發(fā)布時(shí)間：2021-04-10 06:17

　　鬼針草（Bidens bipinnata L.）是一種典型的Cd超富集植物,對(duì)Cd具有很強(qiáng)的富集能力,并且其還是一種重要的藥用植物,藥用歷史悠遠(yuǎn),功效甚多。但因生存環(huán)境的差異使其在形態(tài)上產(chǎn)生諸多變異。屬內(nèi)不同種類(lèi)鬼針草之間單從外形上很難區(qū)分,嚴(yán)重影響幾類(lèi)主要藥用鬼針草屬植物的用藥安全。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,比較鎘誘導(dǎo)與正常條件下地下根部組織轉(zhuǎn)錄組的基因表達(dá)差異。同時(shí)基于轉(zhuǎn)錄組,利用轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù),進(jìn)行開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)單重復(fù)序列（simple sequence repeat,SSR）標(biāo)記,從而用于區(qū)分鬼針草屬的不同植物,對(duì)解決鬼針草屬植物難以區(qū)分的問(wèn)題具有指導(dǎo)意義。本研究利用IlluminaHiSeq TM 2000高通量測(cè)序平臺(tái),對(duì)鎘脅迫條件下鬼針草的根部組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。利用Trinity軟件對(duì)鬼針草轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行組裝,共得到120 122條unigenes。將其與GO（Gene Ontology）、KO（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Ontology）、KOG（lusters of Karyotic Orthologous Groups）、NR（R... 

【文章來(lái)源】：沈陽(yáng)師范大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：54 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

文庫(kù)構(gòu)建原理

圖 2 信息分析流程圖Figure 2 Flow chart of information analysis針對(duì)混合 RNA 樣品中的每一種構(gòu)建 cDNA 文庫(kù)后，并在 Illumina HiSeq TM 2000

七大數(shù)據(jù)庫(kù)的注釋圖


本文編號(hào)：3129123