半滑舌鰨補體凝集素途徑基因MASP1、MASP2和CL-11的鑒定、表達和功能分析
發(fā)布時間:2021-07-13 06:07
本研究以半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)的甘露糖結(jié)合凝集素相關絲氨酸蛋白酶MASP1基因(CsMASP1)、甘露糖結(jié)合凝集素相關絲氨酸蛋白酶MASP2基因(CsMASP2)和膠原凝集素Collectin 11基因(CsCL-11)為研究對象,通過基因克隆,基因表達分析,原核表達及重組蛋白抑菌功能的驗證等,獲得以下結(jié)果:CsMASP1基因的cDNA全長2507 bp,5′非編碼區(qū)長82 bp,3′非編碼區(qū)長142 bp,開放閱讀框長2283 bp,共編碼760個氨基酸。預測其分子量為84.95 kDa,理論等電點(pI)為5.33。SMART結(jié)構(gòu)域預測分析得知CsMASP1蛋白含有6個結(jié)構(gòu)域:分別是2個類Clr/Cls蛋白結(jié)構(gòu)域(like Clr/Cls Protein domain,CUB)(47-168aa,215-327aa),1個表皮細胞生長因子樣結(jié)構(gòu)域(calcium-binding epidermal growth factor-like domain,EGF-CA)(169-212aa),2個補體控制蛋白區(qū)結(jié)構(gòu)域(complement control...
【文章來源】:青島大學山東省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
半滑舌鰨MASP1cDNA序列和推測的氨基酸序列
青島大學碩士學位論文氨基酸序列顯示在核苷酸序列下方,用大寫字母表示。方框所示為起始密碼子 (ATG)、為終止密碼子 TGA;實線所示為 CUB 結(jié)構(gòu)域;圓點線所示為 EGF-CA 結(jié)構(gòu)域;短劃線CP 結(jié)構(gòu)域;雙劃線所示為 Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域;波浪線所示為 polyA 結(jié)構(gòu)ted amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. The iniaand termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB domain in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in dashed lPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.
Translated amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. Thcodon and termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB doshown in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in daTryp-SPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.圖 1.2 半滑舌鰨 MASP1 蛋白結(jié)構(gòu)域預測Fig 1.2 Domain structure prediction of C. semilaevis MASP1SMART 軟件在線預測 CsMASP1 蛋白的結(jié)構(gòu)域,CsMASP1 包含 6 個結(jié)構(gòu)域,從 C 端到 是 CUB 結(jié)構(gòu)域 (47-168aa), EGF-CA 結(jié)構(gòu)域 (169-212aa), CUB 結(jié)構(gòu)域 (215-327aa), CCP(331-392aa), CCP 結(jié)構(gòu)域 (397-461aa), Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域 (478-752aa).SMART software predicts the domain of CsMASP1 protein online. CsMASP1 contains six domadomain (47-168aa), EGF-CA domain (169-212aa), CUB domain (215-327aa), CCP domain (33CCP domain (397-461aa), Tryp-SPc domain (478-752aa).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]半滑舌鰨外周血T淋巴細胞的分離、鑒定及TCRβ基因免疫應答分析[J]. 汪林慶,王航,陳亞東,楊光,白莉,孫璐明,沙珍霞. 水生生物學報. 2018(03)
[2]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關絲氨酸蛋白酶3的研究現(xiàn)狀[J]. 魏敏,邢國蘭. 中國免疫學雜志. 2018(02)
[3]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)c-Jun基因的克隆及免疫應答分析[J]. 于孟君,孫璐明,陳亞東,陳學杰,楊光,劉洋,仇雪梅,沙珍霞. 漁業(yè)科學進展. 2017(02)
[4]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關蛋白19(MAp19)的研究現(xiàn)狀[J]. 李婷,李萍. 中國免疫學雜志. 2016(07)
[5]甘露聚糖結(jié)合凝集素的研究進展[J]. 張喆. 山東化工. 2016(03)
[6]半滑舌鰨TRAF6基因和TAK1基因的克隆及表達分析[J]. 陳燕,樊琳,劉田田,劉躍中,李贊,張全啟. 中國水產(chǎn)科學. 2015(05)
[7]斑點叉尾TLR20和TLR21基因在不同細菌和病毒感染后的表達特征[J]. 路飏,王啟龍,李敏,陳松林,沙珍霞. 漁業(yè)科學進展. 2013(06)
[8]甘露糖結(jié)合凝集素相關的絲氨酸蛋白酶2研究進展[J]. 王新菊,鞠志花,王長法,李國榮. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(03)
[9]甲狀腺腫瘤患者血清中MBL和MASP-2的表達及意義[J]. 石燕萍,劉閣玲,張慧芹,俞芳,項岫秀,路一芳. 廣東醫(yī)學. 2012(02)
[10]甘露聚糖結(jié)合凝集素的絲氨酸蛋白酶結(jié)合位點初步研究[J]. 蔡學敏,趙娜,左大明,張麗蕓,陳政良. 現(xiàn)代免疫學. 2009(03)
博士論文
[1]文昌魚體液和魚類血清補體溶血系統(tǒng)比較研究[D]. 王長法.中國海洋大學 2003
碩士論文
[1]半滑舌鰨腸道微生物及C9基因在免疫反應中的應答特征[D]. 汪林慶.福州大學 2017
[2]半滑舌鰨補體調(diào)控因子I的鑒定、重組表達、功能分析及C3-1基因的初步研究[D]. 向晉松.上海海洋大學 2015
本文編號:3281507
【文章來源】:青島大學山東省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
半滑舌鰨MASP1cDNA序列和推測的氨基酸序列
青島大學碩士學位論文氨基酸序列顯示在核苷酸序列下方,用大寫字母表示。方框所示為起始密碼子 (ATG)、為終止密碼子 TGA;實線所示為 CUB 結(jié)構(gòu)域;圓點線所示為 EGF-CA 結(jié)構(gòu)域;短劃線CP 結(jié)構(gòu)域;雙劃線所示為 Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域;波浪線所示為 polyA 結(jié)構(gòu)ted amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. The iniaand termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB domain in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in dashed lPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.
Translated amino acid sequence was shown under the nucleotide sequence as uppercase. Thcodon and termination codon were marked by a box and an asterisk, respectively; CUB doshown in solid line; EGF-CA domain was shown in dot line; CCP domain was shown in daTryp-SPc domain was shown in double solid line; polyAwas shown in wavy line.圖 1.2 半滑舌鰨 MASP1 蛋白結(jié)構(gòu)域預測Fig 1.2 Domain structure prediction of C. semilaevis MASP1SMART 軟件在線預測 CsMASP1 蛋白的結(jié)構(gòu)域,CsMASP1 包含 6 個結(jié)構(gòu)域,從 C 端到 是 CUB 結(jié)構(gòu)域 (47-168aa), EGF-CA 結(jié)構(gòu)域 (169-212aa), CUB 結(jié)構(gòu)域 (215-327aa), CCP(331-392aa), CCP 結(jié)構(gòu)域 (397-461aa), Tryp-SPc 結(jié)構(gòu)域 (478-752aa).SMART software predicts the domain of CsMASP1 protein online. CsMASP1 contains six domadomain (47-168aa), EGF-CA domain (169-212aa), CUB domain (215-327aa), CCP domain (33CCP domain (397-461aa), Tryp-SPc domain (478-752aa).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]半滑舌鰨外周血T淋巴細胞的分離、鑒定及TCRβ基因免疫應答分析[J]. 汪林慶,王航,陳亞東,楊光,白莉,孫璐明,沙珍霞. 水生生物學報. 2018(03)
[2]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關絲氨酸蛋白酶3的研究現(xiàn)狀[J]. 魏敏,邢國蘭. 中國免疫學雜志. 2018(02)
[3]半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)c-Jun基因的克隆及免疫應答分析[J]. 于孟君,孫璐明,陳亞東,陳學杰,楊光,劉洋,仇雪梅,沙珍霞. 漁業(yè)科學進展. 2017(02)
[4]甘露聚糖結(jié)合凝集素相關蛋白19(MAp19)的研究現(xiàn)狀[J]. 李婷,李萍. 中國免疫學雜志. 2016(07)
[5]甘露聚糖結(jié)合凝集素的研究進展[J]. 張喆. 山東化工. 2016(03)
[6]半滑舌鰨TRAF6基因和TAK1基因的克隆及表達分析[J]. 陳燕,樊琳,劉田田,劉躍中,李贊,張全啟. 中國水產(chǎn)科學. 2015(05)
[7]斑點叉尾TLR20和TLR21基因在不同細菌和病毒感染后的表達特征[J]. 路飏,王啟龍,李敏,陳松林,沙珍霞. 漁業(yè)科學進展. 2013(06)
[8]甘露糖結(jié)合凝集素相關的絲氨酸蛋白酶2研究進展[J]. 王新菊,鞠志花,王長法,李國榮. 中國畜牧獸醫(yī). 2012(03)
[9]甲狀腺腫瘤患者血清中MBL和MASP-2的表達及意義[J]. 石燕萍,劉閣玲,張慧芹,俞芳,項岫秀,路一芳. 廣東醫(yī)學. 2012(02)
[10]甘露聚糖結(jié)合凝集素的絲氨酸蛋白酶結(jié)合位點初步研究[J]. 蔡學敏,趙娜,左大明,張麗蕓,陳政良. 現(xiàn)代免疫學. 2009(03)
博士論文
[1]文昌魚體液和魚類血清補體溶血系統(tǒng)比較研究[D]. 王長法.中國海洋大學 2003
碩士論文
[1]半滑舌鰨腸道微生物及C9基因在免疫反應中的應答特征[D]. 汪林慶.福州大學 2017
[2]半滑舌鰨補體調(diào)控因子I的鑒定、重組表達、功能分析及C3-1基因的初步研究[D]. 向晉松.上海海洋大學 2015
本文編號:3281507
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