芥中分別鑒定出了4個和7個典型的MORC家族成員。為了深入探究MORC基因家族的系統(tǒng)演化過程,本研究利用生物信息學(xué)和系統(tǒng)發(fā)生學(xué)等手段對動植物中MORC基因家族的進化歷史、分類關(guān)系和MORC蛋白的序列特征等進行了全面的研究。本研究從27和60個代表性動物和植物的基因組中分別鑒定出了83和356個MORC蛋白的候選基因。同時,基于轉(zhuǎn)錄組的蛋白序列信息,還從56個非開花植物中鑒定出了154個候選MORC蛋白序列。對這些MORC蛋白序列進行保守motif的分析發(fā)現(xiàn),MORC蛋白的N端含有一段連續(xù)的保守motif組成,將其定義為MORC結(jié)構(gòu)域。MORC結(jié)構(gòu)域的序列保守,含有一些典型的蛋白序列二級結(jié)構(gòu)元件,可以作為MO...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
部分物種中M之刀之C基因的系統(tǒng)發(fā)育樹和保守切
圖3-4?MORC?
過大片段復(fù)制或全基因組復(fù)制的方式產(chǎn)生拷貝數(shù)的加倍,可以看出相對于近期發(fā)??生的復(fù)制事件,那些發(fā)生在較為古老的Y事件中的物種之間的共線性關(guān)系則顯得??相對較差(見圖3-7),表明它們在長期的進化過程中發(fā)生了一定的分化。同時,??在單子葉植物Group?II-c分支中基因大多都有兩個及以上拷貝,表明??基因在單子葉植物中也發(fā)生了一定的擴增,甚至可能經(jīng)歷了一次禾本科近??期發(fā)生的全基因組復(fù)制p事件。??24??
本文編號:3295789
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
部分物種中M之刀之C基因的系統(tǒng)發(fā)育樹和保守切
圖3-4?MORC?
過大片段復(fù)制或全基因組復(fù)制的方式產(chǎn)生拷貝數(shù)的加倍,可以看出相對于近期發(fā)??生的復(fù)制事件,那些發(fā)生在較為古老的Y事件中的物種之間的共線性關(guān)系則顯得??相對較差(見圖3-7),表明它們在長期的進化過程中發(fā)生了一定的分化。同時,??在單子葉植物Group?II-c分支中基因大多都有兩個及以上拷貝,表明??基因在單子葉植物中也發(fā)生了一定的擴增,甚至可能經(jīng)歷了一次禾本科近??期發(fā)生的全基因組復(fù)制p事件。??24??
本文編號:3295789
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